クライオ電子顕微鏡による細菌べん毛輸送中間複合体の構造解析
クライオ電子顕微鏡による細菌べん毛輸送中間複合体の構造解析
批准号:
22K06162
负责人:
木下 実紀
金额:
$2.66万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31
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べん毛輸送ゲート複合体は、水素イオンの内向きの流れに共役してべん毛構成タンパク質を細胞外へ送り出す。これまでに、熱揺らぎの影響を強く受けるにもかかわらず、輸送ゲート複合体にはべん毛構成タンパク質が高速かつ高効率に細胞外方向へのみ拡散移動できるしくみが装備されているが、その実体は未だ謎である。本研究では、クライオ電子顕微鏡を用い、輸送ゲート複合体部分を高分解能構造解析することで、熱揺らぎをうまく取り入れながら高速・高効率に輸送基質タンパク質を輸送できる輸送チャネル複合体の構造基盤を解明することを目的とする。本年度の主な成果は以下に示す。1.クライオ電子顕微鏡により、べん毛に組み込まれる前後でのFliPQR複合体の構造を明らかにした。組み込まれる前のFliPQR複合体は、可溶化の際に使用した界面活性剤をペプチドディスクに置き換えることで構造がより安定化され、今まで見えていなかったFliPのN末端領域の原子モデルを構築することができた。得られた構造に基づいて変異体解析を行なった結果、べん毛内部を貫通する輸送チャネルの形成メカニズムやMSリング内部にFliPQR複合体が組み込まれるしくみが明らかとなった。2.クライオ集束イオンビーム走査型電子顕微鏡を用いて、観察に適したサルモネラの薄層を作製する為の様々な条件検討を行った。まずは、サルモネラ菌体溶液の濁度と凍結条件を検討し、グリッド全体を覆い、かつ厚さが十分な層を持つグリッドを再現良く作製できるようになった。さらに、薄層を削る際のプログラムを最適化する為、電圧、ドーズ、ビーム径を検討した結果、約20分で1つの薄層を150μmまで薄く削る方法を確立した。
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Highly conserved GYXLI motif of FlhA is directly involved in hierarchical flagellar protein export in Salmonella.
FlhA 高度保守的 GYXLI 基序直接参与沙门氏菌的分级鞭毛蛋白输出。
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Minamino T, Kinoshita M, Namba K.]
通讯作者:
Namba K.
べん毛 III 型輸送 ATPase 複合体の構造変化と作動機構 (Structural change of the ATPase ring complex of the flagellar Type III export apparatus).
鞭毛 III 型输出装置 ATP 酶环复合物的结构变化。
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Usui A, Yano T, Tajima Y, Takekawa N, Kinoshita M, Minamino T, Uchihashi T, Imada K.]
通讯作者:
Imada K.
細菌べん毛輸送装置の膜電位に依存した活性化機構
细菌鞭毛运输装置的膜电位依赖性激活机制
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
生物物理
影响因子:
--
作者:
[南野徹, 木下実紀, 森本雄祐, 難波啓一]
通讯作者:
難波啓一
ユタ大学(米国)
犹他大学(美国)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Purification of the Transmembrane Polypeptide Channel Complex of the Salmonella Flagellar Type III Secretion System
沙门氏菌鞭毛III型分泌系统跨膜多肽通道复合体的纯化
DOI:
10.1007/978-1-0716-3060-0_1
发表时间:
2023
期刊:
Methods in Molecular Biology
影响因子:
--
作者:
[Kinoshita Miki, Namba Keiichi, Minamino Tohru]
通讯作者:
Minamino Tohru
共 8 条
イラン現代文学の黎明期における翻案文学と創作:ジャマールザーデ再考
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批准号:23K18675
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项目类别:Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
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资助金额:$0.58万
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财政年份:2023
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负责人:木下 実紀
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依托单位:
ガージャール朝イランにおける文学の近代化の諸相――外国語文学の翻案から――
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批准号:21J13287
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.58万
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财政年份:2021
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负责人:木下 実紀
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依托单位:
海外基金