Signalstrukturen der enteroviralen Replikation und Translation: Interaktion des humanen Poly(rC)-bindenden Proteins 2 mit Enterovirus-RNA

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Unter den Enteroviren haben die Coxsackieviren der Gruppe B (CVB) als Erreger akuter und chronischer Herzerkrankungen eine besondere klinische Relevanz. Die 5'-nichttranslatierten Region (5'-NTR) ihres Positivstrang-RNA-Genoms trägt essentielle Signalstrukturen für die Initiation der Replikation und der cap-unabhängigen Translation. Einige dieser Signalstrukturen sind an RNA-Protein-Interaktionen beteiligt. Die Bindung des humanen Poly(rC)-bindenden Protein 2 (PCBP2) an die RNA-Domänen I und IV der 5'-NTR führt zum Umschalten von viraler Translationsinitiation auf Initiation der viralen RNA-Synthese. Zwei KH-Domänen des PCBP2 binden an die virale RNA. Dieser Erkennungs-mechanismus ist derzeit ungeklärt. Ziel des Forschungsvorhabens ist die detaillierte Charakterisierung dieser RNA-Domänen und ihrer RNA-Protein-Komplexe. Qualitative und quantitative Bindungsstudien in vitro und Translationstests in Zellkulturen sollen zur biochemisch-funktionellen Analyse eingesetzt werden. Mittels Flüssigphasen-NMR-Spektroskopie soll die Raumstruktur einer ausgewählten RNA-Domäne und ihres Proteinkomplexes bestimmt werden. Erstmals soll "magic angle spinning"-Festkörper-NMR-Spektroskopie für Strukturuntersuchungen an RNA weiterentwickelt und angewandt werden.