Phenotypic screening using DNA-encoded libraries
使用 DNA 编码文库进行表型筛选
基本信息
- 批准号:10622655
- 负责人:
- 金额:$ 18.12万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2018
- 资助国家:美国
- 起止时间:2018-09-01 至 2022-08-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Project Summary
This project will focus on the development of a powerful new approach for the discovery of bioactive small
molecules via cell-based phenotypic screening. DNA-encoded one bead one compound libraries built on small
beads will be complexed with cells and suspended in solution. A photolabile linker will be cleaved, exposing
the cells briefly to a high local concentration of the compound on the bead to which they are attached. The cells
will be engineered to report a phenotype of interest through the increase of a fluorescent signal. Beads carrying
positive cells will be isolated by FACS and the encoding tags sequenced, revealing the structures of the hits.
Since we will use libraries of molecules capable of linking to targets covalently, the identification of the target
will be simplified greatly. This system will be used to discover novel new chemotherapy agents.
项目摘要
该项目将重点开发一种强大的新方法,用于发现生物活性小分子。
分子通过基于细胞的表型筛选。DNA编码的一珠一化合物文库构建在小
珠粒将与细胞复合并悬浮在溶液中。光不稳定的接头将被切割,暴露出
使细胞短暂地接触到它们所附着的珠粒上的高局部浓度的化合物。细胞
将被工程化以通过荧光信号的增加报告感兴趣的表型。珠携带
通过FACS分离阳性细胞,并对编码标签进行测序,揭示命中物的结构。
由于我们将使用能够与靶共价连接的分子库,因此靶的鉴定
将大大简化。该系统将用于发现新的化疗药物。
项目成果
期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Mechanistic Studies of the Multiple Myeloma and Melanoma Cell-Selective Toxicity of the Rpn13-Binding Peptoid KDT-11.
RPN13结合肽KDT-11的多发性骨髓瘤和黑色素瘤细胞选择性的机械研究。
- DOI:10.1016/j.chembiol.2020.08.008
- 发表时间:2020-11-19
- 期刊:
- 影响因子:8.6
- 作者:Dickson P;Simanski S;Ngundu JM;Kodadek T
- 通讯作者:Kodadek T
Physical and Functional Analysis of the Putative Rpn13 Inhibitor RA190.
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- DOI:10.1016/j.chembiol.2020.08.007
- 发表时间:2020-11-19
- 期刊:
- 影响因子:8.6
- 作者:Dickson P;Abegg D;Vinogradova E;Takaya J;An H;Simanski S;Cravatt BF;Adibekian A;Kodadek T
- 通讯作者:Kodadek T
Synthesis and Screening of a DNA-Encoded Library of Non-Peptidic Macrocycles.
非肽大环的DNA编码库的合成和筛选。
- DOI:10.1002/anie.202116999
- 发表时间:2022-04-25
- 期刊:
- 影响因子:16.6
- 作者:Koesema, Eric;Roy, Animesh;Paciaroni, Nicholas G.;Coito, Carlos;Tokmina-Roszyk, Michal;Kodadek, Thomas
- 通讯作者:Kodadek, Thomas
Applications and Limitations of Oxime-Linked "Split PROTACs".
- DOI:10.1002/cbic.202200275
- 发表时间:2022-09-16
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Structural characterization of a peptoid-inspired conformationally constrained oligomer (PICCO) bound to streptavidin.
与链霉亲和素结合的类肽构象限制寡聚物 (PICCO) 的结构表征。
- DOI:10.1039/d0cc02588g
- 发表时间:2020
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:McEnaney ,Patrick;Balzarini ,Madeline;Park ,Hajeung;Kodadek ,Thomas
- 通讯作者:Kodadek ,Thomas
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