Analysis of the usefulness of tRNA fragments as biomarkers for rheumatoid arthritis and their effects on synovial cells

分析 tRNA 片段作为类风湿关节炎生物标志物的用途及其对滑膜细胞的影响

• 批准号: 22K08535
• 负责人: 山崎 聡士
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Kurume University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K08535/
• 关键词: 関節リウマチ; 滑膜細胞; バイオマーカー; 転移リボ核酸断片; リボ核酸配列解析; tRNA断片; 翻訳抑制; アポトーシス; アンジオジェニン

関節リウマチ（Rheumatoid Arthritis: RA）では、蛋白質をコードしないnon-coding RNA(ncRNA)に特有の発現変化が起こることが報告されている。しかし、その病態への影響に関しては不明な点も多い。申請者は古典的ncRNAの１つである転移リボ核酸（transfer RNA：tRNA）の切断片が翻訳抑制機能を有することを発見、「tiRNA」として報告した。その後、tiRNAが抗アポトーシス作用を有すること、マウスの自己免疫疾患モデルに影響を与えることが判明し、ヒト疾患への応用研究も展開されつつある。本研究では、RAにおけるtiRNAのバイオマーカーとしての可能性を探り、さらにtiRNAが積極的に病態に関与しているかを検証する。その方法として、生物学的製剤による治療の前後にRA症例の血液を採取し、血中のtiRNAの変化を検討し、バイオマーカーとしての価値を検証する。培養細胞研究では培養滑膜細胞におけるtiRNAの制御、およびtiRNAが滑膜細胞に与える影響を検討する。バイオマーカーに関する研究では、リボ核酸の配列解析（RNA-Seq）が鍵となる。特にサンプル間バリアンスを回避する工夫が重要であり、全てのtRNA断片を漏らさず解析するための技術構築が決め手となる。2022年度はこの技術的解決に成功した。そのポイントは、tRNA断片と同じサイズのRNAの断端のリン酸化を一律に除去し、再びその全てをリン酸化するという方法である。これにより異なる断端を有するRNAを全て一様に配列解析することが可能となった。培養細胞研究は研究施設移動のため研究に遅れが生じているが、今後広島大学リウマチ・膠原病科で継続的に行われている滑膜細胞研究プラットフォームを使用して、研究実施が可能な状況となった。

Masato section リ ウ マ チ (Rheumatoid Arthritis: RA) で は, protein を コ ー ド し な い non - coding RNA (ncRNA) に の unique 発 now - the が up こ る こ と が report さ れ て い る. <s:1> <s:1>, そ <e:1>, pathological へ, へ, に, related に, て, て, unclear な points <e:1>, many そ. Applicants は classical ncRNA の 1 つ で あ る planning move リ ボ nucleic acid (transfer RNA: tRNA) の cut piece が を 訳 inhibition function for す る こ と を 発 see, "tiRNA と し て report し た. Resistance, after そ の tiRNA が ア ポ ト ー シ を ス is す る こ と, マ ウ ス の himself immune disorders モ デ ル に influence を and え る こ と が.at し, ヒ ト disorders へ の 応 with study も started さ れ つ つ あ る. This study で は, RA に お け る tiRNA の バ イ オ マ ー カ ー と し て り を の possibility and さ ら に tiRNA が positive に pathological に masato and し て い る か を 検 card す る. そ の way と し て, biology tonic に よ る に RA cases before and after treatment の の blood を し, blood の tiRNA の variations change を beg し 検, バ イ オ マ ー カ ー と し て の 価 numerical を 検 card す る. Culture cell research で は culturing synovial cell に お け る tiRNA の suppression, お よ び tiRNA に が synovial cells in vitro and え る influence を beg す 検 る. The バ <s:1> and <s:1> カ カ カ に are related to the する study of で リボ and リボ nucleic acid <s:1> coordination analysis (RNA-Seq) が bonds となる. Between special に サ ン プ ル バ リ ア ン ス を avoid す る time が important で あ り, whole て の tRNA fragment を leakage ら さ ず parsing す る た め の technology to construct が definitely め hand と な る. In 2022, the technical solution of に was successfully completed and た was achieved. そ の ポ イ ン ト は, tRNA と fragment with じ サ イ ズ の RNA の end の リ ン acidification を uniform に eliminate し, again び そ の full て を リ ン acidification す る と い う method で あ る. こ れ に よ り different な る end を have す る RNA を て all the others in に match column analysis す る こ と が may と な っ た. Culture cell research は research facilities mobile の た め research に 遅 れ が raw じ て い る が, hiroo island in the future university リ ウ マ チ, collagen diseases で 継 続 に line わ れ て い る synovial cell research プ ラ ッ ト フ ォ ー ム を use し て, the condition of research may be giving が な と な っ た.