Monitoring bacteriophage DNA in aquaculture sites to predict fish bacterial diseases

监测水产养殖场中的噬菌体 DNA 以预测鱼类细菌性疾病

• 批准号: 22K19214
• 负责人: 吉田 照豊
• 金额: $ 4.16万
• 依托单位: University of Miyazaki
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-06-30 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K19214/
• 关键词: Lactococcus garvieae; Seriola quinqueradiata; ファージ; qPCR; Nocardia seriolae; Seriola dumerili; バクテリオファージ; 養殖場; 定量PCR

○ブリ養殖場より、現在流行しているII型レンサ球菌のビルレントバクテリオファージを数種類分離することに成功した。またこのファージのゲノム解析をしたところ、分離したファージはほぼ同じ遺伝構造をしていた。このファージを用いて、教室に保存しているII型レンサ球菌３００菌株のファージ型別を行ったところ、感受性の型と非感染型の2種類のファージ型別が可能となった。○II型レンサ球菌が流行する時期に、効率的に今回分離できたファージを分離することができた。流行時とファージの分離時期がほぼ重なると考えられた。ファージのゲノム解析から、Shiphoviridaeに分類されることが判明した。また、電子顕微鏡による形態観察の結果も同様であった。今回分離したII型レンサ球菌に特異的に感染するファージは、すでに発表したI型レンサ球菌に感染するファージと非常に類似した遺伝構造を有していた。しかしながら、II型ファージはI型及びIII型レンサ球菌に感染せず、血清型II型の菌株に特異的であると考えられた。○ブリ類養殖において、大きな問題となる感染症であるノカルジアに感染するファージの分離に成功した。電子顕微鏡観察から分離したファージの形態は、非常に尾部の長いShiphoviridaeに分類されるファージであった。これらのファージのゲノム解析に成功した。その結果、すでに報告のあるGordoniaに感染するファージと非常に類似したものであった。詳細なゲノム解析の結果、特定のある部位に遺伝構造の違いが認められた。今回分離したファージは、ブリの細菌感染症であるNocardia seriolaeだけではなく、他のノカルジア属細菌にも感染し、宿主範囲が広いことが判明した。

○我们成功地隔离了II型链球菌的几种类型的有毒噬菌体，这些噬菌体目前流行。此外，当对该噬菌体进行基因组分析时，分离的噬菌体几乎具有相同的遗传结构。使用这种噬菌体，在教室中存储的300种II型链球菌菌株是噬菌体类型，可以使用两种类型的噬菌体类型：易感和不感染。 ○在II型链球菌普遍存在的期间，这次分离的噬菌体能够有效地分离出来。据认为，流行期和噬菌体分离时间几乎重叠。对噬菌体的基因组分析表明，它被归类为shiphoviridae。使用电子显微镜的形态观察结果也是如此。这次分离的II型链球菌的特异性噬菌体具有与感染I型链球菌的噬菌体非常相似的遗传结构。但是，II型噬菌体未感染I型和III型链球菌，被认为是血清型II菌株的特异性。 ○我们已经成功地孤立的噬菌体感染了Nocardia，这是一种传染病，是Yellowtail水产养殖的主要问题。从电子显微镜中分离出来的噬菌体形态是被归类为非常长的尾shoviridae的噬菌体。这些噬菌体的基因组分析成功。结果表明，它与已经报道的感染Gordonia的噬菌体非常相似。详细的基因组分析揭示了某些部位的遗传结构差异。孤立的噬菌体不仅感染了诺卡氏菌，还感染了Yellowtail的细菌感染，而且还感染了其他Nocardia属细菌，并且被发现具有广泛的宿主范围。