小角X-射线散射法研究多结构域蛋白质DC-UbP和USP5的溶液结构
批准号:
10979070
项目类别:
联合基金项目
资助金额:
35.0 万元
负责人:
胡红雨
依托单位:
学科分类:
上海光源
结题年份:
2012
批准年份:
2009
项目状态:
已结题
项目参与者:
蒋蕾蕾、刘帅、杨慧、傅青山、华巍
中文摘要
DC-UbP和USP5为泛素-蛋白酶体系统中的两个重要蛋白质。DC-UbP含有两个结构域,承担泛素化底物的转运功能;而USP5为含有四个结构域的去泛素化酶,解除底物的泛素化。两蛋白质均具有调节泛素化途径的功能。依托上海同步辐射光源装置,建立小角X-射线散射(SAXS)的技术方法,并用SAXS法研究这两个与泛素途径相关的多结构域蛋白质的溶液空间结构。结合核磁共振(NMR)对于单个结构域溶液结构的解析和生物化学方法对于蛋白质相互作用及酶催化活性的测定,了解这两个蛋白质(酶)的溶液结构特征和构象变化,从而认识蛋白质相互识别和酶活性调节的分子机制。
英文摘要
本项目原设想以泛素-蛋白酶体系统中的DC-UbP和USP5两个重要蛋白质为对象,依托上海同步辐射光源装置,建立小角X-射线散射(SAXS)的技术方法,并用SAXS法研究这两个与泛素途径相关的多结构域蛋白质的溶液空间结构。结合核磁共振(NMR)对于单个结构域溶液结构的解析和生物化学方法对于蛋白质相互作用及酶催化活性的测定,了解这两个蛋白质(酶)的溶液结构特征和构象变化,从而认识蛋白质相互识别和酶活性调节的分子机制。由于上海光源的小角散射线站的样品池目前只适合固体材料研究,尚不能很好地满足液体生物大分子数据收集技术的要求,但我们还是在这方面作了初步探索。项目的个别研究内容作了适当的调整,增加了结构域复合物的溶液结构方面的内容。用NMR方法解析了DC-UbP和USP5/USP13结构域的溶液结构及与泛素链的相互作用。
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DOI:
10.1074/jbc.m110.216333
发表时间:
2011-07-15
期刊:
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:
4.8
作者:
[Jiang, Ya-Jun, Che, Mei-Xia, Hu, Hong-Yu]
通讯作者:
Hu, Hong-Yu
Length of the active-site crossover loop defines the substrate specificity of ubiquitin C-terminal hydrolases for ubiquitin chains
活性位点交叉环的长度定义了泛素 C 末端水解酶对泛素链的底物特异性。
DOI:
10.1042/bj20110699
发表时间:
2012-01-01
期刊:
BIOCHEMICAL JOURNAL
影响因子:
4.1
作者:
[Zhou, Zi-Ren, Zhang, Yu-Hang, Hu, Hong-Yu]
通讯作者:
Hu, Hong-Yu
DOI:
10.1371/journal.pone.0019763
发表时间:
2011
期刊:
PloS one
影响因子:
3.7
作者:
[Gao XC, Zhou CJ, Zhou ZR, Zhang YH, Zheng XM, Song AX, Hu HY]
通讯作者:
Hu HY
Domain analysis reveals that a deubiquitinating enzyme USP13 performs non-activating catalysis for Lys63-linked polyubiquitin.
结构域分析表明,去泛素化酶 USP13 对 Lys63 连接的多聚泛素执行非激活催化作用。
DOI:
10.1371/journal.pone.0029362
发表时间:
2011
期刊:
PloS one
影响因子:
3.7
作者:
[Zhang YH, Zhou CJ, Zhou ZR, Song AX, Hu HY]
通讯作者:
Hu HY
The C-terminal Helices of Heat Shock Protein 70 Are Essential for J-domain Binding and ATPase Activation
热休克蛋白 70 的 C 末端螺旋对于 J 结构域结合和 ATP 酶激活至关重要
DOI:
10.1074/jbc.m111.294728
发表时间:
2012-02-17
期刊:
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:
4.8
作者:
[Gao, Xue-Chao, Zhou, Chen-Jie, Hu, Hong-Yu]
通讯作者:
Hu, Hong-Yu
共 7 条
去泛素化酶USP19调控多聚谷氨酰胺蛋白积聚的分子机制
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批准号:31870764
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项目类别:面上项目
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资助金额:59.0万元
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批准年份:2018
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负责人:胡红雨
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依托单位:
核多聚腺嘌呤结合蛋白PABPN1的积聚和募集作用及分子机制
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批准号:31670782
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项目类别:面上项目
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资助金额:65.0万元
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批准年份:2016
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负责人:胡红雨
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依托单位:
多聚谷氨酰胺蛋白募集正常蛋白质的细胞效应及分子机制
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批准号:31470758
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项目类别:面上项目
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资助金额:85.0万元
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批准年份:2014
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负责人:胡红雨
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依托单位:
去泛素化酶USP19的功能调节机制及结构基础
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批准号:31270773
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项目类别:面上项目
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资助金额:80.0万元
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批准年份:2012
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负责人:胡红雨
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依托单位:
ISG15蛋白中的两个类泛素结构域的生化功能及其结构基础
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批准号:30870485
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项目类别:面上项目
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资助金额:30.0万元
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批准年份:2008
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负责人:胡红雨
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依托单位:
核磁共振法研究亨廷顿蛋白中脯氨酸丰富区域与SH3和双WW结构域的相互作用
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批准号:30670431
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项目类别:面上项目
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资助金额:30.0万元
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批准年份:2006
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负责人:胡红雨
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依托单位:
阿尔法-突触核蛋白积聚的分子机制及其细胞毒性
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批准号:30570377
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项目类别:面上项目
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资助金额:8.0万元
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批准年份:2005
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负责人:胡红雨
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依托单位:
色氨酸衍生物标记法研究蛋白质的相互作用
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批准号:30070165
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项目类别:面上项目
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资助金额:17.0万元
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批准年份:2000
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负责人:胡红雨
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依托单位:
大肠杆菌二硫键形成蛋白DsbA的结构和功能
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批准号:39700026
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:11.0万元
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批准年份:1997
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负责人:胡红雨
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依托单位:
国内基金
海外基金