Improvement of sequence specificity of DNA-binding protein using computational and experimental approaches

使用计算和实验方法改进 DNA 结合蛋白的序列特异性

• 批准号: 26330339
• 负责人: KONO HIDETOSHI
• 金额: $ 3万
• 依托单位: National Institutes for Quantum and Radiological Science and Technology (2016)Japan Atomic Energy Agency (2014-2015)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2014
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2014-04-01 至 2017-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26330339/
• 关键词: DNA結合蛋白質; 分子シミュレーション; 生体生命情報学; バイオインフォマティクス; 蛋白質設計; B1H; タンパク質設計; DNA結合; 配列特異性; モデリング; DNA結合タンパク質; デザイン; 分子設計

项目成果

転写因子のアクティビィティは結合サイト及びその周辺領域のDNA特性の関係できまる

转录因子的活性由结合位点和周围区域的DNA特性之间的关系决定。

• 发表时间: 2016
• 作者: 河野秀俊

Designing a new artificial transcription factor based on engrailed homeodomain

基于engrailed同源域设计新的人工转录因子

• 发表时间: 2015
• 作者: 角南智子;河野秀俊
• 通讯作者: 河野秀俊

Genome-wide transcription factor activities are explained by intrinsic conformational dynamics of binding-sites and distal flanking-regions

• DOI: 10.1101/020602
• 发表时间: 2015-06
• 期刊: bioRxiv
• 作者: Munazah Andrabi;A. Hutchins;Diego Miranda-Saavedra;H. Kono;R. Nussinov;K. Mizuguchi;Shandar Ahmad

Revisiting DNA conformations in crystal structures

重新审视晶体结构中的 DNA 构象

• 发表时间: 2016
• 作者: Sunami;T.; Chatake;T.; Kono;H.
• 通讯作者: H.

エングレイルドホメオドメインを用いた新規転写因子設計

使用 engrailed 同源域设计新型转录因子

• 发表时间: 2016
• 作者: Li Tang;Jianhua Ma;Runhe Huang;Bernady O. Apduhan;He Li;Shaoyin Cheng;藤村 考;角南智子; 河野秀俊
• 通讯作者: 角南智子; 河野秀俊