Mutation und Rekombination während der chronischen Kolonisation mit Helicobacter pylori

幽门螺杆菌慢性定植过程中的突变和重组

• 批准号: 5419535
• 负责人: Professor Dr. Mark Achtman
• 金额: --
• 依托单位: Max-von-Pettenkofer-Institut für Hygiene und Medizinische Mikrobiologie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2003-12-31 至 2009-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5419535?language=en
• 关键词: Mutation; und; Rekombination; hrend; der

Die Adaptation von Helicobacter pylori an den humanen Wirt soll in einem populationsgenetischen Kontext durch Quantifizierung genetischer und phänotypischer Veränderungen während der chronischen Kolonisation von Individuen und nach der Transmission in Familien untersucht werden. Für Paare von Stämmen, die entweder sequentiell von einem Patienten oder von Familienmitgliedern isoliert wurden, werden wir die Häufigkeit von Mutation und Rekombination sowie die Größe der importierten DNA-Fragmente unter Einsatz von Hochdurchsatzverfahren bestimmen. Mit Hilfe von WAVE-Analyse und Sequenzierung sollen Sequenzpolymorphismen in drei Gruppen von Genen identifiziert werden: "Housekeeping-Gene", die für Stoffwechselenzyme und die Transkriptions-/Translationsmaschinerie kodieren, hypothetische Gene und Gene der hop/hor/hof-Familie, die für Außenmembranproteine kodieren und wahrscheinlich unter Selektionsdruck stehen. Die funktionelle Bedeutung von Veränderungen in hop/hor/hofGenen für die Bindungsspezifität von H. pylori soll außerdem durch Adhärenzstudien an Gewebsschnitten charakterisiert werden. Die Sequenzvariation in "Housekeeping-Genen" und Genen für hypothetische Proteine wird die Bestimmung der neutralen Variationsrate für kodierende Sequenzen ermöglichen. Durch Vergleich mit Genen unter Selektion werden wir quantitative Aussagen über die Selektionsprozesse während der Adaptation von H. pylori an den einzelnen Wirtsorganismus machen können.

通过遗传学定量和表型分析，探讨幽门螺杆菌与人类维尔特适应性在个体遗传学中的关系，并探讨其在韦尔登中的传播。对于Stämmen患者，在随后的患者或家庭隔离中，韦尔登我们将通过突变和重组的方法来确定在Hochdurchsatzverfahren检测中输入的DNA片段的数量。Mit Hilfe von Wave-Analyse und Sequenzierung sollen Sequenzpolymorphismen in drei Gruppen von Genen identifiziert韦尔登：“管家基因”，die für Stoffwechselenzyme und die Transkriptions-/Translationsmaschinerie kodieren，hypertische Gene und Gene der hop/hor/hof-Familie，die für Außenmembrane proteine kodieren und wahrscheinlich unter Selektionsdruck stehen. Die funktionelle Bedeutung von Veränderungen in hop/hor/hofGenen für die Bindungsspezifität von H. pylori soll außerdem durch Adhärenzstudien an Gewebsschnitten charakterisiert韦尔登.“Housekeeping-Genen”和Genen für hypertische Proteine中的测序变异将用于确定中性变异率。本文采用遗传选择韦尔登对H.幽门螺旋杆菌和一种被感染的微生物。