A protein-transcriptome atlas of haematopoiesis across the human life span

人类生命周期造血的蛋白质转录组图谱

基本信息

  • 批准号:
    MR/S036113/1
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 66.11万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    英国
  • 项目类别:
    Research Grant
  • 财政年份:
    2018
  • 资助国家:
    英国
  • 起止时间:
    2018 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

The cell represents a fundamental unit of biology, as all of our organs are composed of cells, where cells with different specialized functions combine to provide overall functionality. Specialization of cells is perhaps best understood in the blood system, where red blood cells for example are dedicated to carrying oxygen round the body, while a myriad of specialized immune cells help to fight infections. A better understanding of the molecular features that characterize individual cells is not only essential for us to gain a better understanding of how the human body functions normally, but also to be able to design better drugs that can reverse the abnormal behaviour of cells, which causes many diseases including blood cancers and immune disorders.Recent technological innovations have made it possible to map very comprehensively the activity of all genes within single cells, at a scale of thousands of cells at the same time. We propose to utilize one of the latest protocols in this field to map both messenger RNA as well as protein levels, and thus obtain especially detailed insights into the molecular make up of over 550,000 individual blood and immune cells across the human lifespan. Through integration with the wider Human Cell Atlas Initiative, our datasets will deliver an important reference, that will serve as a platform for future studies aiming to reveal the molecular alterations that cause the misbehaviour of blood cells in a broad range of disorders including blood cancers and immune diseases.
细胞代表了生物学的基本单位,因为我们所有的器官都由细胞组成,其中具有不同专门功能的细胞联合收割机提供整体功能。细胞的特化可能在血液系统中得到最好的理解,例如,红细胞致力于将氧气运送到全身,而无数的特化免疫细胞有助于对抗感染。更好地了解表征单个细胞的分子特征不仅对我们更好地了解人体如何正常运作至关重要,而且能够设计出更好的药物来逆转细胞的异常行为,它会导致包括血癌和免疫系统紊乱在内的多种疾病。最近的技术革新使我们有可能非常全面地绘制所有基因的活动图在单个细胞内,同时在数千个细胞的尺度上。我们建议利用该领域的最新协议之一来绘制信使RNA和蛋白质水平,从而获得对人类寿命中超过550,000个个体血液和免疫细胞的分子组成的特别详细的见解。通过与更广泛的人类细胞图谱计划的整合,我们的数据集将提供一个重要的参考,这将作为未来研究的平台,旨在揭示导致血液细胞在包括血癌和免疫疾病在内的广泛疾病中行为不当的分子改变。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Additional file 1 of Coordinated changes in gene expression kinetics underlie both mouse and human erythroid maturation
基因表达动力学协调变化的附加文件 1 是小鼠和人类红系成熟的基础
  • DOI:
    10.6084/m9.figshare.14913219
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Barile M
  • 通讯作者:
    Barile M
Additional file 7 of Coordinated changes in gene expression kinetics underlie both mouse and human erythroid maturation
基因表达动力学协调变化的附加文件 7 是小鼠和人类红系成熟的基础
  • DOI:
    10.6084/m9.figshare.14913240
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Barile M
  • 通讯作者:
    Barile M
Additional file 5 of Coordinated changes in gene expression kinetics underlie both mouse and human erythroid maturation
基因表达动力学协调变化的附加文件 5 是小鼠和人类红系成熟的基础
  • DOI:
    10.6084/m9.figshare.14913231
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Barile M
  • 通讯作者:
    Barile M
Coordinated Changes in Gene Expression Kinetics Underlie both Mouse and Human Erythroid Maturation
基因表达动力学的协调变化是小鼠和人类红细胞成熟的基础
  • DOI:
    10.1101/2020.12.21.423773
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Barile M
  • 通讯作者:
    Barile M
Coordinated changes in gene expression kinetics underlie both mouse and human erythroid maturation.
基因表达动力学的协调变化是小鼠和人类红细胞成熟的基础。
  • DOI:
    10.1186/s13059-021-02414-y
  • 发表时间:
    2021-07-05
  • 期刊:
  • 影响因子:
    12.3
  • 作者:
    Barile M;Imaz-Rosshandler I;Inzani I;Ghazanfar S;Nichols J;Marioni JC;Guibentif C;Göttgens B
  • 通讯作者:
    Göttgens B
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Berthold Gottgens其他文献

GATA transcription in a small rhodamine 123(low)CD34(+) subpopulation of a peripheral blood-derived CD34(-)CD105(+) mesenchymal cell line.
外周血来源的 CD34(-)CD105( ) 间充质细胞系的小罗丹明 123(low)CD34( ) 亚群中的 GATA 转录。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2002
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.6
  • 作者:
    C. Conrad;Berthold Gottgens;S. Kinston;J. Ellwart;R. Huss
  • 通讯作者:
    R. Huss
Edinburgh Research Explorer A GWAS sequence variant for platelet volume marks an alternative DNM3 promoter in megakaryocytes near a MEIS1 binding site
爱丁堡研究探索者血小板体积的 GWAS 序列变体标记了 MEIS1 结合位点附近巨核细胞中的替代 DNM3 启动子
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Sylvia Nürnberg;A. Rendon;P. Smethurst;Dirk S. Paul;K. Voss;Jonathan N Thon;Heather Lloyd;J. Sambrook;M. R. Tijssen;J. Italiano;P. Deloukas;Berthold Gottgens;N. Soranzo;Willem H. Ouwehand
  • 通讯作者:
    Willem H. Ouwehand
p57Kip2 expands AGM HSCS non-cell autonomously via the sympathetic nervous system
  • DOI:
    10.1016/j.exphem.2017.06.060
  • 发表时间:
    2017-09-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
  • 作者:
    Katrin Ottersbach;Chrysa Kapeni;Nicola Wilson;Berthold Gottgens;Kristina Kirschner;Simon Tomlinson
  • 通讯作者:
    Simon Tomlinson
JAK/ stat signalling during normal and pathological myelopoiesis with focus on erythropoiesis and megakaryopoiesis
  • DOI:
    10.1016/j.exphem.2013.05.275
  • 发表时间:
    2013-08-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
  • 作者:
    Winnie Lau;Caia Dominicus;Rebecca Hannah;Amy Jones;Anthony Green;Berthold Gottgens
  • 通讯作者:
    Berthold Gottgens
Perturbing haematopoietic transcription factor networks and cell fate decisions using transcriptional activator-like effectors
  • DOI:
    10.1016/j.exphem.2013.05.277
  • 发表时间:
    2013-08-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
  • 作者:
    Viviane Kawata;Adam Wilkinson;Xuefei Gau;Cheuk-Ho Tsang;Hidetoshi Shimauchi;Pentao Liu;Berthold Gottgens
  • 通讯作者:
    Berthold Gottgens

Berthold Gottgens的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Berthold Gottgens', 18)}}的其他基金

Haematopoiesis in a Dish: From Tissue Dynamics to Molecular Mechanisms
培养皿中的造血作用:从组织动力学到分子机制
  • 批准号:
    MR/W031663/1
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 66.11万
  • 项目类别:
    Research Grant
The cellular immune response to B.1.1.7 variant COVID-19 deciphered by single cell multi-omics
单细胞多组学破译对 B.1.1.7 变体 COVID-19 的细胞免疫反应
  • 批准号:
    MR/W014556/1
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 66.11万
  • 项目类别:
    Research Grant
Joint Wellcome and MRC Centre, ‘Wellcome Trust – Medical Research Council Cambridge Stem Cell Institute’
Wellcome 和 MRC 联合中心、Wellcome Trust 医学研究委员会剑桥干细胞研究所
  • 批准号:
    MC_PC_17230
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 66.11万
  • 项目类别:
    Intramural
Establishment of the haemopoietic transcriptional programme: From systems approaches to molecular mechanisms
造血转录程序的建立:从系统方法到分子机制
  • 批准号:
    BB/I00050X/1
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 66.11万
  • 项目类别:
    Research Grant
Transgenic ES Cell Differentiation Systems to replace Transgenic Mouse Analysis of Tissue Specific Regulatory Elements
转基因 ES 细胞分化系统替代转基因小鼠组织特异性调控元件分析
  • 批准号:
    G0900729/1
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 66.11万
  • 项目类别:
    Research Grant
Genome-wide analysis of combinatorial cis-regulatory control of early blood progenitor cells
早期血液祖细胞顺式调控组合控制的全基因组分析
  • 批准号:
    G0900951/1
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 66.11万
  • 项目类别:
    Research Grant

相似国自然基金

白桦雄花早期发育转录组分析及重要基因功能鉴定
  • 批准号:
    31100449
  • 批准年份:
    2011
  • 资助金额:
    23.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似海外基金

Oral pathogen - mediated pro-tumorigenic transformation through disruption of an Adherens Junction - associated RNAi machinery
通过破坏粘附连接相关的 RNAi 机制,口腔病原体介导促肿瘤转化
  • 批准号:
    10752248
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 66.11万
  • 项目类别:
Project 3: 3-D Molecular Atlas of cerebral amyloid angiopathy in the aging brain with and without co-pathology
项目 3:有或没有共同病理的衰老大脑中脑淀粉样血管病的 3-D 分子图谱
  • 批准号:
    10555899
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 66.11万
  • 项目类别:
Understanding the full spectrum of epigenetic vulnerability in cancer through the delineation of DNA methylation function in gene 3' end
通过描绘基因 3 端 DNA 甲基化功能,全面了解癌症的表观遗传脆弱性
  • 批准号:
    10765365
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 66.11万
  • 项目类别:
Targeting lysine acetyltransferase MOF/KAT8 in lung cancer
靶向赖氨酸乙酰转移酶 MOF/KAT8 在肺癌中的作用
  • 批准号:
    10601761
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 66.11万
  • 项目类别:
Atlas for neuronal and glial cell types selectively vulnerable to proteinopathies during progression of Alzheimer's Disease
在阿尔茨海默病进展过程中选择性易受蛋白质病影响的神经元和神经胶质细胞类型图谱
  • 批准号:
    10667245
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 66.11万
  • 项目类别:
Characterizing and Targeting ERBB2 Mutations in Invasive Lobular Carcinoma
侵袭性小叶癌中 ERBB2 突变的特征和靶向
  • 批准号:
    10749213
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 66.11万
  • 项目类别:
Investigation of STAT2 Signaling in the tumor microenvironment
肿瘤微环境中 STAT2 信号传导的研究
  • 批准号:
    10661993
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 66.11万
  • 项目类别:
Integrative analysis to identify genomic biomarkers in HPV positive oral cancer
综合分析鉴定 HPV 阳性口腔癌的基因组生物标志物
  • 批准号:
    10666904
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 66.11万
  • 项目类别:
Esophageal gland-mediated immune evasion by the human parasite Schistosoma mansoni
人类寄生虫曼氏血吸虫食管腺介导的免疫逃避
  • 批准号:
    10797534
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 66.11万
  • 项目类别:
Leveraging Gα12 signaling to treat glioblastoma
利用 Gα12 信号传导治疗胶质母细胞瘤
  • 批准号:
    10649241
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 66.11万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了