極限環境への進出がもたらす制約からの解放:カワゴケソウ科の多様化パターン
極限環境への進出がもたらす制約からの解放:カワゴケソウ科の多様化パターン
批准号:
13J03136
负责人:
片山 なつ
金额:
$2.76万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2013
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2013-04-01 至 2016-03-31
中文摘要
本研究は、急流域の岩の上という被子植物にとって極限ともいえる特殊な環境に生育するカワゴケソウ科植物を用い、極限環境下における制約解放がもたらす種形成・多様化機構を解明することを目的としている。そのために第三年度は、1. 景観集団遺伝学的解析による日本自生集団の遺伝構造と地理的な分布制限要因の推定、2. 制約解放による多様化の分子基盤を明らかにするために追加データの取得と解析、論文執筆を行った。1の解析より、近距離河川に分布する種では、集団間の遺伝的距離が地理的距離と相関する傾向が見られた一方、遠い河川に点在して分布する種では、距離による隔離が検出されず、顕著な集団分化が進んでいることがわかった。本科植物が河川急流域にしか生育しないことを考慮すると、生育環境とそれに付随する分布パターンが種分化・多様化に貢献したと考えられる(Katayama 2016 Am. J. Bot)。次に2の解析では、カワゴケソウ科7種と姉妹群、外群の遺伝子配列情報を取得し、2000以上の遺伝子について分子進化学的解析を行なった。その結果、科内で派生的な分類群において特定の遺伝子に限らず大部分の遺伝子で分子進化速度が上昇しており、同義置換速度、非同義置換速度がともに高くなっていることが明らかとなった。このことは、本科内で突然変異率が上昇し、集団内に遺伝的変異の供給増大が起こったこと、選択的制約の緩和により見かけ上の塩基置換速度が上がり、新たな遺伝子進化が促進された可能性が考えられる。
英文摘要
本研究は、急流域の岩の上という被子植物にとって極限ともいえる特殊な環境に生育するカワゴケソウ科植物を用い、極限環境下における制約解放がもたらす種形成・多様化機構を解明することを目的としている。そのために第三年度は、1. 景観集団遺伝学的解析による日本自生集団の遺伝構造と地理的な分布制限要因の推定、2. 制約解放による多様化の分子基盤を明らかにするために追加データの取得と解析、論文執筆を行った。1の解析より、近距離河川に分布する種では、集団間の遺伝的距離が地理的距離と相関する傾向が見られた一方、遠い河川に点在して分布する種では、距離による隔離が検出されず、顕著な集団分化が進んでいることがわかった。本科植物が河川急流域にしか生育しないことを考慮すると、生育環境とそれに付随する分布パターンが種分化・多様化に貢献したと考えられる(Katayama 2016 Am. J. Bot)。次に2の解析では、カワゴケソウ科7種と姉妹群、外群の遺伝子配列情報を取得し、2000以上の遺伝子について分子進化学的解析を行なった。その結果、科内で派生的な分類群において特定の遺伝子に限らず大部分の遺伝子で分子進化速度が上昇しており、同義置換速度、非同義置換速度がともに高くなっていることが明らかとなった。このことは、本科内で突然変異率が上昇し、集団内に遺伝的変異の供給増大が起こったこと、選択的制約の緩和により見かけ上の塩基置換速度が上がり、新たな遺伝子進化が促進された可能性が考えられる。
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片山夏的网页
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
カワゴケソウ科における分子進化速度の上昇と進化可能性
扇贝科分子进化速度和进化潜力的提高
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[坂田ゆず、Craig T, Itami J, 山崎理正,大串隆之, 片山なつ,西山智明,厚井 聡,倉田哲也,今市涼子,加藤雅啓]
通讯作者:
片山なつ,西山智明,厚井 聡,倉田哲也,今市涼子,加藤雅啓
珍奇な水生植物カワゴケソウ科における分子進化速度の上昇
临床稀有水生植物分子进化速率的提高
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Utsumi, S., 片山なつ,西山智明,厚井 聡,倉田哲也,今市涼子,加藤雅啓]
通讯作者:
片山なつ,西山智明,厚井 聡,倉田哲也,今市涼子,加藤雅啓
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片山夏的网页
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
網羅的遺伝子配列で明らかにする水生植物カワゴケソウ科多様化の鍵
综合基因测序揭示海棠科水生植物多样化的关键
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[片山なつ, 西山智明,厚井聡,倉田哲也,山田敏弘,今市涼子,加藤雅啓.]
通讯作者:
西山智明,厚井聡,倉田哲也,山田敏弘,今市涼子,加藤雅啓.
共 10 条
被子植物における発生制約の解放:根の喪失がもたらすシュートの多様化
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批准号:23K05902
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2023
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负责人:片山 なつ
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依托单位:
被子植物における分子進化速度と生態的特性の相互作用の解析
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批准号:22KJ0490
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$2.83万
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财政年份:2023
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负责人:片山 なつ
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依托单位:
分子進化速度の上昇がもたらす進化イノベーション:水生植物における平行的形態特殊化
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批准号:18J40090
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$2.58万
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财政年份:2018
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负责人:片山 なつ
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依托单位:
植物の形態進化の遺伝的機構とその進化過程の解明―カワゴケソウ科の幼植物を用いて―
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批准号:09J04889
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2009
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负责人:片山 なつ
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依托单位:
海外基金