Caractérisation génétique de la structure taxonomique et de la diversité fonctionnelle des communautés microbiennes

微生物结构分类学和多样性功能的表征

• 批准号: 360331-2008
• 负责人: Derome, Nicolas
• 金额: $ 2.4万
• 依托单位: Université Laval
• 依托单位国家: 加拿大
• 项目类别: Research Tools and Instruments - Category 1 (<$150,000)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 加拿大
• 起止时间: 2007-01-01 至 2008-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://www.nserc-crsng.gc.ca/ase-oro/Details-Detailles_eng.asp?id=361926
• 关键词: Caract; risation; tique; de; la

Du fait de leur biomasse gigantesque, et de leurs fonctions métaboliques diverses, les microorganismes jouent un rôle majeur dans la stabilité des écosystèmes. Cependant, notre connaissance des processus évolutifs qui structurent et maintiennent la diversité des communautés microbiennes est encore balbutiante. À l'heure où le réchauffement global accélère la détérioration de nombreux écosystèmes, il est crucial d'élucider les mécanismes d'adaptation de ces organismes, et leurs impacts sur la stabilité des écosystèmes. L'objectif à long terme de mon programme de recherche est de prédire la réponse des communautés de microorganismes aux pressions de sélection dans des contextes de changements environnementaux naturels.Les deux premiers objectifs nécessitent de caractériser génétiquement ces communautés bactériennes, tant du point de vue taxonomique que fonctionnel. L'atteinte de ses objectifs implique la conservation des échantillons de communautés naturelles, l'amplification de marqueurs taxonomiques avant séquençage; et parallèlement d'extraire l'ARN pour identifier les gènes fonctionnels. L'amplification des marqueurs génétiques nécessitera plus de 6000 réactions et la conservation des échantillons nécessite l'utilisation permanente d'un ultra-congélateur.Je demande donc au CRSNG d'appuyer l'achat de deux appareils indispensables à l'atteinte de ces objectifs cruciaux : (i) le Thermocycleur Biometra T3000 (temps d'utilisation de 120 heures/mois) est un outil incontournable pour amplifier les marqueurs ciblés. il offre trois blocs indépendants, indispensables pour mise au point de protocoles d'amplification et l'utilisation simultanée par plusieurs étudiants. (ii) l'ultra-congélateur -80 C (utilisation permanente) est essentiel à la conservation des échantillons. Il offre une grande capacité de rangement et une manipulation aisée des échantillons. L'emplacement est disponible dans mon laboratoire. Ces deux appareils constitueront une base indispensable à l'atteinte de mes objectifs à long terme et contribueront significativement à la formation de mes étudiants en évolution moléculaire et en génomique fonctionnelle.

由于微生物的多样性和代谢功能的多样性，微生物在生态系统的稳定性中发挥着重要作用。然而，我们对构成和维持微生物群落多样性的进化过程的认识仍然是一个重要问题。在全球加速生态系统退化的同时，关键是要弄清这些生物体的适应机制及其对生态系统稳定性的影响。L'objectif a long泰尔梅de mon programme de recherche est de prédire la réponse des communautés de microorganismes aux selection dans des contextes de changements nementaux naturels.Les deux premiers objectifs nécessitent de caractériser génétiquement ces communautés bactériennes，tant du point de vue taxonomique que fonctionnel. L'atteinte de ses objectifs implique la conservation des échantillons de communautés naturelles，l'amplification de marqueurs taxonomiques avant séquençage; et parallèlement d'extraire l'ARN pour identifier les gènes functionnels. L'amplification des marqueurs génétiques nécessitera plus de 6000 réactions et la conservation des échantillons nécessiite l'utilisation permanente d'un ultra-constituélateur.Je demande donc Au CRSNG d'appuyer l'achat de deux appareils inspensables à l'atteinte de ces objectifs cruciaux：（i）le Thermocycleur Biometra T3000（temps d'utilisation de 120 heures/mois）est un outil incontournable pour amplifier les marqueurs ciblés. il offre trois blocks indépendants，inspirsables to programme Au point de protocoles d'amplification et l'utilisation acquired par plusieurs étudiants. (ii)l'ultra-suspension élateur-80 C（utilisation permanente）est essentiel à la conservation des échantillons.他提供了一种测距能力和一种对炸药的操纵能力。在我的实验室里就能找到位置。这两种服装构成了实现长期目标不可或缺的基础，并对培养从事分子进化和职能经济学的学生作出了重要贡献。