Elucidation of static and dynamic solvent effects by global structure optimization and molecular dynamics of microsolvation clusters

通过微溶剂化簇的整体结构优化和分子动力学阐明静态和动态溶剂效应

• 批准号: 170008408
• 负责人: Professor Dr. Bernd Hartke
• 金额: --
• 依托单位: Institut für Physikalische Chemie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2009-12-31 至 2013-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/170008408?language=en
• 关键词: Elucidation; static; dynamic; solvent; effects

Sehr viele chemische Reaktionen finden in Lösung statt, insbesondere in der Biochemie. Nach einer längeren Phase, in der die theoretische Chemie lediglich Reaktionen ohne Solvens betrachten konnte, bietet sie nun mehrere Methoden, das Lösungsmittel in die Berechnung mit einzubeziehen. Diese Methoden greifen entweder “von unten” an, durch Hinzufügung einiger weniger Solvensmoleküle, oder “von oben”, durch Hinzufügung einer großen Anzahl. Der letztere Zugang ist rechnerisch sehr aufwendig, wenn die Reaktion selbst mit ausreichender Genauigkeit beschrieben werden soll; der erstere Zugang leidet darunter, dass die Anzahl möglicher Solvensclusterkonfigurationen exponentiell mit der Clustergröße ansteigt, und kann daher keine ausreichenden Clustergrößen erreichen. Mit der vorgeschlagenen Methodik global optimierter Solvenscluster soll diese Lücke geschlossen und ein vernünftiger Kompromiss zwischen rechnerischem Aufwand und Genauigkeit erreicht werden. Diese Methode soll mit bekannten Standardreaktionen und einem schrittweisen Arbeitsplan etabliert werden, gefolgt von Anwendungen auf reale Reaktionen. Daneben werden weitere interessante Aspekte untersucht, insbesondere der statische und dynamische Einfluss des Lösungsmittels auf den Reaktionsverlauf und die Frage, inwieweit die Reaktanden und/oder das Lösungsmittel die treibende Kraft darstellen.

在Lösung statt发现了许多化学反应，但在生物化学中却发现了。在一个较长的阶段，在理论化学反应中，溶剂之间的相互作用，使其更接近于方法，在反应中的作用有一个单独的过程。该方法通过一个更小的溶剂或通过一个更大的Anzahl，可以“从下到上”进行改进。如果反应本身与一般的韦尔登反应完全，那么，这一次的Zugang反应是非常迅速的;如果反应本身与一般的气体反应完全，那么，这一次的Zugang反应是非常迅速的，因为Anzahl反应器的溶剂浓度是指数级的，并且不会再发生气体反应。Mit der vorgeschlagenen Methodik global optimierter Solvenscluster soll diese Lücke geschlossen and ein vernünftiger Kompromiss zwischen rechnerischem Aufwand und Genauigkeit erreicht韦尔登.这种方法需要标准化的反应和一个制定韦尔登的标准化的劳动计划，以实现真正的反应。丹麦人韦尔登还对前景感兴趣，他们认为，消费者对反应和法国的影响是静态的和动态的，这是因为反应和/或消费者对卡夫食品的影响。

项目成果

A graph‐based short‐cut to low‐energy structures

• DOI: 10.1002/jcc.23669
• 发表时间: 2014-08
• 期刊: Journal of Computational Chemistry
• 影响因子: 3
• 作者: Johannes M. Dieterich;B. Hartke

Aggregation of Kanamycin A: dimer formation with physiological cations

卡那霉素 A 的聚集：与生理阳离子形成二聚体

• DOI: 10.1007/s00894-011-0983-x
• 发表时间: 2011
• 期刊: Journal of Molecular Modeling
• 影响因子: 2.2
• 作者: J. M. Dieterich;U. Gerstel;J.-M. Schröder;B. Hartke
• 通讯作者: B. Hartke

Assessing solvation effects on chemical reactions with globally optimized solvent clusters.

使用全局优化的溶剂簇评估溶剂化对化学反应的影响

• DOI: 10.1002/cphc.201300323
• 发表时间: 2013
• 期刊: Chemphyschem : a European journal of chemical physics and physical chemistry
• 作者: B. Hartke