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帯観測モデルを用いた質量分析の性能向上と包括的タンパク質同定システムの開発

使用条带观察模型提高质谱性能并开发综合蛋白质鉴定系统

基本信息

批准号：
22KJ1726
负责人：
上村京也
金额：
$ 1.41万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2023
资助国家：
日本
起止时间：
2023-03-08 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

年次計画に従い，QMS実測定系が有する特性についての調査を行った．QMSの実観測信号ノイズについての予備検討の結果，特有のノイズ特性（非負性・信号値依存性）によって分布構造にガウス分布を仮定する推定手法（代表的なスパース推定手法であるLasso推定を含む）の適用が不適当であることが明らかとなった．その後の文献調査や観測信号生成過程の定式化によってポアソン－アーランモデルによるモデル化を行い，その妥当性を統計的仮説検定に基づいて定量的に明らかにした．QMS実測定系が有する真の観測行列については，適切な仮定のもとで観測過程を定式化し，測定条件をコントロールすることで，目的の観測行列を十分な精度で取得することができた．この結果，当初計画にあったQMF内のイオン粒子の軌道シミュレーション及び辞書学習を行う必要がなくなったため，これらについては実施しなかった．これらの成果は帯観測に基づくマススペクトル推定技術をQMS測定系に実装する上での不可欠の段階であると同時に，他のQMS測定技術の確立にも貢献する成果である．これらと並行して，帯観測モデルに基づくスパース推定の技術をQMSより高次の質量分析手法であるタンデム質量分析へと適用する試みも行なっており，現在はこれに先駆けた初期検討を行なっている．研究成果の対外発表については，2021年8月に帯観測に基づくスパーススペクトル推定技術についての特許出願を行っており，同技術に関する研究論文についても現在執筆中であり，今後，査読付き英文論文誌・国際学会に投稿予定である．

The annual plan is planned, and the QMS measurement system has the characteristics and characteristics of the QMS. QMS's measurement signal detection results are based on the unique characteristics (non-negativity and signal dependence) and the distribution structure of QMS. The を仮定する inference technique (representative of the なスパース inference technique であるLasso inference をcontaining む) is not suitable and is not appropriate であることが明らかとなった． Literature survey after the test and formalization of the measurement signal generation processよるモデル化を行い, その validity をstatistical 仮说検determination にbase づいてに明らかにした． The QMS measurement system has a real measurement sequence and a formalized measurement process. The measurement conditions are the same as the measurement conditions, and the purpose is to measure the rows and rows with tenths of accuracy. As a result, the original plan was to use the orbit of the のイオン particle in the QMF and It's necessary to learn the dictionary and learn it. It's necessary to learn the dictionary.これらのachievementsは帯禳measurementbaseづくマススペクトルESTIMATION TECHNOLOGYQMS MEASUREMENT SYSTEM At the same time, he contributed to the establishment of QMS measurement technology and achieved results at the same time.これらと Parallel して, 帯観measurement モデルにbase づくスパース inference の technology をQMS より高时のquality analysis technique であるThe quality analysis of タンデムへと is applicable to the する trial みも行なっており, and now the はこれにFirst 槆けたInitial 検 Discussion を行なっている. The results of the research will be published in the journal, and the technology will be approved in August 2021. The author of the same technical research paper as the author is currently in the process of writing it. In the future, the manuscript will be submitted to the English thesis magazine and the International Society.