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Analysis of the usefulness of tRNA fragments as biomarkers for rheumatoid arthritis and their effects on synovial cells

分析 tRNA 片段作为类风湿关节炎生物标志物的用途及其对滑膜细胞的影响

基本信息

批准号：
22K08535
负责人：
山崎聡士
金额：
$ 2.58万
依托单位：
Kurume University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

関節リウマチ（Rheumatoid Arthritis: RA）では、蛋白質をコードしないnon-coding RNA(ncRNA)に特有の発現変化が起こることが報告されている。しかし、その病態への影響に関しては不明な点も多い。申請者は古典的ncRNAの１つである転移リボ核酸（transfer RNA：tRNA）の切断片が翻訳抑制機能を有することを発見、「tiRNA」として報告した。その後、tiRNAが抗アポトーシス作用を有すること、マウスの自己免疫疾患モデルに影響を与えることが判明し、ヒト疾患への応用研究も展開されつつある。本研究では、RAにおけるtiRNAのバイオマーカーとしての可能性を探り、さらにtiRNAが積極的に病態に関与しているかを検証する。その方法として、生物学的製剤による治療の前後にRA症例の血液を採取し、血中のtiRNAの変化を検討し、バイオマーカーとしての価値を検証する。培養細胞研究では培養滑膜細胞におけるtiRNAの制御、およびtiRNAが滑膜細胞に与える影響を検討する。バイオマーカーに関する研究では、リボ核酸の配列解析（RNA-Seq）が鍵となる。特にサンプル間バリアンスを回避する工夫が重要であり、全てのtRNA断片を漏らさず解析するための技術構築が決め手となる。2022年度はこの技術的解決に成功した。そのポイントは、tRNA断片と同じサイズのRNAの断端のリン酸化を一律に除去し、再びその全てをリン酸化するという方法である。これにより異なる断端を有するRNAを全て一様に配列解析することが可能となった。培養細胞研究は研究施設移動のため研究に遅れが生じているが、今後広島大学リウマチ・膠原病科で継続的に行われている滑膜細胞研究プラットフォームを使用して、研究実施が可能な状況となった。

Rheumatoid Arthritis (RA) is a protein that develops specifically in non-coding RNA(ncRNA). The influence of disease and illness is unknown. The applicant reported that the classical ncRNA gene has a function of inhibiting the translation of the nucleic acid (transfer RNA: tRNA), and that the "tiRNA" gene has a function of inhibiting the translation of the nucleic acid. The role of tiRNA in anti-HIV/AIDS has been investigated in the identification of HIV/AIDS and in the study of HIV/AIDS. This study explores the possibility of tiRNA activation, and demonstrates the association between tiRNA activation and RA activation. Methods and biological preparation of RA before and after treatment of blood samples, blood tiRNA transformation, and identification Cultured cell studies investigated the regulation of tiRNA in cultured synovial cells and the effects of tiRNA on synovial cells The study of RNA-Seq is a key to understanding the sequence of nucleic acids. In particular, it is important to avoid the time for the analysis of tRNA fragments. In 2022, the technical solution was successfully completed. All RNA fragments are removed and all RNA fragments are acidified. The sequence of RNA sequences is different. Cultured cell research, research facility, research facility, future research facility, synovial cell research facility, future research facility