抗腫瘍性抗生物質C-1027における分子認識の解明

抗肿瘤抗生素 C-1027 分子识别的阐明

• 批准号: 08680623
• 负责人: 田中 俊之
• 金额: $ 1.34万
• 依托单位: University of Tsukuba
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 1996
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1996 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-08680623/
• 关键词: C-1027; クロモプロテイン; 分子認識; 二次元NMR; 溶液構造

強力な抗癌剤であるC-1027は、DNA切断活性を示す非常に不安定なクロモフォアと、これを特異的に結合して安定化するアポタンパクからなる。本研究では、このC-1027複合体におけるクロモフォア結合様式および安定化機構を原子レベルで解明することを目的とする。1.天然のクロモフォアの化学構造は既に報告されているが、C8、C9、C13およびC18位の絶対配置が決まっていない。そこで、安定な芳香環化クロモフォアに新モッシャー法を適用し、13R、18Sであることを明らかにした。次に、芳香環化クロモフォアのNOE測定とコンピューター・モデリングを行い、8R、9Rと決定した。2.アポタンパク単独の二次元NMR解析とX-PLOR構造計算を行った。アポタンパクは3つの逆平行型βシートから構成されており、このうち2枚のβシートと2つのループから疎水性の高いポケットが形成されていることを明らかにした。3.芳香環化クロモフォアとアポタンパクの1:1複合体を天然複合体のモデルとし、二次元NMR解析と構造計算を行った。NOESYスペクトルの解析から得られた距離情報に基づくX-PLOR構造計算の結果、芳香環化クロモフォアはアポタンパクの疎水性ポケットに結合していることがわかった。計算に用いた距離情報が少なく構造が十分に収束していないため、芳香環化クロモフォアとアポタンパク間の詳細な相互作用はまだ明らかでない。今後解析を進め、構造の精密化を行う。4.測定条件を種々検討し、不安定な天然のC-1027複合体の二次元NMRスペクトルを測定することに成功した。今後スペクトルの解析と構造計算を行い、クロモフォア結合様式および安定化機構を明らかにする予定である。

C-1027 is a potent anticancer agent that exhibits DNA cleavage activity and is highly unstable and specifically stable. The purpose of this study is to clarify the atomic structure of C-1027 complex. 1. The chemical structure of the natural red pigment is reported to be determined by the relative arrangement of the C8, C9, C13 and C18 positions. The new method of aromatic cyclization is applicable to 13R and 18S. Next, aromatic cyclization NOE determination, 8R, 9R determination 2. Perform independent quadratic NMR analysis and X-PLOR structure calculation. The structure of the anti-parallel β is composed of the following three elements: 3. Aromatic cyclization of 1:1 complexes, 2-D NMR analysis and structural calculation Analysis of NOESY selection parameters, calculation results of X-PLOR structure, aromatic cyclization parameters, and combination of these parameters The calculation uses distance information, structure, and detailed interactions between aromatic cyclization. In the future, the analysis will be advanced and the structure will be refined. 4. The determination of C-1027 complex was successfully carried out under different conditions. In the future, the analysis and structural calculation of the structure will be carried out, and the combination formula and stabilization mechanism will be specified.

项目成果

Kyo-ichiro Iida: "Absolute Configuration of C-1027 Chromophore" Tetrahedron Letters. 37. 4997-5000 (1996)

Kyo-ichiro Iida：“C-1027 发色团的绝对构型”四面体字母。