Monitoring bacteriophage DNA in aquaculture sites to predict fish bacterial diseases

监测水产养殖场中的噬菌体 DNA 以预测鱼类细菌性疾病

• 批准号: 22K19214
• 负责人: 吉田 照豊
• 金额: $ 4.16万
• 依托单位: University of Miyazaki
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-06-30 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K19214/
• 关键词: Lactococcus garvieae; Seriola quinqueradiata; ファージ; qPCR; Nocardia seriolae; Seriola dumerili; バクテリオファージ; 養殖場; 定量PCR

○ブリ養殖場より、現在流行しているII型レンサ球菌のビルレントバクテリオファージを数種類分離することに成功した。またこのファージのゲノム解析をしたところ、分離したファージはほぼ同じ遺伝構造をしていた。このファージを用いて、教室に保存しているII型レンサ球菌３００菌株のファージ型別を行ったところ、感受性の型と非感染型の2種類のファージ型別が可能となった。○II型レンサ球菌が流行する時期に、効率的に今回分離できたファージを分離することができた。流行時とファージの分離時期がほぼ重なると考えられた。ファージのゲノム解析から、Shiphoviridaeに分類されることが判明した。また、電子顕微鏡による形態観察の結果も同様であった。今回分離したII型レンサ球菌に特異的に感染するファージは、すでに発表したI型レンサ球菌に感染するファージと非常に類似した遺伝構造を有していた。しかしながら、II型ファージはI型及びIII型レンサ球菌に感染せず、血清型II型の菌株に特異的であると考えられた。○ブリ類養殖において、大きな問題となる感染症であるノカルジアに感染するファージの分離に成功した。電子顕微鏡観察から分離したファージの形態は、非常に尾部の長いShiphoviridaeに分類されるファージであった。これらのファージのゲノム解析に成功した。その結果、すでに報告のあるGordoniaに感染するファージと非常に類似したものであった。詳細なゲノム解析の結果、特定のある部位に遺伝構造の違いが認められた。今回分離したファージは、ブリの細菌感染症であるNocardia seriolaeだけではなく、他のノカルジア属細菌にも感染し、宿主範囲が広いことが判明した。

A. ブ リ farms よ り, popular now し て い る II レ ン サ aureus の ビ ル レ ン ト バ ク テ リ オ フ ァ ー ジ を several kinds separation す る こ と に success し た. ま た こ の フ ァ ー ジ の ゲ ノ ム parsing を し た と こ ろ, separating し た フ ァ ー ジ は ほ ぼ with じ heritage 伝 tectonic を し て い た. こ の フ ァ ー ジ を with い て, classroom に save し て い る II レ ン サ aureus strains 300 の フ ァ ー ジ line type don't を っ た と こ ろ, susceptibility の と non infected の 2 kinds の フ ァ ー ジ type don't が may と な っ た. す "type II レ ン サ aureus が popular に る period, the working rate of に today back to separate で き た フ ァ ー ジ を separation す る こ と が で き た. During the epidemic period, とファ とファ ジ ジ がほぼ the separation period がほぼ the なると test えられた. Youdaoplaceholder0 ファ ジ ジ ゲノム ゲノム analyze ら, Shiphoviridaeに classification される とが とが determine た. The 観 results of また and electronic 顕 micromirror による morphology 観 are the same as those of であった. Today back to separate し た II レ ン サ aureus に specific に infection す る フ ァ ー ジ は, す で に 発 table し た type I レ ン サ aureus infection に す る フ ァ ー ジ と very similar し に た heritage 伝 a し を construction て い た. し か し な が ら, type II フ ァ ー ジ は type I and type び III レ ン サ aureus infection に せ ず, serum type II の strains に specific で あ る と exam え ら れ た. .through ブ リ feed に お い て, big き な problem と な る adapting just-in-time inventory で あ る ノ カ ル ジ ア に infection す る フ ァ ー ジ の separation に successful し た. Electronic 顕 micromirror 観 examine か ら separation し た フ ァ ー ジ は の form, very long に tail の い Shiphoviridae に classification さ れ る フ ァ ー ジ で あ っ た. Youdaoplaceholder0 れら ファ ジ ジ ゲノム ゲノム analysis に success た た. そ の results, す で に report の あ る Gordonia に infection す る フ ァ ー ジ と very similar し に た も の で あ っ た. Detailed なゲノム analysis of <s:1> results, に remaining 伝 structural <s:1> violations in specific ある ある parts, が が recognition of められた. Today back to separate し た フ ァ ー ジ は, ブ リ の bacteria adapting just-in-time inventory で あ る Nocardia seriolae だ け で は な く, he の ノ カ ル ジ ア belong to bacterial に し も infection, host fei 囲 が hiroo い こ と が.at し た.