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新規Rieske型酸素添加酵素の探索と機能解析

新規Rieske型酸素添加酵素の探索と機能解析
新型Rieske型加氧酶的搜索和功能分析
批准号:
15F15089
负责人:
野尻 秀昭
金额:
$1.47万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2015
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2015-04-24 至 2017-03-31

项目摘要

项目成果

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平成27年度末までに、高熱性細菌のゲノム情報から、Rieske型芳香環ジオキシゲナーゼ(RO)の末端水酸化酵素コンポーネント大サブユニット遺伝子(合計44種)を見いだし、その中で特に重要と考えられたThermus oshimai JL-2株とGeobacillus thermoglucosidasius NBRC107763株由来の二種について小サブユニット遺伝子と共に発現用ベクターにクローン化して、大腸菌での発現系を構築していた。また、JL-2株ゲノムからは2種のフェレドキシン遺伝子と4種のフェレドキシン還元酵素遺伝子の候補を、NBRC107763株ゲノムからは1種のフェレドキシン遺伝子と3種のフェレドキシン還元酵素遺伝子の候補を発見し、クローン化を開始していた。平成28年度は、これに引き続き、クローン化を終了させ、大腸菌細胞内においてROの各コンポーネント候補を種々の組み合わせで発現させる系を構築した。現在までにSDS-PAGE解析にて明瞭なタンパク質の発現は検出できていないが、微量でも活性が検出できる場合も多いため、本プロジェクトの遂行者であるChakrabortyらにより構築されたデータベースを用いて、まず基質の推定を行った。その結果、多環芳香族炭化水素、ヘテロ環式芳香族化合物、安息香酸誘導体などが基質として推定され、活性検出に使用する基質候補を絞り込むことができた。現在、これらの推定基質に対する酸素添加活性を評価するとともに、両株ゲノム中の当該遺伝子の破壊を試みている。なお、本年度の重要な成果の一つとして、ゲノム解析とROコンポーネント候補の抽出・機能推定に関しては、アメリカ微生物学会と極限微生物の国際学会で発表するとともに、既にAMB Express誌で発表した。
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会议论文
Exploring Microbial Genomes in Search of Novel Rieske Oxygenase Guided by Evolutionary Studies
在进化研究的指导下探索微生物基因组以寻找新型 Rieske 氧化酶
DOI: --
发表时间: 2016
期刊:
影响因子: --
作者: [Joydeep Chakraborty, Chiho Suzuki-Minakuchi, Kazunori Okada, Tapan K. Dutta, Hideaki Nojiri]
通讯作者: Hideaki Nojiri
Reconstitution and Characterization of Novel Rieske Oxygenase System from Thermophiles
嗜热菌新型 Rieske 氧化酶系统的重建和表征
DOI: --
发表时间: 2016
期刊:
影响因子: --
作者: [Joydeep Chakraborty, Chiho Suzuki-Minakuchi, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri]
通讯作者: Hideaki Nojiri
Exploring Microbial Genomes in Search of Novel Rieske Oxygenase
探索微生物基因组以寻找新型 Rieske 氧化酶
DOI: --
发表时间: 2016
期刊:
影响因子: --
作者: [Joydeep CHAKRABORTY, Chiho SUZUKI-MINAKUCHI, Kazunori OKADA, Hideaki NOJIRI]
通讯作者: Hideaki NOJIRI
接合伝達で獲得したプラスミドへの細菌細胞の初期適応過程の解明
  • 批准号:
    24H00497
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 资助金额:
    $30.62万
  • 财政年份:
    2024
  • 负责人:
    野尻 秀昭
  • 依托单位:
プラスミド機能の発現を支配する染色体間相互作用形成の鍵因子の機能解明
  • 批准号:
    08F08101
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $1.02万
  • 财政年份:
    2008
  • 负责人:
    野尻 秀昭
  • 依托单位:
植物・微生物機能の融合による疎水性有機物汚染の新規浄化法の提案
  • 批准号:
    17658150
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 资助金额:
    $2.24万
  • 财政年份:
    2005
  • 负责人:
    野尻 秀昭
  • 依托单位:
国内基金
海外基金
Galaxy Analytical Modeling Evolution (GAME) and cosmological hydrodynamic simulations.
  • 批准号:
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    10.0万元
  • 批准年份:
    2025
  • 负责人:
    Antonios Katsianis
  • 依托单位:
镍基UNS N10003合金辐照位错环演化机制及其对力学性能的影响研究
Understanding structural evolution of galaxies with machine learning
  • 批准号:
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    10.0万元
  • 批准年份:
    2022
  • 负责人:
    Nicola Rosario Napolitano
  • 依托单位:
发展/减排路径(SSPs/RCPs)下中国未来人口迁移与集聚时空演变及其影响
  • 批准号:
    19ZR1415200
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2019
  • 负责人:
    夏海斌
  • 依托单位: