Rôles adaptatifs des symbioses mutualistes hôte-microbiote chez les Téléostéens de l'Amazone

目标：长期研究方案：不同的生物、微生物、生物和其他生物的贡献：不同的生物、微生物和其他生物的基本方面：hôte。我们可以把“<s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1>的”和“<s:1> <s:1>的”看作是“<s:1>的”，也可以把“<s:1>的”看作是“<s:1>的”。En codant pour des traits absents du gcv . hôtes, les microbiotes . contrôlent des des lelebiologie的基本方面（dcv .发展，mcv .，免疫系统，行为）和lcv . condant pour des traits absents of gcv .，不同的ccv .，不同的ccv。重要的是，一般情况下，所有的微生物都是可变的（即微生物的核心），所有的微生物都是可变的（即微生物的过渡），所有的微生物都是可变的（即微生物的过渡）。微生物过渡性、致病性être瞬时致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性、致病性等。* * * * * *沉积le potentiel adaptatif des的共生,共生生物hote-microbiotes法院等长的terme活动d 'identifier (1) des交互fonctionnelles associees一个des变化environnementaux saisonniers品牌,(2)les基地genomiques de l 'organisme hote associees la存在et l 'activite fonctionnelle de共生体在contexte de散度适应。但是，在9个人口的系统<s:1>模型<e:1>中，有3种不同类型的<s:2> <s:2>或其他类型的<s:2> /或其他类型的<s:2> /或其他类型的<s:2> /或其他类型的<s:2> /或其他类型的<s:2> /或其他类型的<s:2> /或其他类型的<s:2> /或其他类型的<s:2> /或其他类型的<s:2> /或其他类型的<s:2> /或其他类型的<s:2> /或其他类型的。******我提出了一种方法，将它们整合为：<s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -(3)胞嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶嘧啶。Enfin， le rôle de ses symbiotics classes sera证实了mise enmilu contrôlé par des expences de transplantation racimciproques。关于微生物的贡献的重要性的研究方案：关于微生物的贡献的重要性的研究方案：关于微生物的贡献的研究方案：关于生物的研究方案：关于差异适应环境的研究方案：hôtes关于差异适应环境的研究方案。1 .与<s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1>相互作用hôte-microbiotes .与<s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1>···有关的<s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1>····在<s:1> <s:1> <s:1> <s:1>······在<s:1> <s:1> <s:1>······在<s:1> <s:1> <s:1>·····**

L'objectif à long terme de mon programme de recherche est d'expliquer les contributions des différentes communautés microbiennes endogènes, appelées microbiotes, aux aspects fondamentaux de la biologie de leur organisme hôte. Cette thématique cible un phénomène majeur en évolution, les symbioses mutualistes et cadre avec la théorie de l'holobionte. En codant pour des traits absents du génome de leurs hôtes, les microbiotes contrôlent des aspects fondamentaux de leur biologie (développement, métabolisme énergétique, immunité, comportement) et leur ont permis de s'adapter à différentes niches écologiques. Pourtant, seule une partie du microbiote est héritable (i.e. microbiote coeur) alors que l'autre est dynamique (i.e. microbiote transitoire) et très influencée par l'environnement. Ce microbiote transitoire, pouvant être instantanément modifié par l'incorporation de nouveaux symbiotes, confère à l'holobionte une capacité de réponse plus rapide et plus spécifique aux changements environnementaux que ne le permettrait le génome de l'hôte. ******élucider le potentiel adaptatif des symbioses mutualistes hôte-microbiotes à court et long terme nécessite d'identifier (1) des interactions fonctionnelles associées à des changements environnementaux saisonniers marqués, (2) les bases génomiques de l'organisme hôte associées à la présence et à l'activité fonctionnelle de symbiotes dans un contexte de divergence adaptative. Dans ce but, nous caractériserons un système modèle de 9 populations hôte-microbiote pour quatre espèces de poissons amazoniens ayant colonisé deux types d'habitats contrastés (eau noire et blanche) à la fin du Pléistocène. ******Je propose une approche intégrative et novatrice pour caractériser les systèmes hôte-microbiote ichthyens incluant : génotype hôte, activité transcriptionnelle des microbiotes clés (intestin, branchies, peau), composition taxonomique du bolus (incluant proies, parasites), activité transcriptionnelle de l'hôte, communautés microbiennes environnementales (eau, sédiments) et physicochimie de l'eau. Des études d'association pangénomique (GWAS) permettront d'identifier les bases génomiques de l'ADN nucléaire et mitochondrial associées à la présence et à l'activité fonctionnelle de symbiotes clés de phénotypes-environnements. Enfin, le rôle de ses symbiotes clés sera confirmé en milieu contrôlé par des expériences de transplants réciproques. Ce programme de recherche permettra des percées significatives dans notre compréhension de l'importance de la contribution des microbiotes à la biologie de leurs hôtes dans un contexte de divergence adaptative. Une compréhension intégrée des facteurs qui contrôlent les interactions hôte-microbiotes permettra prédire leur capacité de résilience face aux pressions anthropiques croissantes que subissent les écosystèmes et de développer des approches alternatives et durables pour maintenir la productivité des habitats de poissons dont dépendent étroitement 7 millions d'indigènes au Brésil. **