Establishment of fecal DNA metabarcoding method to clarify mammalian diets

建立粪便 DNA 元条形码方法以阐明哺乳动物饮食

基本信息

  • 批准号:
    22K05699
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.66万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2022
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2022-04-01 至 2027-03-31
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

糞中DNAから哺乳類の食性を分析することは、生態系を構成する食物網における哺乳類の役割を解明する上で重要である。2022年度はDNAメタバーコーディング法を用いて福山大学キャンパスに生息するアカネズミとニホンテンの食性を分析した。2022年4月から2023年3月まで、毎月、計41頭のアカネズミを採集することに成功し、それらの糞を対象に無脊椎動物および植物検出用の既知のDNAマーカーを使って食性分析を行った。その結果、チョウ目を中心とした無脊椎動物や、ブナ科の植物の季節変動を把握することができた。特に、ブナ科については、アカネズミが秋に収集したドングリを春まで採餌していることが示唆された。さらに、ブナ科に被害をもたらすメイガ科の蛾など森林害虫も検出された。このことから、アカネズミとブナ科の植物との相利関係が示唆された。同様に2020年6月から2022年9月に採取した48個の糞をDNAバーコーディングおよび形状からニホンテンの糞と同定し、食性分析を行った。その結果、スズメガ科、コガネムシ科、セミ科、オオムカデ科が検出され、成虫の活動時期と一致した。ヒヨドリは越冬のための渡りの時期と一致した。フトミミズは梅雨および秋の台風の時期と一致した。植物食性としては、ヤマモモ属、イチジク属、サクラ属が果熟期に検出された。ムクノキ属は花期に検出された。エノキ属やモチノキ属は果熟期をすぎた冬季に検出された。このことからニホンテンは植物のフェノロジーに合わせた柔軟な食性をもつこと、さらに果実を採餌することから種子散布者としての役割をもつことが示唆された。さらにキャンパス内に生息する無脊椎動物を159個体(100種程度)採集することに成功し、ローカルDNAデータベースの構築をするための土台を形成した。研究実施計画にある給餌実験と新規のDNAマーカー開発は今後の課題である。
The analysis of mammalian feeding habits in faecal DNA is important for understanding the structure of mammalian food webs and ecosystems. In 2022, Fukuyama University used DNA analysis to analyze food habits. From April 2022 to March 2023, a total of 41 animals were successfully collected, and the known DNA for animal and plant development was analyzed. The results of the study are as follows: invertebrate, plant and seasonal changes In particular, the company has been collecting food in autumn and gathering food in spring. The forest pests were killed in the forest. The relationship between plants and plants in the family is shown in the table. In June 2020 and September 2022, 48 samples were collected for food analysis. The results, species, species The winter season is the same. The time of the typhoon is similar to that of the rainy season. Plant feeding habits: The flowers are in bloom.エノキ属やモチノキ属は果熟期をすぎた冬季に検出された。This is the first time that a plant has been planted with a soft diet. 159 invertebrate species (100 species) were collected successfully, and the soil was formed. Research and implementation of new regulations on DNA development

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
哺乳類学
哺乳动物学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小池伸介;佐藤淳;佐々木基樹;江成広斗
  • 通讯作者:
    江成広斗
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  • 资助金额:
    $ 2.66万
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知道了