权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

大腸菌・サルモネラにおけるRNA制御回路の階層性に関する研究

大肠杆菌和沙门氏菌RNA调控回路的层次结构研究

基本信息

批准号：
22KF0052
负责人：
宮腰昌利
金额：
$ 1.47万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2023
资助国家：
日本
起止时间：
2023-03-08 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KF0052/
关键词：
転写後調節アミノ酸代謝 GcvB 腸内細菌科

项目摘要

アミノ酸の輸送や生合成に関与する50以上の遺伝子（大腸菌ゲノムの1%以上）を制御するsmall RNA GcvBは、大腸菌などの腸内細菌科細菌に限らずグラム陰性細菌に広く保存されている。GcvBの細胞内存在量は最大でも140分子程度であるため、1つの細胞内で全ての標的遺伝子が制御されるかは確率的であり、標的遺伝子にはヒエラルキーが存在すると考えられる。本研究はGcvBがどのように標的mRNAを選択するかを明らかにし、転写後レベルの制御ネットワークに階層性を与えるメカニズムを解明することを目的とする。代表的なGcvB標的遺伝子のGFP翻訳融合体を作成した。また、リボソーム休止因子遺伝子rmf、hpf、raiAのレポーターを作成し、各種培養条件の増殖曲線、発現量の変動を解析した。ゲルシフトアッセイによりin vitroではGcvBはrmf mRNAと塩基対形成することが明らかになった。しかしながら、現在のところGcvB過剰発現株および破壊株におけるrmfレポーターの発現量に再現性のある有意な変化は見出されなかった。これまでの研究成果を国内の研究会で発表した。また、外国人特別研究員が博士課程在学中に作成していた論文を投稿し、受理された。

アミノAcid delivery and biosynthesis and する50 or more の缝子 (coliform ゲノムの1% or more) をcontrol するsmall RNA GcvB は, coliform などのEnterobacteriaceae bacteria にlimited らずグラムnegative bacteria に広くされている. The maximum amount of GcvB present in cells is 140 molecules, and the total amount of GcvB in cells is 1. The precise control of the 伝子がされるかは and the target 伝子にはヒエラルキーが exist すると考えられる. In this study, the target mRNA of GcvB was selected and written byベルのcontrolled ネットワークにclassic を and えるメカニズムを Explain することをpurpose とする. A fusion of a representative GcvB target gene and a GFP translation was prepared.また, リボソームrest factor remnant rmf, hpf, raiA のレポーターを creation, growth curves of various culture conditions, 発existing amount の変动をanalysis した.ゲルシフトアッセイによりin vitroではGcvBはrmf mRNAと塩対成することが明らかになった.しかしながら、Now のところGcvBpass剰発开户および波壊区におけるr mfレポーターの発成quantityにReproducibilityのあるIntentionalな変化は见出されなかった. The results of the research are published by the domestic research association.また、Foreign Special Researcher がDoctoral program in school. していたThesis is submitted and accepted.