Un séquenceur de table de nouvelle génération pour la métagénomique comparative, la génomique fonctionnelle, et la biologie des systèmes.

比较数学、基因功能和系统生物学的新世代表序列。

• 批准号: RTI-2019-00084
• 负责人: Derome, Nicolas
• 金额: $ 9.39万
• 依托单位: Université Laval
• 依托单位国家: 加拿大
• 项目类别: Research Tools and Instruments
• 财政年份: 2018
• 资助国家: 加拿大
• 起止时间: 2018-01-01 至 2019-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://www.nserc-crsng.gc.ca/ase-oro/Details-Detailles_eng.asp?id=649044
• 关键词: Un; quenceur; de; table; nouvelle

L'équipement demandé est un séquenceur de table MiSeq de Illumina qui utilise une technologie de séquençage par synthèse. Illumina est actuellement le leader mondial dans les technologies de séquençage de nouvelle génération. Le MiSeq est le plus polyvalent des séquenceurs actuellement disponibles avec le meilleur compromis entre débit, longueur des lectures et précision. De plus, sa forte capacité de multiplexage en fait l'outil de prédilection non seulement pour le séquençage massif d'amplicons (« metabarcoding ») et le génotypage (identification d'allèles rares), mais aussi pour le séquençage de novo de petits génomes, de métagénomes et de métatranscriptomes.***Les cinq équipes de chercheurs impliquées dans cette demande ont des programmes de recherche qui requièrent d'importants volumes de profilage métagénomique sur des organismes non modèles. Ce type de données nécessite une précision taxonomique élevée qui est directement dépendante de la longueur des séquences et de la précision du séquençage. Le MiSeq étant la seule plateforme de séquençage de deuxième génération actuellement disponible à répondre adéquatement à ces deux critères, son utilisation est absolument incontournable.***L'appareil sera installé et entretenu à la plateforme de séquençage de l'IBIS afin que son utilisation par le PHQ soit supervisée étroitement par le personnel qualifié de la plateforme. ***L'appareil demandé aura un impact majeur sur les programmes de recherche des cinq demandeurs puisqu'il est devenu incontournable pour des applications centrales à leur programme de recherche. Or, la sur-utilisation du seul appareil actuellement disponible occasionne des retards importants (3-6 mois) qui affectent particulièrement les travaux des PHQ de premier et deuxième cycle, compromettant la publication de leurs résultats, et conséquemment leurs succès aux demandes de bourse. ***L'acquisition d'un nouvel appareil accélèrera les programmes de recherche des demandeurs à hauteur de plusieurs mois par année, diminuera les coûts associés à certaines expériences et favorisera la formation de PHQ en nouvelles technologies de séquençage. En outre, il permettra au PHQ de s'impliquer dans la mise au point de méthodes expérimentales de pointe qui ne peuvent pas être développées présentement. **

Illumina MiSeq 表的设备需求是利用合成序列技术。 Illumina 是新世代技术的领导者。 Le MiSeq 是一种多价序列执行方法，可在借贷、讲座和精确性方面做出妥协。另外，由于在扩增序列（“元条形码”）和基因页（稀有物种鉴定）方面具有强大的多重功能，因此可以用于小基因组、元基因组和基因组的新测序。 元转录组。***在研究非模式生物体的重要资料卷所需的程序方面，需要进行一些隐含的研究。这种类型需要精确的分类标准，它取决于序列的长期性和序列的精确性。 Le MiSeq étant la seule Plateforme de séquençage de deuxième génération actuellement disponible à répondre adéquatement à ces deux Critères, son use est uncontournable.***L'appareil sera installé et entretenu à la la séquençage de l'IBIS afin que son 利用 PHQ 进行平台人员资格监督。 ***服装需求的光环对五个需求者研究项目产生不可抗力的影响，使其在研究项目的应用中心中发展得不可估量。或者，在影响重要事项（3-6 个月）的情况下，对首个和第二个周期的 PHQ 工作的影响，包括发布结果，以及交易所要求的结果。 *** 收购新服装加速了需求者研究计划，以提高我们的高级水平，减少了一些协会的某些经验，并支持 PHQ 的形成和后续技术的发展。此外，PHQ 还采用了一些实验方法来简化 PHQ 的开发过程。 **