优化纳米孔测序技术中的自适应采样（“Read Until”）方法-猫眼课题宝

优化纳米孔测序技术中的自适应采样（“Read Until”）方法

批准号：

BB/N017099/1

负责人：

Matthew Loose

金额：

$38.36万

依托单位：

University of Nottingham

依托单位国家：

英国

项目类别：

Research Grant

财政年份：

2017

资助国家：

英国

项目状态：

已结题

起止时间：

2017 至 --

来源：

https://gtr.ukri.org/projects?ref=BB%2FN017099%2F1

关键词：

Adaptive sampling Read Until methods

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会议论文

Icarust, a real-time simulator for Oxford Nanopore adaptive sampling

Icarust，牛津纳米孔自适应采样的实时模拟器

DOI： 10.1101/2023.05.16.540986

发表时间： 2023

期刊：

影响因子： --

作者：

[Munro R]

通讯作者： Munro R

MinoTour, real-time monitoring and analysis for Nanopore Sequencers

MinoTour，纳米孔测序仪的实时监测和分析

DOI： 10.1101/2021.09.10.459783

发表时间： 2021

期刊：

影响因子： --

作者：

[Munro R]

通讯作者： Munro R

minoTour, real-time monitoring and analysis for nanopore sequencers.

DOI： 10.1093/bioinformatics/btab780

发表时间： 2022-01-27

期刊：

Bioinformatics (Oxford, England)

影响因子： --

作者：

[Munro R, Santos R, Payne A, Forey T, Osei S, Holmes N, Loose M]

通讯作者： Loose M

MinION Analysis and Reference Consortium: Phase 2 data release and analysis of R9.0 chemistry.

DOI： 10.12688/f1000research.11354.1

发表时间： 2017

期刊：

F1000Research

影响因子： --

作者：

[Jain M, Tyson JR, Loose M, Ip CLC, Eccles DA, O'Grady J, Malla S, Leggett RM, Wallerman O, Jansen HJ, Zalunin V, Birney E, Brown BL, Snutch TP, Olsen HE, MinION Analysis and Reference Consortium]

通讯作者： MinION Analysis and Reference Consortium

Nanopore sequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads.

DOI： 10.1038/nbt.4060

发表时间： 2018-04

期刊：

Nature biotechnology

影响因子： 46.9

作者：

[Jain M, Koren S, Miga KH, Quick J, Rand AC, Sasani TA, Tyson JR, Beggs AD, Dilthey AT, Fiddes IT, Malla S, Marriott H, Nieto T, O'Grady J, Olsen HE, Pedersen BS, Rhie A, Richardson H, Quinlan AR, Snutch TP, Tee L, Paten B, Phillippy AM, Simpson JT, Loman NJ, Loose M]

通讯作者： Loose M