MOLECULAR DYNAMICS FOR STUDY OF SEQUENCE SPECIFIC DNA STRUCTURE

用于研究序列特异性 DNA 结构的分子动力学

• 批准号: 6119146
• 负责人: DAVID E KONERDING
• 金额: $ 0.54万
• 依托单位: UNIVERSITY OF CALIFORNIA, SAN FRANCISCO
• 依托单位国家: 美国
• 财政年份: 1999
• 资助国家: 美国
• 起止时间: 1999-07-01 至 2000-06-30
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://reporter.nih.gov/project-details/6119146
• 关键词: biological products; biomedical resource; genome

We are investigating the use of molecular dynamics as a tool for prediction of sequence specific structure of DNA. We are using the AMBER suite of molecular dynamics programs to model solvated duplex DNA using an advanced electrostatics force field called Particle Mesh Ewald. The Computer Graphics Laboratory is instrumental to the analysis of these simulations.

我们正在研究使用分子动力学作为一种工具， DNA序列特异性结构的预测。 我们使用 模拟溶剂化双链体的AMBER分子动力学程序套件 DNA使用先进的静电力场称为粒子网格 埃瓦尔德 计算机图形实验室是工具， 分析这些模拟。