人类tRNA 2’-O-核糖甲基化修饰生成的遗传机制及生物学功能研究
批准号:
31671349
项目类别:
面上项目
资助金额:
65.0 万元
负责人:
屈良鹄
依托单位:
学科分类:
C0602.基因表达及非编码序列调控
结题年份:
2020
批准年份:
2016
项目状态:
已结题
项目参与者:
李斌、许文丽、邓兵、孙文举、喻鹏、周克任、张辰旻、谭叶雅
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中文摘要
转移核糖核酸(tRNA)是细胞翻译机器的关键分子, 含有较多的修饰成分。tRNA修饰可从不同的方面影响细胞蛋白质合成,并且与人类疾病发生密切相关,但是对人类tRNA修饰生成机制及其生物学功能的了解依然相当匮乏。我们前期研究在人类基因组中鉴定了大量的功能未知的孤儿snoRNA,在此基础上,本项目拟采用计算与实验相结合的方法研究“孤儿”snoRNA的功能,从中发现和鉴定与tRNA有相互作用的向导snoRNA,解析这些snoRNA介导tRNA 2`-O-核糖甲基化修饰的新机制,进一步考察由snoRNA介导的tRNA核糖甲基化对细胞生理生化及表型的影响,阐明真核生物tRNA 核糖甲基化修饰由非编码RNA介导的遗传新机制及其生物学意义。
英文摘要
Transfer RNAs (tRNAs),the key molecules to the cell "translation machine", contain many chemical modifications. These modifications impacts protein synthesis in cells, and closely related to human disease. However, there are still a lot of challenging problems in the biogenesis mechanism and biological function of the RNA modifications. In our preliminary study, we have identified a large number of orphan snoRNAs with unknown function. On this basis, the project intends to use a combination of computational and experimental methods to study the function of the orphan snoRNAs. Discovering and identifying the orphan snoRNAs interacting with tRNAs; deciphering the new mechanism underlying snoRNA mediated ribose methylation of tRNAs; further investigating the effects of snoRNA-mediated methylation on cell physiology and biochemistry and phenotype. This study will shed insight into the new genetic mechanism of the methylation biogenesis of eukaryotic tRNAs and the biological significance of the methylation mediated by non-coding RNAs.
本项目发展了高精度RNA修饰图谱等一系列先进的RNA组学方法,系统地研究和鉴定了人细胞转录组水平RNA核糖甲基化位点,研究发现和鉴定了一批介导snRNA和tRNA 上2`-O-核糖甲基化修饰的孤儿RNA,并解析这些2`-O-核糖甲基化修饰对RNA剪接和细胞增殖的影响。本研究通过国际合作,发现了新的m6A修饰“读码器”IGF2BP及其功能,并进一步揭示了由组蛋白修饰H3K3Me3指导的mRNA转录过程中的m6A甲基化新机制。本项目还发展多种新的RNA实验方法和数据分析技术等,在转录组水平甲基化修饰位点的精准鉴定、多种非编码RNA的功能解析及其在基因表达调控和肿瘤诊疗中的应用等方面取得一批重要研究成果。以上研究结果对阐明RNA修饰的表观遗传调控新机制及其生物学意义具有重要的科学价值。
期刊论文列表
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miR-372 and miR-373 enhance the stemness of colorectal cancer cells by repressing differentiation signaling pathways.
miR-372和miR-373通过抑制分化信号通路增强结直肠癌细胞的干性
DOI:10.1002/1878-0261.12376
发表时间:2018-11
期刊:Molecular oncology
影响因子:6.6
作者:Wang LQ;Yu P;Li B;Guo YH;Liang ZR;Zheng LL;Yang JH;Xu H;Liu S;Zheng LS;Zhou H;Qu LH
通讯作者:Qu LH
MicroRNA-122 supports robust innate immunity in hepatocytes by targeting the RTKs/STAT3 signaling pathway.
MicroRNA-122 通过靶向 RTK/STAT3 信号通路支持肝细胞中强大的先天免疫。
DOI:10.7554/elife.41159
发表时间:2019
期刊:eLife
影响因子:7.7
作者:Xu Hui;Xu Shi Jun;Xie Shu Juan;Zhang Yin;Yang Jian Hua;Zhang Wei Qi;Zheng Man Ni;Zhou Hui;Qu Liang Hu
通讯作者:Qu Liang Hu
Ribosome profiling analysis identified a KRAS-interacting microprotein that represses oncogenic signaling in hepatocellular carcinoma cells
核糖体分析发现了一种与 KRAS 相互作用的微生物蛋白,可抑制肝细胞癌细胞中的致癌信号传导
DOI:10.1007/s11427-019-9580-5
发表时间:2019-06
期刊:SCIENCE CHINA Life Sciences
影响因子:--
作者:Wenli Xu;Bing Deng;Penghui Lin;Chang Liu;Bin Li;Qiaojuan Huang;Hui Zhou;Jianhua Yang;Lianghu Qu
通讯作者:Lianghu Qu
An LTR retrotransposon-derived lncRNA interacts with RNF169 to promote homologous recombination
LTR逆转录转座子衍生的lncRNA与RNF169相互作用促进同源重组
DOI:10.15252/embr.201847650
发表时间:2019-09-05
期刊:EMBO REPORTS
影响因子:7.7
作者:Deng, Bing;Xu, Wenli;Qu, Lianghu
通讯作者:Qu, Lianghu
oncoNcRNA: A Web Portal for Exploring the Non-Coding RNAs with Oncogenic Potentials in Human Cancers.
oncoNcRNA:探索人类癌症中具有致癌潜力的非编码 RNA 的门户网站
DOI:10.3390/ncrna3010007
发表时间:2017-02-07
期刊:Non-coding RNA
影响因子:4.3
作者:Wang ZL;Zhang XQ;Zhou H;Yang JH;Qu LH
通讯作者:Qu LH
Wnt/β-catenin通路调控的长非编码RNA-WTL在结肠癌干细胞中的功能与机制研究
- 批准号:31970604
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:59.0万元
- 批准年份:2019
- 负责人:屈良鹄
- 依托单位:
组织特异性microRNA介导的CUX1转录后沉默及其在发育时序调控中的作用
- 批准号:31471223
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:95.0万元
- 批准年份:2014
- 负责人:屈良鹄
- 依托单位:
Wnt/β-catenin信号通路中microRNA的表达调控及功能研究
- 批准号:31230042
- 项目类别:重点项目
- 资助金额:299.0万元
- 批准年份:2012
- 负责人:屈良鹄
- 依托单位:
miR-30对肾小管上皮细胞间质转化和凋亡的调控
- 批准号:81070589
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:40.0万元
- 批准年份:2010
- 负责人:屈良鹄
- 依托单位:
印记snoRNA基因的起源与进化及其新功能研究
- 批准号:30830066
- 项目类别:重点项目
- 资助金额:175.0万元
- 批准年份:2008
- 负责人:屈良鹄
- 依托单位:
新疆北鲵保护遗传学及中亚地区系统地理学研究
- 批准号:30771151
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:28.0万元
- 批准年份:2007
- 负责人:屈良鹄
- 依托单位:
新的microRNA的分离、鉴定及功能研究
- 批准号:30470385
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:23.0万元
- 批准年份:2004
- 负责人:屈良鹄
- 依托单位:
新疆北鲵及其相关类群的线粒体基因组与进化生物学研究
- 批准号:30370754
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:17.0万元
- 批准年份:2003
- 负责人:屈良鹄
- 依托单位:
新的RNA基因的功能与调控研究
- 批准号:30230200
- 项目类别:重点项目
- 资助金额:160.0万元
- 批准年份:2002
- 负责人:屈良鹄
- 依托单位:
新的RNA调控分子的人工合成及表达研究
- 批准号:39970171
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:14.0万元
- 批准年份:1999
- 负责人:屈良鹄
- 依托单位:
国内基金
海外基金















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