Microbiontes : Interactions fonctionnelles adaptatives des alliances hôte-microbionte en réponse à des contraintes écologiques

微生物：微生物联盟与反应和约束之间的相互作用

• 批准号: RGPIN-2014-06333
• 负责人: Derome, Nicolas
• 金额: $ 1.97万
• 依托单位: Université Laval
• 依托单位国家: 加拿大
• 项目类别: Discovery Grants Program - Individual
• 财政年份: 2015
• 资助国家: 加拿大
• 起止时间: 2015-01-01 至 2016-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://www.nserc-crsng.gc.ca/ase-oro/Details-Detailles_eng.asp?id=588948
• 关键词: Microbiontes; Interactions; fonctionnelles; adaptatives; des

L'objectif général de ce programme de recherche est d'identifier des interactions fonctionnelles adaptatives des alliances hôte-microbes chez les Animaux dans des contextes écologiques contrastés afin de mieux comprendre les contributions des communautés microbiennes endogènes appelées microbiontes, à la biologie de leur hôte. Ce programme de recherche novateur cible un phénomène majeur qui façonne l'évolution du vivant: les symbioses. En effet, les Animaux ont pu évoluer pour occuper différentes niches écologiques en forgeant des alliances stratégiques avec des communautés de micro-organismes colonisant leurs surfaces corporelles. Les gènes de ces communautés microbiennes résidentes codent pour des traits qui sont absents du génome de leur hôte. Ainsi, les relations mutualistes à l'intérieur de ces communautés microbiennes résidentes d'une part et avec leur hôte, d'autre part, confèrent au «super organisme» résultant un avantage adaptatif. Ces communautés font face à des pressions de sélection très complexes : contrairement aux communautés environnementales du sol ou de l'eau, les microbiontes sont non seulement confrontés à la compétition interspécifique, mais également à des pressions de sélection inhérentes à la valeur adaptative de leur hôte. Afin de mieux comprendre et prédire le potentiel adaptatif des alliances hôte-microbiontes, il est essentiel d'identifier des interactions fonctionnelles adaptatives entre ces partenaires, soit en recherchant la signature de la sélection dans les gènes exprimés chez les symbiontes et leur hôte. Dans ce but, nous caractériserons, dans des conditions naturelles, un système modèle de populations hôte-microbionte comparables, dont certaines ont connu des conditions environnementales stables (témoin) et d'autres, une perturbation environnementale récente exerçant une forte pression de sélection : l'exposition chronique aux métaux. Celle-ci affecte autant les microorganismes que les Poissons. La perchaude, Perca flavescens, est le modèle d'hôte car les effets de la contamination métallique sur cette espèce sont bien documentés. Notre modèle d'étude est un système de quatre lacs comprenant deux sites contaminés aux métaux et deux sites témoins. Je propose cinq objectifs spécifiques de recherche qui porteront sur (1) la différenciation taxonomique et fonctionnelle de microbiontes intestinaux de Perchaudes, dans un contexte d évolution adaptative et (2) l'identification de régions génomiques de l'hôte contrôlant le recrutement des différents symbiontes. Abordé dans un contexte naturel de perturbation récente, cette thématique de recherche apportera des éléments de réponse à des questions fondamentales en évolution, et des avancées majeures dans notre compréhension de l'importance du rôle physiologique des microbiontes, tant en recherche biomédicale (obésité, maladie de Crohn, cancer colorectal) qu'en agronomie (immunité, performances zootechniques) ; ce qui assurera des opportunités de formation transdisciplinaires. À court terme, la caractérisation des interactions fonctionnelles hôte-microbionte, notamment en identifiant des réseaux taxonomiques et fonctionnels perturbés ou non, permettra de développer des outils diagnostiques de la capacité de résilience d’un microbionte. Ces applications seront très novatrices en recherche biomédicale, agronomie et ecotoxicologie. À moyen terme, l’identification de régions génétiques de l’hôte associées au recrutement ciblé de symbiontes, et à la régulation de leurs fonctions sera déterminante en agronomie pour le développement de programmes de recherche de sélection de lignées génétiques ayant la capacité de recruter un microbionte hautement résilient et résistant aux pathogènes.

目标- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -我们的研究方案是：从主要的<s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1>交换体中获取与生命有关的<s:1> <s:1>交换体：共生体。因此，这些动物不能将各种各样的变异体转化为不同的变异体；不能将变异体转化为不同的变异体；不能将变异体转化为不同的变异体；不能将变异体转化为不同的变异体；不能将变异体转化为不同的变异体；人类的遗传变异与微生物的遗传变异具有相同的特征，但遗传变异与遗传变异的遗传变异并不相同hôte。例如，我们的关系是相互的，我们的人际交往是相互的，我们的人际交往是相互的，我们的人际交往是相互的，我们的人际交往是相互的，我们的人际交往是相互的。主要的通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯通讯。Afin de mieux理解等predire le potentiel adaptatif des联盟hote-microbiontes il est essentiel d 'identifier des交互fonctionnelles adaptatives ces partenaires之间,所以在recherchant de la la签名选择在基因exprimes在他们共生者et hote。但是，不确定的条件下的交换，不确定条件下的交换，不确定条件下的交换，不确定条件下的交换，不确定条件下的交换，不确定条件下的交换，不确定条件下的交换，不确定条件下的交换，不确定条件下的交换，不确定条件下的交换。Celle-ci影响微量微生物，如泊松。La perchaude, Perca flavescens， est le modere和'hôte . La污染的影响在过去的文件中没有发生。四分之一的系统系统中有两个相同的位点，一个是被污染的，一个是被污染的，另一个是被污染的。我提出了五个目标（1)不同的<s:2> <s:2>和/或不同的<s:2>和/或不同的<s:2>和/或不同的<s:2>和/或不同的共生体的识别(2)不同的<s:2>和/或不同的<s:2>和/或不同的<s:2>和/或共生体的招募）。关于环境自然扰动的研究，关于<s:2> <s:2> <s:2>和/或其他组织的研究，关于<s:2> <s:2>或其他组织的研究，关于<s:2> <s:2>或其他组织的研究，关于<s:2> <s:2>生理和微生物的重要性的研究，关于生物和/或其他组织的研究（<s:2> /或其他组织的研究，克罗恩病，结直肠癌），关于农学（免疫，表演，动物技术）；这是一种机会的保证，它可以改变跨学科的发展。À法院期限，la caractacimationsdes相互作用的功能hôte-microbionte，在相同的条件下，<s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1>（或非）- <s:1> <s:1> <s:1>（或非）- <s:1> <s:1> <s:1>（或非）- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -。在生物化学、农艺学和生态毒理学等领域的应用具有广阔的前景。是平均terme) l 'identification德地区genetiques de l 'hote associees盟recrutement已共生者,et la监管de他们函数血清determinante en agronomie pour le开发署项目de矫揉造作的德德准则选择genetiques ayant la capacite de recruter联合国microbionte hautement弹性辅助病原体等的抵抗力。