课题基金 / 基金详情

阻害剤開発の基盤構築を目指した薬剤排出トランスポーターのX線結晶構造解析

阻害剤開発の基盤構築を目指した薬剤排出トランスポーターのX線結晶構造解析
药物外排转运蛋白的X射线晶体结构分析旨在为抑制剂的开发奠定基础
批准号:
14J01576
负责人:
林 克彦
金额:
$2.05万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2014
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2014-04-25 至 2017-03-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
多剤耐性菌感染症の克服に向け、菌の薬剤耐性獲得および菌の毒性発現に関与する薬剤排出トランスポーターの阻害剤開発を目指し、以下の3つの課題に取組んだ。(1.緑膿菌RND型トランスポーターMexYの構造解析 2.大腸菌多剤排出システムAcrAB-TolC複合体の結晶構造解析 3.マクロライド系抗生物質排出ABCトランスポーター MacBの結晶構造解析)平成28年度は目標に対し次の事が明らかとなった。1.MexY結晶を用いて大型放射光施設SPring 8で得たX線回折データから分子置換法で位相決定し、MexY構造を新たに決定することに成功した。しかしながら、この構造は薬剤認識・排出機能の議論をすることが難しいMexY単量体構造であった。そこで、より強固な三量体を構成するMexY変異体を作製し、このMexY変異体の薬剤耐性能および排出機能を保持することを確かめた。現在は、この変異体MexYの結晶化に取り組んでいる。2.前年度までにリンカー配列を最適化した1:1構成比のAcrB-AcrA融合たんぱく質を用いた発現量活性相関から、融合たんぱく質がそれ単体で排出活性を有することを確かめた。AcrBとTolCの間では、システイン残基を適当な場所に導入すると生理的条件で直にジスルフィド架橋を形成する。AcrB-AcrA融合蛋白質でも同様に架橋が形成されることを確かめ、親和性タグでの精製を最適化し、架橋を持ったAcrAB-TolC複合体の精製法を確立した。精製した複合体をネガティブ染色と透過型電子顕微鏡により観察すると、大きさの揃った粒子が観測された。この三者複合体の構造決定を単粒子像再構成により目指している。3.MacBの発現系を見直し、コムギ無細胞発現システムにより全長MacBを発現させた。リポソームに発現したMacBを用いて結晶化条件探索をしたが、結晶は得られていない。精製法、結晶化条件の検討を続け、構造解析可能な結晶の調製を目指す。
英文摘要
多剤耐性菌感染症の克服に向け、菌の薬剤耐性獲得および菌の毒性発現に関与する薬剤排出トランスポーターの阻害剤開発を目指し、以下の3つの課題に取組んだ。(1.緑膿菌RND型トランスポーターMexYの構造解析 2.大腸菌多剤排出システムAcrAB-TolC複合体の結晶構造解析 3.マクロライド系抗生物質排出ABCトランスポーター MacBの結晶構造解析)平成28年度は目標に対し次の事が明らかとなった。1.MexY結晶を用いて大型放射光施設SPring 8で得たX線回折データから分子置換法で位相決定し、MexY構造を新たに決定することに成功した。しかしながら、この構造は薬剤認識・排出機能の議論をすることが難しいMexY単量体構造であった。そこで、より強固な三量体を構成するMexY変異体を作製し、このMexY変異体の薬剤耐性能および排出機能を保持することを確かめた。現在は、この変異体MexYの結晶化に取り組んでいる。2.前年度までにリンカー配列を最適化した1:1構成比のAcrB-AcrA融合たんぱく質を用いた発現量活性相関から、融合たんぱく質がそれ単体で排出活性を有することを確かめた。AcrBとTolCの間では、システイン残基を適当な場所に導入すると生理的条件で直にジスルフィド架橋を形成する。AcrB-AcrA融合蛋白質でも同様に架橋が形成されることを確かめ、親和性タグでの精製を最適化し、架橋を持ったAcrAB-TolC複合体の精製法を確立した。精製した複合体をネガティブ染色と透過型電子顕微鏡により観察すると、大きさの揃った粒子が観測された。この三者複合体の構造決定を単粒子像再構成により目指している。3.MacBの発現系を見直し、コムギ無細胞発現システムにより全長MacBを発現させた。リポソームに発現したMacBを用いて結晶化条件探索をしたが、結晶は得られていない。精製法、結晶化条件の検討を続け、構造解析可能な結晶の調製を目指す。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.3389/fmicb.2014.00180
发表时间: 2014
期刊: Frontiers in microbiology
影响因子: 5.2
作者: [Hayashi K, Fukushima A, Hayashi-Nishino M, Nishino K]
通讯作者: Nishino K
in vitro Reconstruction of Functional AcrAB-TolC Multidrug Efflux System
功能性 AcrAB-TolC 多药外排系统的体外重建
DOI: --
发表时间: 2014
期刊:
影响因子: --
作者: [富永健太, 飯村太紀, 植村充典, 平井宏明, 宮崎文夫, Katsuhiko Hayashi]
通讯作者: Katsuhiko Hayashi
グラム陰性菌多剤排出トランスポーターの阻害剤結合構造
革兰氏阴性细菌多药外排转运蛋白的抑制剂结合结构
DOI: --
发表时间: 2014
期刊:
影响因子: --
作者: [林克彦, 中島良介, 櫻井啓介, 山崎聖司, 西野邦彦, 山口明人]
通讯作者: 山口明人
DOI: 10.1128/jb.00587-15
发表时间: 2016-01-01
期刊: JOURNAL OF BACTERIOLOGY
影响因子: 3.2
作者: [Hayashi, Katsuhiko, Nakashima, Ryosuke, Yamaguchi, Akihito]
通讯作者: Yamaguchi, Akihito
共 10 条
    末梢血単核球の発熱性物質認識及び炎症反応の個人差要因の特定
    • 批准号:
      24K18284
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
    • 资助金额:
      $3.08万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      林 克彦
    • 依托单位:
    記号のランダムベクトル化に基づく大規模マルチラベル深層学習法
    • 批准号:
      24K02993
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.56万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      林 克彦
    • 依托单位:
    異形配偶子の性差を規定するゲノムネットワークの解明
    • 批准号:
      24H00059
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
    • 资助金额:
      $130.62万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      林 克彦
    • 依托单位:
    Next-generation ART: Building a global network to create innovative technologies in m ammalian reproductive engineering
    • 批准号:
      23K20043
    • 项目类别:
      Fund for the Promotion of Joint International Research (International Leading Research )
    • 资助金额:
      $440.96万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      林 克彦
    • 依托单位:
    海外基金