Spatial omics technologies to map the senescent cell microenvironment

空间组学技术绘制衰老细胞微环境图

基本信息

  • 批准号:
    10384585
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 35.79万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2021-09-22 至 2023-08-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Project Summary/Abstract Cellular senescence is a biological program whereby cells exit the cell cycle, typically as a consequence of DNA damage accumulation. After exerting their beneficial effects in young individuals by playing a role in tissue homeostasis, wound healing and tumor suppression, senescent cells are recognized and cleared by the immune system in response to their senescence-associated secretory phenotype (SASP). With age, immunosurveillance becomes increasingly dysregulated, senescent cells accumulate in tissues and their SASP leads to chronic inflammation which has been linked to many age-associated diseases including neurodegeneration, diabetes, osteoarthritis, fibrosis, heart disease and cancer. In addition, radiation and chemotherapy cause the accumulation of senescent cells in both normal and cancer tissues and create a microenvironment which can promote tumor relapse. Hence, methods to characterize the diversity of senescent cells in tissues are critical to improve our understanding of their roles in both normal physiology and disease and to develop more precise and effective senolytic and senostatic interventions. We propose to develop new technologies and integrative solutions to map the spatial epigenomic, transcriptome and proteomic states of senescent cells and their microenvironment in complex tissues. In the UG3 phase, we will develop spatial genomics, transcriptomics and proteomics methodologies to delineate senescent cells in a diverse set of murine tissues, including brain, liver and adipose tissue. We will also perform feasibility studies in a limited number of human samples available through tissue banks and collaborators, and in human cell culture. Our goal is to provide a proof of principle and evaluate the specificity and sensitivity of our proposed tools, technologies and methods (TTM) to identify and characterize the heterogeneity of senescent cells in multiple tissues. In the HG3 phase, we will optimize and expand our methodology to a variety of human tissues obtained from normal samples available from tissue banks, and via collaborations with other SenNet Tissue Mapping Centers (TMCs).
项目总结/摘要 细胞衰老是一个生物学程序,细胞退出细胞周期,通常是DNA的结果。 损伤累积通过在组织中发挥作用, 体内平衡,伤口愈合和肿瘤抑制,衰老细胞被免疫系统识别和清除。 系统响应其衰老相关分泌表型(SASP)。随着年龄的增长,免疫监视 越来越失调,衰老细胞在组织中积累,它们的SASP导致慢性 炎症与许多年龄相关疾病有关,包括神经变性,糖尿病, 骨关节炎、纤维化、心脏病和癌症。此外,放疗和化疗会导致 衰老细胞在正常组织和癌组织中的积累,并创造一个微环境, 促进肿瘤复发。因此,表征组织中衰老细胞的多样性的方法对于 提高我们对它们在正常生理和疾病中作用的理解, 以及有效的抗衰老和抗衰老干预。我们建议开发新技术, 绘制衰老细胞的空间表观基因组、转录组和蛋白质组状态及其 复杂组织中的微环境在UG 3阶段,我们将开发空间基因组学,转录组学和 蛋白质组学方法来描绘衰老细胞在一组不同的小鼠组织,包括脑,肝, 和脂肪组织。我们还将在有限数量的人体样本中进行可行性研究 通过组织库和合作者,以及人类细胞培养。我们的目标是提供一个原则证明, 评估我们提出的工具、技术和方法(TTM)的特异性和灵敏度,以识别和 表征多种组织中衰老细胞的异质性。在HG 3阶段,我们将优化和 将我们的方法扩展到从组织中获得的正常样品获得的各种人体组织, 银行,并通过与其他SenNet组织映射中心(TMC)的合作。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Jian Ma其他文献

Jian Ma的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Jian Ma', 18)}}的其他基金

Spatial omics technologies to map the senescent cell microenvironment
空间组学技术绘制衰老细胞微环境图
  • 批准号:
    10907057
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
Scalable Cancer Genomics via Nanocoding and Sequencing
通过纳米编码和测序实现可扩展的癌症基因组学
  • 批准号:
    8851351
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
Scalable Cancer Genomics via Nanocoding and Sequencing
通过纳米编码和测序实现可扩展的癌症基因组学
  • 批准号:
    9110904
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
Scalable Cancer Genomics via Nanocoding and Sequencing
通过纳米编码和测序实现可扩展的癌症基因组学
  • 批准号:
    9318471
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
Computational Methods for Next-Generation Comparative Genomics
下一代比较基因组学的计算方法
  • 批准号:
    8697559
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
Computational Methods for Next-Generation Comparative Genomics
下一代比较基因组学的计算方法
  • 批准号:
    10375481
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
Computational Methods for Next-Generation Comparative Genomics
下一代比较基因组学的计算方法
  • 批准号:
    9196052
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
Computational Methods for Next-Generation Comparative Genomics
下一代比较基因组学的计算方法
  • 批准号:
    9102153
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
Computational Methods for Next-Generation Comparative Genomics
下一代比较基因组学的计算方法
  • 批准号:
    9765970
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
Computational Methods for Next-Generation Comparative Genomics
下一代比较基因组学的计算方法
  • 批准号:
    10595048
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:

相似海外基金

Deciphering the role of adipose tissue in common metabolic disease via adipose tissue proteomics
通过脂肪组织蛋白质组学解读脂肪组织在常见代谢疾病中的作用
  • 批准号:
    MR/Y013891/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
    Research Grant
ESTABLISHING THE ROLE OF ADIPOSE TISSUE INFLAMMATION IN THE REGULATION OF MUSCLE MASS IN OLDER PEOPLE
确定脂肪组织炎症在老年人肌肉质量调节中的作用
  • 批准号:
    BB/Y006542/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
    Research Grant
Canadian Alliance of Healthy Hearts and Minds: Dissecting the Pathways Linking Ectopic Adipose Tissue to Cognitive Dysfunction
加拿大健康心灵联盟:剖析异位脂肪组织与认知功能障碍之间的联系途径
  • 批准号:
    479570
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
    Operating Grants
Determinants of Longitudinal Progression of Adipose Tissue Inflammation in Individuals at High-Risk for Type 2 Diabetes: Novel Insights from Metabolomic Profiling
2 型糖尿病高危个体脂肪组织炎症纵向进展的决定因素:代谢组学分析的新见解
  • 批准号:
    488898
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
    Operating Grants
Activation of human brown adipose tissue using food ingredients that enhance the bioavailability of nitric oxide
使用增强一氧化氮生物利用度的食品成分激活人体棕色脂肪组织
  • 批准号:
    23H03323
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Development of new lung regeneration therapies by elucidating the lung regeneration mechanism of adipose tissue-derived stem cells
通过阐明脂肪组织干细胞的肺再生机制开发新的肺再生疗法
  • 批准号:
    23K08293
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
A study on the role of brown adipose tissue in the development and maintenance of skeletal muscles
棕色脂肪组织在骨骼肌发育和维持中作用的研究
  • 批准号:
    23K19922
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
Adipose Tissue T Cell Polarization and Metabolic Health in Persons Living with HIV
HIV 感染者的脂肪组织 T 细胞极化和代谢健康
  • 批准号:
    10619176
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
Estrogen Signaling in the Ventromedial Hypothalamus Modulates Adipose Tissue Metabolic Adaptation
下丘脑腹内侧区的雌激素信号调节脂肪组织代谢适应
  • 批准号:
    10604611
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
Obesity and Childhood Asthma: The Role of Adipose Tissue
肥胖和儿童哮喘:脂肪组织的作用
  • 批准号:
    10813753
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 35.79万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了