Ab-initio-Vorhersage der Sekundär- und Tertiärstruktur von Polypeptiden aus der Primärstruktur, durch Anwendung hierarchischer evolutionärer Algorithmen im Raum optimierter Sekundärstrukturen, ohne Verwendung von Datenbankinformationen

通过在优化二级结构空间中应用分层进化算法，无需使用数据库信息，从一级结构开始预测多肽的二级和三级结构

基本信息

批准号：
5439308
负责人：
Professor Dr. Bernd Hartke
金额：
--
依托单位：
Institut für Physikalische Chemie
依托单位国家：
德国
项目类别：
Research Grants
财政年份：
2004
资助国家：
德国
起止时间：
2003-12-31 至 2008-12-31
项目状态：
已结题

来源：
https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5439308?language=en
关键词：
Ab initio Vorhersage der Sekund

项目摘要

Basierend auf ersten, erfolgreichen Vorarbeiten soll in diesem Projekt ein allgemeines Programm zur ab-initio-Strukturvorhersage von Proteinen aus ihrer Primärsequenz entwickelt werden, unter Verzicht auf Homologie-Informationen aus Protein-Datenbanken. Dabei wird globale Optimierung durch evolutionäre Algorithmen als Hauptinstrument verwendet. Im Gegensatz zu bisherigen Strategien dieser Art wird hier nicht direkt im Raum der Diederwinkel des Proteinrückgrats operiert, sondern hauptsächlich in einem abstrakteren Raum der Sekundärstrukturen. Nach Auswahl der geeignetsten Kraftfelder und Solvatationsmodelle, gegenenfalls auch nach Re-Optimierung der wichtigsten Parameter darin, werden Tertiärstrkturvorhersagen praktisch relevanter Genauigkeit nicht nur für kleinere Modell-Oligopeptide sondern auch für längere reale Polypeptidsequenzen angestrebt. Selbst bei einem Scheitern des Projekts sind positive Resultate zu erwarten: Neben einer fundierten Antwort auf die wichtige offene Frage, inwieweit Proteinfaltung einer Energieminimierung entspricht, auch ein Polymerfaltungs-Optimierungsprogramm, dass sich unschwer von Polypeptiden auch auf ganz andere Polymere übertragen ließe und damit für die Makromolekulare Chemie und Kolloidchemie interessant wäre.

该程序基于在蛋白质数据研究中要做的所有事物的蛋白质，并且蛋白质数据库正在展开。世界是蛋白质元素世界中的全球领导者。世界是蛋白质元素世界的全球领导者，它是世界的一部分。 Nicht Direkt Im Raum deDeerwinkel desProteinrückgratsOperiert，SondernHauptsächlichin Einem Abstrakteren raum dersekundärstrukturen。 Nach Auswahl der geeignetsten Kraftfelder und Solvatationsmodelle, gegenenfalls auch nach Re-Optimierung der wichtigsten Parameter darin, werden Tertiärstrkturvorhersagen praktisch relevanter Genauigkeit nicht nur für kleinere Modell-Oligopeptide sondern auch für LängereRealepolypeptidsequeconsepenzen angestrebt。 Selbst bei einem Scheitern des Projekts sind positive Resultate zu erwarten: Neben einer fundierten Antwort auf die wichtige offene Frage, inwieweit Proteinfaltung einer Energieminimierung entspricht, auch ein Polymerfaltungs-Optimierungsprogramm, dass sich unschwer von多肽Auch auf ganz andere polymereübertragenLieße和damitfür模具makromolekulare chemie und kolloidChemie互动wäre。