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Iso-Seq and RNA-seq based transcriptome analyses associated with root-knot nematode resistance in sweetpotato
基于 Iso-Seq 和 RNA-seq 的转录组分析与甘薯根结线虫抗性相关
基本信息
- 批准号：16K07557
- 负责人：
- 金额：$ 3.08万
- 依托单位：
- 依托单位国家：日本
- 项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份：2016
- 资助国家：日本
- 起止时间：2016-04-01 至 2019-03-31
- 项目状态：已结题
- 来源：
- 关键词：
项目摘要
项目成果
期刊论文数量（0）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
RNA-seqを利用したサツマイモネコブセンチュウ感染時における大規模トランスクリプトーム解析
使用 RNA-seq 进行甘薯线虫感染的大规模转录组分析
- DOI：
- 发表时间：2018
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Shinichiro Ohata;Koichiro Ushijima;Hiroaki Tabuchi;Makoto Tahara;Yuki Monden;小野菜奈・牛島幸一郎・田淵宏朗・大畑慎一郎・田原誠・門田有希;大畑慎一郎・牛島幸一郎・田淵宏朗・田原誠・門田有希
- 通讯作者：大畑慎一郎・牛島幸一郎・田淵宏朗・田原誠・門田有希
RNA-seq based transcriptome analysis associated with root-knot nematode resistance in sweetopotato
基于RNA-seq的转录组分析与甘薯根结线虫抗性相关
- DOI：
- 发表时间：2018
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Shinichiro Ohata;Koichiro Ushijima;Hiroaki Tabuchi;Makoto Tahara;Yuki Monden
- 通讯作者：Yuki Monden
NGSで6倍体サツマイモの形質関連領域を同定する
使用 NGS 识别六倍体甘薯的性状相关区域
- DOI：
- 发表时间：2018
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：小野菜奈;牛島幸一郎;田淵宏朗;田原誠;門田有希;門田有希
- 通讯作者：門田有希
非モデル作物における遺伝解析とロングリードシーケンスを利用したIso-seq解析
非模式作物的遗传分析和使用长读长测序的 Iso-seq 分析
- DOI：
- 发表时间：2017
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Shinichiro Ohata;Koichiro Ushijima;Hiroaki Tabuchi;Makoto Tahara;Yuki Monden;小野菜奈・牛島幸一郎・田淵宏朗・大畑慎一郎・田原誠・門田有希;大畑慎一郎・牛島幸一郎・田淵宏朗・田原誠・門田有希;小野菜奈・牛島幸一郎・田淵宏朗・田原誠・門田有希;小野菜奈・牛島幸一郎・田淵宏朗・田原誠・門田有希;門田有希
- 通讯作者：門田有希
Iso-Seqを用いたサツマイモの完全長cDNA配列の構築および新規遺伝子の探索
甘薯全长cDNA序列的构建并利用Iso-Seq寻找新基因
- DOI：
- 发表时间：2018
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：小野菜奈;牛島幸一郎;田淵宏朗;田原誠;門田有希
- 通讯作者：門田有希
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Monden Yuki其他文献
A Joint Model of Survival and Longitudinal Data under Nonignorable Intermittent Missingness
不可忽略间歇性缺失下的生存与纵向数据联合模型
- DOI：
- 发表时间：
2015 - 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：
Yamatani Hiroshi;Kohzuma Kaori;Nakano Michiharu;Takami Tsuneaki;Kato Yusuke;Hayashi Yoriko;Monden Yuki;Okumoto Yutaka;Abe Tomoko;Kumamaru Toshihiro;Tanaka Ayumi;Sakamoto Wataru;Kusaba Makoto;Ryosuke Igari and Takahiro Hoshino - 通讯作者：
Ryosuke Igari and Takahiro Hoshino
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Development of genome editing technology to accelerate gene function analysis in the hexaploid sweet potato
开发基因组编辑技术加速六倍体甘薯基因功能分析
- 批准号：
20K05984 - 财政年份：2020
- 资助金额：
$ 3.08万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
16S metagenomics analysis of microbiome communities in soils infected with root-knot nematode (Meloidogyne incognita) and Streptomyces ipomoea
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- 批准号：
16KT0147 - 财政年份：2016
- 资助金额：
$ 3.08万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Screening of novel active retrotransposon families with a potential for accelerating the genetic analysis in polyploid species
筛选具有加速多倍体物种遗传分析潜力的新型活性逆转录转座子家族
- 批准号：
26660007 - 财政年份：2014
- 资助金额：
$ 3.08万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
相似海外基金
巨細胞性動脈炎の末梢血RNA-seqによる病態病勢関連因子探索と治療最適化の検討
使用外周血 RNA-seq 寻找巨细胞动脉炎的疾病相关因素并优化治疗
- 批准号：
21K16283 - 财政年份：2021
- 资助金额：
$ 3.08万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
RNA-seq based transcriptome analysis on novel mechanism(s) of learning and memory
基于RNA-seq的学习和记忆新机制的转录组分析
- 批准号：
20K15991 - 财政年份：2020
- 资助金额：
$ 3.08万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
RNA-seq based study on plant-fungi interaction in melon plant
基于RNA-seq的瓜类植物-真菌相互作用研究
- 批准号：
17K17626 - 财政年份：2017
- 资助金额：
$ 3.08万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Pathophysiology of pregnancy induced hypertension using transcriptome analysis by RNA-Seq
利用 RNA-Seq 进行转录组分析的妊娠高血压病理生理学
- 批准号：
16K11117 - 财政年份：2016
- 资助金额：
$ 3.08万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
筋萎縮・肥大関連遺伝子発現を次世代シークエンサー（RNA-Seq）で解析する
使用下一代测序仪 (RNA-Seq) 分析肌肉萎缩/肥大相关基因表达
- 批准号：
26450390 - 财政年份：2014
- 资助金额：
$ 3.08万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Explore molecular basis underlying formation of chemical diversity in genus Panax through RNA-Seq analysis of three Panax species with different chemical compositions
通过对三种不同化学成分的人参属物种进行RNA-Seq分析，探索人参属化学多样性形成的分子基础
- 批准号：
26460119 - 财政年份：2014
- 资助金额：
$ 3.08万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
RNA-Seqを利用したイカ巨大軸索におけるRNA編集の解析とその生物学的意義
利用RNA-Seq分析鱿鱼巨轴突的RNA编辑及其生物学意义
- 批准号：
26640118 - 财政年份：2014
- 资助金额：
$ 3.08万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
Technical development for novel Single-cell RNA-seq
新型单细胞 RNA-seq 的技术开发
- 批准号：
24651218 - 财政年份：2012
- 资助金额：
$ 3.08万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
Guidelines for differential expression analysis from RNA-seq data
RNA-seq 数据差异表达分析指南
- 批准号：
24500359 - 财政年份：2012
- 资助金额：
$ 3.08万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
RNA-Seq data analysis for ncRNA function prediction to thousands public RNA-Seq data on super computer
在超级计算机上对数千个公共 RNA-Seq 数据进行 RNA-Seq 数据分析，用于 ncRNA 功能预测
- 批准号：
23650150 - 财政年份：2011
- 资助金额：
$ 3.08万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research