シミュレーションおよび選抜試験に基づく植物育種におけるゲノミックセレクション

基于模拟和选择测试的植物育种基因组选择

基本信息

  • 批准号:
    13J06921
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.28万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2013
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2013-04-01 至 2015-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

シミュレーションを用いて明らかにしていたゲノミックセレクション(GS)の有効な育種デザインに基づき、普通ソバにおいてGSと表現型選抜(PS)の実証試験を3年間行った。PSとGSの比較、シミュレーションと実証試験における選抜効率の比較を行い、普通ソバの育種において、GSは従来のPSと比較して有効であることが示され、他の他殖性植物の育種についてもGSが有効であるという可能性が示唆された。また、連鎖不平衡のパターンによってGS予測モデルを更新する適切なタイミングが異なるなど、育種効率を上げるために重要な示唆を得た。今後、個体サイズや世代時間の長さ故にGSの有効性検証が困難であった他の他殖性植物に対しても、GSを用いた遺伝的改良を効率よく行うことができる可能性が向上したと考えられる。普通ソバの高密度連鎖地図の構築とQTL解析を行った。事前情報が乏しい作物に対してもGSを適用して高速に育種を行うことができる可能性が示された。また、普通ソバはヘテロ性が高く、研究材料とは別の集団では連鎖地図が使えない可能性があったが、本研究で完成した連鎖地図は、各座位が数マーカーによって構成されており、別集団にも適用できる可能性が高い。実際にGS育種を行う際には、その過程で人為的ミスが発生する可能性が高い。本研究では、他殖性のキャッサバの育種を想定し、「人為的ミス」の影響をシミュレーションによって評価した。育種においては、育種集団の遺伝変異の維持と人為的ミスの間のトレード・オフの関係により、少ない人為的ミスであれば、結果に大きな影響は与えないということがわかった。このことから、GSにおいては、大きなコストを投入して人為的ミスを防止・発見する必要はなく、現場での注意喚起・統計的処理による誤りの検出で十分であるということが示された。また、育種現場で使うことのできる育種シミュレーションソフトを開発した。
The results showed that there was no significant difference between GS and PS in the three years. PS and GS are compared in terms of selection efficiency, selection efficiency, selection, selection efficiency, selection, selection The linkage disequilibria and the GS prediction are updated, and the breeding rate is increased. In the future, the probability of GS being able to detect and improve the efficiency of other plants due to the long generation time of individual plants is higher than that of other plants QTL analysis for the construction of high density linkage sites in common plants The lack of prior information on crop quality and the availability of GS in high-speed breeding This study was completed with a high probability of linkage, and the number of seats was high. In fact, when GS breeding is carried out, there is a high possibility that artificial changes will occur in the process. This study aims to evaluate the effects of "artificial" on the development and breeding of allogeneic plants. Breeding, breeding group inheritance, maintenance, artificial relationship, less artificial relationship, results, influence, and However, in this regard, GS has made great efforts to prevent and detect human errors, arouse attention on the spot, and process statistics. The breeding site is open to the public.

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
ゲノミックセレクションにおけるラベリングミスの影響についてのシミュレーション研究
标记错误对基因组选择影响的模拟研究
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    矢部志央理、岩田洋佳、Jannink;Jean-Luc
  • 通讯作者:
    Jean-Luc
Genomic Selection for the Traits Expressed after Pollination in Allogamous Plants
  • DOI:
    10.2135/cropsci2013.05.0319
  • 发表时间:
    2014-07-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.3
  • 作者:
    Yabe, Shiori;Ohsawa, Ryo;Iwata, Hiroyoshi
  • 通讯作者:
    Iwata, Hiroyoshi
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    $ 1.28万
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