课题基金 / 基金详情

Foundation and application of the image analysis method of intermolecular interactions based on electron density changes

Foundation and application of the image analysis method of intermolecular interactions based on electron density changes
基于电子密度变化的分子间相互作用图像分析方法的建立及应用
批准号:
22K05020
负责人:
鳥居 肇
金额:
$2.66万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
水素結合系やハロゲン結合系など,凝縮相系における分子間相互作用と分子間構造形成および観測可能量(分光シグナルなど)の変化の相関に関わる事例について,電子密度解析の手法を用いて進めてきた理論研究の発展形として,分子間相互作用を空間分解的に捉えるための汎用的プロトコルを導くことができる可能性を追求する。そのため,典型的と考えられる事例のうち,これまでに扱わなかったものを対象に,追加的な解析を行ったのち,分子間相互作用の各因子に特徴的な電子密度変化を数百メガピクセルの画像パターンとして認識し類型化することにより,その解析プロトコルを導く。さらに,数理最適化の手法を援用して,この手法の自動化を図る。令和4年度においては,「典型的な事例の追加的解析」を進めるとともに,「電子密度変化の類型化」に向けた準備をおこなった。前者については,ハロベンゼンのさまざまな置換体(計48種の分子)を対象とした計算をおこない,ハロゲン結合供与分子に特徴的な電子密度の様相がハロゲン原子(Cl, Br, I)にどのように依存し,どのような置換基効果を受けるかを,明らかにした。後者については,典型的な水素結合受容官能基であるカルボニル基の,水との相互作用による分極に伴う電子密度変化を対象に,特異値分解の手法を用いた解析をおこない,各原子内(と見なすことができる空間領域内)の分極に由来する成分と分子内原子間の電荷移動に由来する成分の双方が確認できることを明らかにした。
英文摘要
水素結合系やハロゲン結合系など,凝縮相系における分子間相互作用と分子間構造形成および観測可能量(分光シグナルなど)の変化の相関に関わる事例について,電子密度解析の手法を用いて進めてきた理論研究の発展形として,分子間相互作用を空間分解的に捉えるための汎用的プロトコルを導くことができる可能性を追求する。そのため,典型的と考えられる事例のうち,これまでに扱わなかったものを対象に,追加的な解析を行ったのち,分子間相互作用の各因子に特徴的な電子密度変化を数百メガピクセルの画像パターンとして認識し類型化することにより,その解析プロトコルを導く。さらに,数理最適化の手法を援用して,この手法の自動化を図る。令和4年度においては,「典型的な事例の追加的解析」を進めるとともに,「電子密度変化の類型化」に向けた準備をおこなった。前者については,ハロベンゼンのさまざまな置換体(計48種の分子)を対象とした計算をおこない,ハロゲン結合供与分子に特徴的な電子密度の様相がハロゲン原子(Cl, Br, I)にどのように依存し,どのような置換基効果を受けるかを,明らかにした。後者については,典型的な水素結合受容官能基であるカルボニル基の,水との相互作用による分極に伴う電子密度変化を対象に,特異値分解の手法を用いた解析をおこない,各原子内(と見なすことができる空間領域内)の分極に由来する成分と分子内原子間の電荷移動に由来する成分の双方が確認できることを明らかにした。
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会议论文
Substituent Effect and Its Halogen-Atom Dependence of Halogen Bonding Viewed through Electron Density Changes
从电子密度变化观察卤素键的取代基效应及其卤素原子依赖性
DOI: 10.1002/asia.202201196
发表时间: 2023
期刊: Chemistry - An Asian Journal
影响因子: --
作者: [Sakai Takanori, Torii Hajime]
通讯作者: Torii Hajime
研究室webページ 日本語版
实验室网页日文版
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
ハロゲン結合系の静電的異方性に関わるハロゲン原子依存性と置換基効果の電子密度に基づく解析
基于电子密度分析卤原子依赖性和与卤键体系静电各向异性相关的取代基效应
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [Sakai Takanori, Torii Hajime, 酒井孝徳,鳥居 肇]
通讯作者: 酒井孝徳,鳥居 肇
複雑液体系の時間空間揺らぎによる振動数・時間領域振動分光シグナルの形状変化の解析
  • 批准号:
    20038022
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $1.92万
  • 财政年份:
    2008
  • 负责人:
    鳥居 肇
  • 依托单位:
混合液体系の振動スペクトルに対する液体構造の不均一性・揺らぎと振動相互作用の効果
  • 批准号:
    19029017
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $1.22万
  • 财政年份:
    2007
  • 负责人:
    鳥居 肇
  • 依托单位:
タンパク質-水系の構造形成・ダイナミクスと振動励起の動的振舞い
  • 批准号:
    18031016
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $3.71万
  • 财政年份:
    2006
  • 负责人:
    鳥居 肇
  • 依托单位:
ハロゲン結合の物理化学的描像の解明と超分子化学への応用
  • 批准号:
    18655003
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 资助金额:
    $2.3万
  • 财政年份:
    2006
  • 负责人:
    鳥居 肇
  • 依托单位:
海外基金