Caractérisation et quantification des glomérales dans des sols agricoles et des racines des plantes cultivées

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La mycorhize est une association symbiotique entre un champignon et les racines des plantes. De nombreuses expériences ont montré que les plantes horticoles et agricoles mycorhizées sont positivement avantagées. En agriculture, la mycorhization des plantes est de plus en plus recherchée. En effet, les champignons mycorhiziens sont des organismes bénéfiques pour la plante hôte car ils augmentent, entre autres, l'absorption des éléments nutritifs tels que le phosphore, par les racines. Ils améliorent également la résistance des plantes contre les stress biotiques et abiotiques et ils ont un impact majeur sur les propriétés microbiologiques et physiques du sol. L'utilisation de champignons mycorhiziens en agriculture permet ainsi aux agriculteurs de réduire l'apport en engrais et pesticides chimiques nécessaires à l'obtention de bons rendements. Malgré l'importance des champignons mycorhiziens, il n'existe pas encore de méthode publique, fiable et rapide, disponible pour les entreprises, les organismes et les laboratoires d'analyses, permettant l'identification et la quantification des spores viables de ces champignons dans les inoculants ou dans les sols et les racines. Cette proposition fait suite à un premier projet (2010 à 2013) dont une partie des travaux a été supportée par le CRSNG et Premier Tech. Les principaux objectifs de la présente demande sont: 1) développer et valider une méthode de quantification des champignons mycorhiziens communs dans les sols agricoles et les racines des plantes cultivées à l'aide de marqueurs mitochondriaux, 2) transférer la méthode et les protocoles de quantification par PCR en temps réel afin que ceux-ci soient publiquement accessibles aux laboratoires offrant des services d'analyses aux agriculteurs.