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宿主染色体との協調的相互作用による分解プラスミドのゲノム機能に関する研究

宿主染色体との協調的相互作用による分解プラスミドのゲノム機能に関する研究
通过与宿主染色体的协同相互作用研究降解质粒的基因组功能
批准号:
07J03864
负责人:
宮腰 昌利
金额:
$2.11万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2009

项目摘要

项目成果

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IncP-7群トルエン分解プラスミドpDK1はPseudomonas属細菌で安定に保持されたが、例外的にKT2440株では極度に不安定である。KT2440株においてparIの遺伝子破壊によりミニプラスミドの安定性が向上し、一方でP.fluorescens Pf-5株においてparIをLacI^q制御下にあるtacプロモーターから発現させたところIPTG濃度依存的にミニプラスミドは不安定化した。以上から、ParIがIncP-7群プラスミドの分配を阻害するKT2440株特異的宿主因子であることが明らかになった。また、セントロメア様配列parSの数が多いほどParIによる不安定化の影響を受けやすいことが示された。次に、ParIの分配阻害活性にはParIのATPaseドメインが必須であることが示された。また、ParBのR-fingerと考えられるArg93をLys、Alaに置換することでミニプラスミドの安定性は顕著に減少し、これらのParB変異型ミニプラスミドばParIによる分配阻害を受けなくなることが明らかになった。以上の結果からParIはParBのR-fingerにおいてParAと競合することで分配を阻害することが推測された。昨年度までに自己伝達性広宿主域プラスミドRP4の接合伝達過程で一過的に誘導される転写産物をマイクロアレイで検出することに成功した。受容菌では、リプレッサーの制御下にある複数のオペロンの転写が顕著に誘導された。一方供与菌では、oriT近傍に存在するtraJオペロンが顕著に転写誘導されることを見出した。5'-RACE法によりtraJの転写開始点を同定したところ、転写開始点は伝達始点よりも24塩基上流に位置することが明らかになった。traJ mRNAの5'末端24塩基は伝達鎖を鋳型とすることから、traJオペロンが転写されるのは伝達鎖が供与菌内に存在する場合、すなわち伝達開始前もしくは相補鎖合成後に限定されることを示した。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
自己伝達性プラスミドの接合伝達過程における転写誘導
自传质粒接合转移过程中的转录诱导
DOI: --
发表时间: 2009
期刊:
影响因子: --
作者: [宮腰昌利, ら]
通讯作者:
DOI: 10.1186/1471-2164-10-12
发表时间: 2009-01-09
期刊: BMC genomics
影响因子: 4.4
作者: [Miyakoshi M, Nishida H, Shintani M, Yamane H, Nojiri H]
通讯作者: Nojiri H
Transcriptome analysis of plasmid conjugative transfer
质粒接合转移的转录组分析
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [宮腰昌利, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝, 宮腰昌利]
通讯作者: 宮腰昌利
DOI: 10.1128/jb.00684-07
发表时间: 2007-10-01
期刊: JOURNAL OF BACTERIOLOGY
影响因子: 3.2
作者: [Miyakoshi, Masatoshi, Shintani, Masaki, Nojiri, Hideaki]
通讯作者: Nojiri, Hideaki
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    原核生物におけるスポンジRNAの作用機構の解明と応用
    • 批准号:
      24K01661
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.98万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      宮腰 昌利
    • 依托单位:
    大腸菌・サルモネラにおけるRNA制御回路の階層性に関する研究
    • 批准号:
      22KF0052
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $1.47万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      宮腰 昌利
    • 依托单位:
    オペロンmRNA間の塩基対形成による新規連続代謝反応の実現と応用
    • 批准号:
      21K19063
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • 资助金额:
      $4.16万
    • 财政年份:
      2021
    • 负责人:
      宮腰 昌利
    • 依托单位:
    新規RNA-seq解析による腸内細菌科細菌のRNA制御ネットワークの解明
    • 批准号:
      19KK0406
    • 项目类别:
      Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (A))
    • 资助金额:
      $9.73万
    • 财政年份:
      2020
    • 负责人:
      宮腰 昌利
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    Pseudomonas sp. ZM23三氯生分解代谢及其调控机理研究
    • 批准号:
      32370117
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      50万元
    • 批准年份:
      2023
    • 负责人:
      吕镇梅
    • 依托单位:
    OSA2 在联合固氮菌 Pseudomonas otitidis H40-2 促进水稻铵态氮吸收中的作用机制研究
    • 批准号:
      --
    • 项目类别:
      青年科学基金项目
    • 资助金额:
      30万元
    • 批准年份:
      2022
    • 负责人:
      董萌
    • 依托单位:
    c-di-GMP合成酶基因digC调控Pseudomonas azotoformans ZY-1风化硅酸盐矿物分子机制研究
    • 批准号:
      --
    • 项目类别:
      --
    • 资助金额:
      58万元
    • 批准年份:
      2022
    • 负责人:
      盛下放
    • 依托单位:
    群体感应LasI-LasR系统在Pseudomonas taiwanensis WRS8减少小麦镉吸收中的作用机制
    • 批准号:
      --
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      56万元
    • 批准年份:
      2021
    • 负责人:
      程诚
    • 依托单位: