デアミノノイラミン酸残基特異的な新規シアリダーゼ(KDNase)-酵素の化学構造および立体構造の解析と既知シアリダーゼとの比較

新型脱氨基神经氨酸残基特异性唾液酸酶 (KDNase) - 分析酶的化学和三级结构并与已知唾液酸酶进行比较

• 批准号: 08878090
• 负责人: 北島 健
• 金额: $ 0.96万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 1996
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1996 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-08878090/
• 关键词: KDN; KDNアーゼ; シアリダーゼ; 誘導酵素; 分子クローニング; 細菌酵素; 酵素反応速度論的解析; 結晶構造解析

既知のシアリダーゼに抵抗性を示すKDN(デアミノノイラミン酸)残基を特異的に加水分解する酵素(KDNase)は、シアル酸炭素骨格の5位の水酸基とアミノアシル基を厳密に区別する。本研究は、このシアル酸識別機構をKDNaseの触媒反応機構と化学および立体構造的見地から解明することを目的として行い、以下の結果を得た。1.KDNaseSMの速度論的解析:精製酵素を用い、酵素反応の速度論的解析を合成および天然基質、また阻害剤を用いて行うとともに、基質の加水分解反応におけるKDNの立体配置の経時変化をNMRによって分光学的に追跡した。その結果、KDNaseは、炭素骨格の5位の置換基の認識が厳密であるものの、従来のシアリダーゼ触媒と同様の遷移状態を経由する共通の反応機構が存在することが明らかになった。2.Sphingobacterium multivorum由来KDNaseSMの分子クローニングと化学構造解析:精製酵素の部分アミノ酸配列を決定する。このアミノ酸配列から推定される合成オリゴヌクレオチド・プローブをもちいて、酵素をコードするcDNAをスクリーニングし、更にそのcDNAの塩基配列決定を行った。現在、ほぼ全アミノ酸配列の推定が成功したところである。明らかにされたアミノ酸配列の範囲内では、既知のシアリダーゼのアミノ酸配列との相同性はあまり見出されていない。3.KDNaseSMの結晶構造解析を目指した酵素の大量調製:KDNaseは、誘導酵素であり、KDNのαケトシドによって、S.multivorum中に誘導されることが確かめられた。現在、(2)で得られたcDNAから酵素を大腸菌に発現させて、酵素に対する抗体を調製中であり、抗体を用いた1段階精製法を確立を目指しているところである。

It is known that the resistance of KDN residues is specific to the hydrolysis enzyme (KDNase), and the resistance of KDN residues is closely related to the hydrolysis group at position 5 of the carbon skeleton. This study is aimed at understanding the mechanism of KDNase, its catalytic reaction mechanism and its three-dimensional structure. 1. Velocity-theoretical analysis of KDNase SM: purification of enzymes, velocity-theoretical analysis of enzyme reactions, synthesis of natural substrates, application of inhibitors, hydrolysis of substrates, time-dependent transformation of KDN stereoconfiguration, NMR and spectroscopic tracking. As a result, KDNase and 5-position substitution bases of carbon skeleton are closely related to the existence of common reaction mechanisms for the transfer of KDNase and carbon skeleton. 2. Sphingobacteria multivorum is derived from KDNase SM and its molecular structure is analyzed. The sequence of these enzymes is estimated to be the sequence of the cDNA sequence, and the sequence of the cDNA sequence is determined by the enzyme sequence. Now, the prediction of acid alignment is successful. In the case of the acid sequence, the identity of the acid sequence is known. 3. The crystal structure analysis of KDNase SM indicates that a large number of enzymes are modulated:KDNase, KDN, S. multiorum. Now,(2) we can get the cDNA, enzyme, antibody, and so on.

项目成果

北島,健: "新しいシアル酸KDNの糖鎖生物学の最近の発展" 生化学. 68(1). 44-51 (1997)

Kitajima，Ken：“新唾液酸 KDN 糖生物学的最新进展”，生物化学 68(1) (1997)。