Faltung von RNA - Das Hairpin Ribozym als Modellsystem

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RNA Moleküle müssen eine spezifische dreidimensionale Struktur einnehmen, um ihre diversen biologischen Funktionen zu erfüllen. Im Gegensatz zur Proteinfaltung ist die Faltung von RNA ein bemerkenswert langsamer Prozess. Der Ursprung dieser langsamen Faltung ist nicht bekannt und ein Problem mit signifikantem, aktuellen Interesse. Das Hairpin Ribozym ist eine kleine katalytische RNA, die die langsame Faltungskinetik großer RNA Moleküle aufweist. Aufgrund seiner kleinen Größe und der Existenz von hochaufgelösten Strukturinformationen stellt das Hairpin Ribozym ein exzellentes Modellsystem für detaillierte biophysikalische Studien der RNA-Faltung dar. In diesem Forschungsvorhaben wird die Faltungskinetik des Hairpin Ribozyms mittels Ensemble- und Einzelmolekül-Fluoreszenz Resonanz Energietransfer (FRET) Methoden analysiert. Eine Reihe von Modifikationen wird in das Ribozym eingefügt, um spezifische Hypothesen über den Faltungsprozess zu testen. Die Ergebnisse werden zu einem detaillierten Faltungsmechanismus des Hairpin Ribozyms führen und zu einem besseren Verständnis der generellen Prinzipien der RNA Faltung beitragen.