抗原抗体相互作用の動的構造解析を基盤とした高機能抗体の設計
抗原抗体相互作用の動的構造解析を基盤とした高機能抗体の設計
批准号:
13J09564
负责人:
谷中 冴子
金额:
$3.0万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2013
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2013-04-01 至 2016-03-31
中文摘要
抗原抗体の結合過程がどのように親和性や選択性へ寄与しているのかということに着目し、NMRを用いて抗原抗体相互作用の動的過程を行った。最終年度の3年目はこれまでの実験結果に基づき、高親和性抗体のデザイン手法立案を進めた。現在、抗体のFv部位の揺らぎを変化させることによる親和性向上手法について、論文化を行っているところである。また、新しいターゲットについて同様の手法を適用することが出来ないかを検討している。引き続き本テーマを進めるためには新規の研究費が必要となる。1. 変異体の設計法の提案野生型のHyHEL-10のFvは結合前の状態で大きく揺らいでいるのに対し、結合後は揺らがないということが明らかになった。そこで、結合前で揺らがない状態を達成し、結合後の状態に近づけることで、親和性を向上させることが出来ないか考えた。結合前の揺らぎを指標とし、側鎖が大きく揺らぎの大きい残基をアラニンに置換することで、揺らぎを小さくする方針を取ることとした。また、抗原抗体相互作用界面、埋没残基は直接的に相互作用や構造安定性に影響をあたえるため、変異導入候補から除外した。最終的に、揺らぐ残基全32個の中から10個を選出し、アラニン置換を導入した。その結果、2個の変異体で親和性の向上が見られた。それらの変異体についてNMRを用いた緩和分散法を適用したところ、双方について、抗体のVHドメインで顕著な揺らぎの低下が見られた。この結果は、結合前で揺らがない状態を実現することで、親和性を向上させうることを示すものである。2. 他の抗体を用いた新規デザイン法の妥当性の評価。近年、その安定性と収量の良さから、シングルドメイン抗体の創薬としての有用性が取り立たされている。そこで、シングルドメイン抗体において、揺らぎを制御することによる親和性の向上が可能であるかを検証中である。
英文摘要
抗原抗体の結合過程がどのように親和性や選択性へ寄与しているのかということに着目し、NMRを用いて抗原抗体相互作用の動的過程を行った。最終年度の3年目はこれまでの実験結果に基づき、高親和性抗体のデザイン手法立案を進めた。現在、抗体のFv部位の揺らぎを変化させることによる親和性向上手法について、論文化を行っているところである。また、新しいターゲットについて同様の手法を適用することが出来ないかを検討している。引き続き本テーマを進めるためには新規の研究費が必要となる。1. 変異体の設計法の提案野生型のHyHEL-10のFvは結合前の状態で大きく揺らいでいるのに対し、結合後は揺らがないということが明らかになった。そこで、結合前で揺らがない状態を達成し、結合後の状態に近づけることで、親和性を向上させることが出来ないか考えた。結合前の揺らぎを指標とし、側鎖が大きく揺らぎの大きい残基をアラニンに置換することで、揺らぎを小さくする方針を取ることとした。また、抗原抗体相互作用界面、埋没残基は直接的に相互作用や構造安定性に影響をあたえるため、変異導入候補から除外した。最終的に、揺らぐ残基全32個の中から10個を選出し、アラニン置換を導入した。その結果、2個の変異体で親和性の向上が見られた。それらの変異体についてNMRを用いた緩和分散法を適用したところ、双方について、抗体のVHドメインで顕著な揺らぎの低下が見られた。この結果は、結合前で揺らがない状態を実現することで、親和性を向上させうることを示すものである。2. 他の抗体を用いた新規デザイン法の妥当性の評価。近年、その安定性と収量の良さから、シングルドメイン抗体の創薬としての有用性が取り立たされている。そこで、シングルドメイン抗体において、揺らぎを制御することによる親和性の向上が可能であるかを検証中である。
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Replica-exchange molecular dynamics simulation of N-glycans in Fc complexed with FcγRIIIa
Fc 中 N-聚糖与 FcγRIIIa 复合的复制交换分子动力学模拟
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yoshitake Sakae, Takumi Yamaguchi, Tadashi Sato, Saeko Yanaka, Koichi Kato, and Yuko Okamoto]
通讯作者:
and Yuko Okamoto
動的構造解析によるヒト主要組織適合複合体の安定化機構の解明
通过动态结构分析阐明人类主要组织相容性复合物的稳定机制
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
生物物理
影响因子:
--
作者:
[馬岳林, 山尾泰, 赤岩芳彦, 谷中冴子]
通讯作者:
谷中冴子
Structural insights into protein-fate determination in cells
细胞中蛋白质命运决定的结构见解
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Koichi Kato, Maho Yagi-Utsumi, Hirokazu Yagi, Saeko Yanaka, Takumi Yamaguchi, and Tadashi Satoh]
通讯作者:
and Tadashi Satoh
NMRを用いた動的構造解析により明らかとなった、ヒト主要組織適合複合体の動的なペプチド認識及び構造維持機構
NMR动态结构分析揭示人类主要组织相容性复合物的动态肽识别和结构维持机制
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[谷中冴子, 菅瀬 謙治, 上野 貴将, 津本 浩平]
通讯作者:
津本 浩平
Dynamic stabilisation mechanism of human leukocyte antigen B*35:01
人白细胞抗原B*35:01的动态稳定机制
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Saeko Yanaka, Takamasa Ueno, Kouhei Tsumoto, and Kenji Sugase]
通讯作者:
and Kenji Sugase
共 6 条
抗体医薬の高機能化に向けた抗体の分子経絡の解読と改変
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批准号:23K24018
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$5.16万
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财政年份:2024
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负责人:谷中 冴子
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依托单位:
Deciphering and modifying the molecular meridians of antibodies to enhance the functionality of therapeutic antibodies
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批准号:22H02755
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.07万
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财政年份:2022
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负责人:谷中 冴子
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依托单位:
海外基金