Genom- und Organellevolution in Höheren Pflanzen

高等植物的基因组和器官进化

基本信息

项目摘要

Organelle sind in allen höheren Spezies zu findende Kompartimente, die durch die Aufnahme eines Bakteriums in einer eukaryotischen Zelle entstanden sind (Endosymbiose). Im Verlauf der Evolution wurde ein Großteil der Endosymbiontengene in das Genom des Eukaryoten überführt. Im Gegenzug mussten nun einige der Proteine, für die diese transferierte DNA codiert, nach der Herstellung im Cytosol in die Organellen importiert werden, da sie dort wichtige Organellfunktionen aufrechterhalten. Dieser Import wird durch N-terminale Peptidsignale (TPs) ermöglicht, die von Translokatoren in den Organellmembranen erkannt werden. Die bioinformatische Vorhersage dieser TPs ist von großer Bedeutung, da zur Zeit nur so umfassende Aussagen über Anzahl und Identität der Organellproteine getroffen werden können. Diese Analyse ist vor allem bei einem Vergleich verschiedener Spezies von Interesse um unterschiede in der Funktionsvielfalt der jeweiligen Organelle aufzudecken und in einen evolutionären Kontext zu stellen. Das Vorhaben verfolgt folgende Ziele: 1) Verbesserung der Vorhersagegenauigkeit und Entwicklung leistungsfähigerer TP-Vorhersageprogramme. 2) Erstellung einer Datenbank für vorhergesagte und experimentell bestimmte Chloroplasten- und Mitochondrienproteine. 3) Phylogenetischer Vergleich von TPs und Promotorregionen identifizierter Organellproteine. 4) Genomweite Charakterisierung von kürzlich transferierter DNA um auf deren Aktivierungsmechanismen zu schließen.
细胞器存在于艾伦的宿主细胞中,通过在真核生物中培养一种细菌,可以发现内共生菌。在进化论的研究中,真核生物基因组中的内共生基因被发现了。在发生过程中,必须使用蛋白质,以便将DNA编码转移到重要器官韦尔登的胞质溶胶中,使其不受器官功能的影响。通过N-末端肽信号(TPs)导入,使其在细胞器膜上发生韦尔登。这些生物信息学预测的TPs是一个巨大的研究领域,目前只有韦尔登蛋白质的定位和识别才能被人们所接受。这种分析是通过一种不同的方法来验证兴趣的特殊性,这种兴趣是在一种进化的背景下,在一种进化的背景下。1)对TP-Vorhersagegenauigkeit和Entwicklung leistungsfägherer Vorhersageprogramme进行了Verbesserung der Vorhersagegenauigkeit und Entwicklung。2)Erstellung einer Datenbank für vorhergesagte und experimentell bestimmte Chloroplasten- und Mitochondrienproteine. 3)TPs和Promotorregionen鉴定器蛋白的系统发生学研究。4)基因组特征从kürzlich transferierter DNA um auf deren Aktivierungsmechanismen zu schließen。

项目成果

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