Stanford Tissue Mapping Center

斯坦福大学组织绘图中心

基本信息

  • 批准号:
    10414673
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 10万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2018
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2018-09-19 至 2022-06-30
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

HuBMAP Supplemental Research Proposal Overview We are requesting supplemental funds for two items: 1. Development of a new computational tool based on a recently developed deep-learning network called ORCA to use spatial features with single-cell expression data from CODEX to more accurately transfer cell type annotations to unlabeled CODEX datasets (50% funds are requested to fund a member from Prof. Jure Leskovec from Computer Science at Stanford University to join our efforts at the Stanford TMC). This tool has already been used to transfer cell type annotations to unlabeled HuBMAP donor small intestine and large intestine single cell CODEX data, already saving nearly 100 hours of annotations required for annotating 2 donors datasets, yet does not incorporate spatial annotations to help with cell type annotations. 2. An EvoSep Liquid Chromatography system (50% funds are requested) for scProteomics. It is one of the few systems which can run a true low nano flow rate gradient ( <100 nl/min). Low nano flow can dramatically improve sensitivity which is the key for the success of scProteomics using mass spectrometry.
HuBMAP补充研究计划概述

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Potential and risks of artificial intelligence models: Common in medicine practice and special in pediatric urology.
人工智能模型的潜力和风险:在医学实践中常见,在儿科泌尿外科中特殊。
  • DOI:
    10.1016/j.jpurol.2023.06.005
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2
  • 作者:
    Wen,Yi;Di,Huajie
  • 通讯作者:
    Di,Huajie
Foundation models for generalist medical artificial intelligence
  • DOI:
    10.1038/s41586-023-05881-4
  • 发表时间:
    2023-04-13
  • 期刊:
  • 影响因子:
    64.8
  • 作者:
    Moor, Michael;Banerjee, Oishi;Rajpurkar, Pranav
  • 通讯作者:
    Rajpurkar, Pranav
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Stanford Tissue Mapping Center
斯坦福大学组织绘图中心
  • 批准号:
    10709576
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
Harmonizing single cell and spatial transcriptomics across HuBMAP organs to generate reproducible and robust maps
协调 HuBMAP 器官的单细胞和空间转录组学,生成可重复且稳健的图谱
  • 批准号:
    10818848
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
Stanford Tissue Mapping Center
斯坦福大学组织绘图中心
  • 批准号:
    10531081
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
Stanford Tissue Mapping Center - STELLAR
斯坦福大学组织绘图中心 - STELLAR
  • 批准号:
    10818846
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
Core C: CODEX Core
核心 C:CODEX 核心
  • 批准号:
    10187130
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
Spatial-Genomic Integrative Multi-Species Analysis of Lymph Node Metastasis
淋巴结转移的空间基因组综合多物种分析
  • 批准号:
    10401199
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
Application for Supplemental Funding from HUBMAP
向 HUBMAP 申请补充资金
  • 批准号:
    10228511
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
Signaling Core
信令核心
  • 批准号:
    10181124
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
Stanford Tissue Mapping Center
斯坦福大学组织绘图中心
  • 批准号:
    10213800
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
Stanford Tissue Mapping Center
斯坦福大学组织绘图中心
  • 批准号:
    9788504
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:

相似海外基金

I-Corps: Translation potential of using machine learning to predict oxaliplatin chemotherapy benefit in early colon cancer
I-Corps:利用机器学习预测奥沙利铂化疗对早期结肠癌疗效的转化潜力
  • 批准号:
    2425300
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
    Standard Grant
The investigation of chronic alcohol consumption enhanced aging colon in elder mice and the mechanism of suppressed on aging colon tissues by sesame lignans continuous intake
长期饮酒促进老年小鼠结肠衰老的研究及持续摄入芝麻木脂素抑制结肠组织衰老的机制
  • 批准号:
    23K10904
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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使用软齿轮机构的自行式结肠镜检查机器人,可灵活地安装在结肠内
  • 批准号:
    23K17236
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Mechanisms of Serrated Colon Tumor Suppression
锯齿状结肠肿瘤抑制机制
  • 批准号:
    10681608
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
Targeting cancer stem-like cells and inflammation for colon cancer chemoprevention
针对癌症干细胞样细胞和炎症进行结肠癌化学预防
  • 批准号:
    10650910
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
Epigenetic regulation of lineage specification in colon epithelial cells
结肠上皮细胞谱系规范的表观遗传调控
  • 批准号:
    10676682
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
Bacteria-derived xenobiotics in colon cancer prevention: Link to GPR109A and colonic ketogenesis
细菌源性异生素在结肠癌预防中的作用:与 GPR109A 和结肠生酮的联系
  • 批准号:
    10737017
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
Generation of chimeric antigen receptor T cells using antibodies derived from colon cancer tumor-associated B cells.
使用源自结肠癌肿瘤相关 B 细胞的抗体生成嵌合抗原受体 T 细胞。
  • 批准号:
    23K15473
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Defining and modeling the cellular interactions for rhythmic colon motility
节律性结肠运动的细胞相互作用的定义和建模
  • 批准号:
    10711530
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
Enteric Glia is New Biological Target to Block Drug Resistance in Colon Cancer
肠胶质细胞是阻断结肠癌耐药性的新生物靶点
  • 批准号:
    10659846
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 10万
  • 项目类别:
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