Rôles adaptatifs des symbioses mutualistes hôte-microbiote chez les Téléostéens de l'Amazone

亚马逊地区的微生物共生互利适应规则

• 批准号: RGPIN-2019-04802
• 负责人: Derome, Nicolas
• 金额: $ 3.42万
• 依托单位: Université Laval
• 依托单位国家: 加拿大
• 项目类别: Discovery Grants Program - Individual
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 加拿大
• 起止时间: 2019-01-01 至 2020-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://www.nserc-crsng.gc.ca/ase-oro/Details-Detailles_eng.asp?id=689568
• 关键词: les; adaptatifs; des; symbioses; mutualistes

L'objectif à long terme de mon programme de recherche est d'expliquer les contributions des différentes communautés microbiennes endogènes, appelées microbiotes, aux aspects fondamentaux de la biologie de leur organisme hôte. Cette thématique cible un phénomène majeur en évolution, les symbioses mutualistes et cadre avec la théorie de l'holobionte. En codant pour des traits absents du génome de leurs hôtes, les microbiotes contrôlent des aspects fondamentaux de leur biologie (développement, métabolisme énergétique, immunité, comportement) et leur ont permis de s'adapter à différentes niches écologiques. Pourtant, seule une partie du microbiote est héritable (i.e. microbiote coeur) alors que l'autre est dynamique (i.e. microbiote transitoire) et très influencée par l'environnement. Ce microbiote transitoire, pouvant être instantanément modifié par l'incorporation de nouveaux symbiotes, confère à l'holobionte une capacité de réponse plus rapide et plus spécifique aux changements environnementaux que ne le permettrait le génome de l'hôte. ******élucider le potentiel adaptatif des symbioses mutualistes hôte-microbiotes à court et long terme nécessite d'identifier (1) des interactions fonctionnelles associées à des changements environnementaux saisonniers marqués, (2) les bases génomiques de l'organisme hôte associées à la présence et à l'activité fonctionnelle de symbiotes dans un contexte de divergence adaptative. Dans ce but, nous caractériserons un système modèle de 9 populations hôte-microbiote pour quatre espèces de poissons amazoniens ayant colonisé deux types d'habitats contrastés (eau noire et blanche) à la fin du Pléistocène. ******Je propose une approche intégrative et novatrice pour caractériser les systèmes hôte-microbiote ichthyens incluant : génotype hôte, activité transcriptionnelle des microbiotes clés (intestin, branchies, peau), composition taxonomique du bolus (incluant proies, parasites), activité transcriptionnelle de l'hôte, communautés microbiennes environnementales (eau, sédiments) et physicochimie de l'eau. Des études d'association pangénomique (GWAS) permettront d'identifier les bases génomiques de l'ADN nucléaire et mitochondrial associées à la présence et à l'activité fonctionnelle de symbiotes clés de phénotypes-environnements. Enfin, le rôle de ses symbiotes clés sera confirmé en milieu contrôlé par des expériences de transplants réciproques. Ce programme de recherche permettra des percées significatives dans notre compréhension de l'importance de la contribution des microbiotes à la biologie de leurs hôtes dans un contexte de divergence adaptative. Une compréhension intégrée des facteurs qui contrôlent les interactions hôte-microbiotes permettra prédire leur capacité de résilience face aux pressions anthropiques croissantes que subissent les écosystèmes et de développer des approches alternatives et durables pour maintenir la productivité des habitats de poissons dont dépendent étroitement 7 millions d'indigènes au Brésil. **

L的目标是研究和解释S微生物群落的贡献，包括微生物、微生物和生物组织的各个方面。这是一场伟大的革命，是一场互惠互利的革命，也是L的伟大事业。从生物的各个方面(发育、代谢、免疫、运动)和S的适配器到不同的利基环境中，这些微生物的含量是不同的。可供选择的微生物(即微生物核心)反映了L最大的动力(即微生物过渡)和S对L所处环境的影响。微生物过渡、瞬时改良L的新共生体、L的完整能力以及快速和特殊的环境变化对L的影响。*但是，nous Caracériserons un Système modèle de 9种群的微生物数量与毒物的微生物数量有很大关系，它们的两种不同类型的生境对比了S(Eau Noire Et Blance)la la fin du pléistocène。*JE建议批准整合和新生的鱼类微生物体--鱼类微生物体：Génotype hôte，Actitiité转录ptionnelle des MicroBiotes CLéS(肠壁，分支，Pau)，组成分类学du bolus(包括益生菌、寄生虫)，Actiité转录ptionnelle de L‘hôte，群落作者S微年环境(Eau，Sédiments)et Physicochimie de L’eau。L的核子和线粒体的关联以及L的共生组织的活动--环境。S的血清确认环境的控制L的经验和移植的研究。生物多样性研究计划具有重要的意义，L的重要性在于微生物的贡献与生物多样性的背景相适应。Un comréhension intégrée des facteur qui Contololent le Interactive Hétete-MicroBiotes permettra prédire leur capitéde résilience Faces aux prespressitions artipiques lacrosantes que subissenes les es coesystèmes et de dedeDevelopper des Apaces Alternes et耐用品Pour Maintenir la Productive Itédes Habitats de Polibiats de Preédire Leur Capacitéde Desilience 700万d‘Ingènes au Brésil’s Approaces et Maintenir la Productitides Itédes Habats de Posisons des Dependentétrotroation 700万d‘ingènes es subissenes les au Brésil.**