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帯観測モデルを用いた質量分析の性能向上と包括的タンパク質同定システムの開発

使用条带观察模型提高质谱性能并开发综合蛋白质鉴定系统

基本信息

批准号：
22KJ1726
负责人：
上村京也
金额：
$ 1.41万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2023
资助国家：
日本
起止时间：
2023-03-08 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

年次計画に従い，QMS実測定系が有する特性についての調査を行った．QMSの実観測信号ノイズについての予備検討の結果，特有のノイズ特性（非負性・信号値依存性）によって分布構造にガウス分布を仮定する推定手法（代表的なスパース推定手法であるLasso推定を含む）の適用が不適当であることが明らかとなった．その後の文献調査や観測信号生成過程の定式化によってポアソン－アーランモデルによるモデル化を行い，その妥当性を統計的仮説検定に基づいて定量的に明らかにした．QMS実測定系が有する真の観測行列については，適切な仮定のもとで観測過程を定式化し，測定条件をコントロールすることで，目的の観測行列を十分な精度で取得することができた．この結果，当初計画にあったQMF内のイオン粒子の軌道シミュレーション及び辞書学習を行う必要がなくなったため，これらについては実施しなかった．これらの成果は帯観測に基づくマススペクトル推定技術をQMS測定系に実装する上での不可欠の段階であると同時に，他のQMS測定技術の確立にも貢献する成果である．これらと並行して，帯観測モデルに基づくスパース推定の技術をQMSより高次の質量分析手法であるタンデム質量分析へと適用する試みも行なっており，現在はこれに先駆けた初期検討を行なっている．研究成果の対外発表については，2021年8月に帯観測に基づくスパーススペクトル推定技術についての特許出願を行っており，同技術に関する研究論文についても現在執筆中であり，今後，査読付き英文論文誌・国際学会に投稿予定である．

For each year of the project, the QMS system is determined to have the characteristics of the computer. The QMS signal is widely used and the result is not known. The unique characteristic (non-linear signal dependence) is that the distribution is related to the presumption method (the representative presumption technique is the Lasso presumption). In the literature, the process of generating the signal is not valid. I don't know if you want to change the line. According to the statistics of statistical data, there is a quantitative analysis of the data. QMS is determined that there are real data in the system, and that the process of determining the accuracy of the process is determined, and the conditions are determined. The results show that the accuracy of the test is very accurate. In the beginning, it was planned that in the QMF, it would be necessary to use the necessary information in the field of science and technology. The results of the study should be based on the presumption of technology. The QMS test system should not be used at the same time. He makes sure that the QMS measurement technology is responsible for the presentation of the results, and that the results are available at the same time, and that the results of the research are not available in the table outside the table on the basis of the high-order quantitative analysis methods of the technical QMS. In August 2021, we are interested in the presumption of technology, especially in the field of technical research, which is now in the process of implementation. In the future, we will submit contributions from the International Society of English and Social Sciences.