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印记snoRNA基因的起源与进化及其新功能研究

批准号：
30830066
项目类别：
重点项目
资助金额：
175.0 万元
负责人：
屈良鹄
依托单位：
中山大学
学科分类：
基因表达及非编码序列调控
结题年份：
2012
批准年份：
2008
项目状态：
已结题
项目参与者：
余春红、邵鹏、杨建华、徐辉、官道刚、张意军、廖建友、陈一龄、陈晓红
关键词：
非编码RNA基因snoRNA哺乳动物分子进化基因组印记

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中文摘要
高等哺乳动物基因组印记区包含大量的非编码RNA基因，这些非编码RNA基因如何在印记区中起源和进化及其与基因组印记发生的关系是表观遗传学中一个重要的问题。印记snoRNA属于box C/D snoRNA家族，是基因组印记区中一类重要的小分子非编码RNA，也是一个良好的研究模型。本项目以哺乳动物印记snoRNA为对象，采用先进的计算机分析与实验相结合的方法，在基因组水平系统地发掘和鉴定哺乳动物印记snoRNA，阐明印记snoRNA基因的起源时间和演化过程，研究印记snoRNA的新功能，揭示小分子非编码RNA在基因组印记中的调控作用及其进化的规律。
英文摘要
高等哺乳动物基因组印记区包含大量的非编码RNA 基因，这些非编码RNA基因如何在印记区中起源和进化及其与基因组印记发生的关系是现代表观遗传学中一个重要的问题。印记snoRNA 属于box C/D snoRNA 家族，是基因组印记区中一类重要的小分子非编码RNA，也是一个良好的研究模型。本项目以哺乳动物印记snoRNA 为对象，采用先进的计算机分析与实验相结合的方法，在基因组水平系统地发掘和鉴定哺乳动物印记snoRNA，完成了20多种动物snoRNA的基因组系统鉴定和进化分析，推测出印记snoRNA 基因的起源时间和在哺乳动物基因组的演化过程，并进一步揭示小分子非编码RNA 在基因组印记发生中的意义及其进化规律。构建了全面收入和系统发掘印记snoRNA及各种印记非编码RNA数据库ncRNAimprint以及基于新一代测序的小RNA发掘及功能分析平台DeepBase 和 starBase等。同时，在微RNA的结构、功能及在基因表达中的调控作用等方面也取得重要进展。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Genome-wide analysis of chicken snoRNAs provides unique implications for the evolution of vertebrate snoRNAs.
鸡 snoRNA 的全基因组分析为脊椎动物 snoRNA 的进化提供了独特的意义
DOI： 10.1186/1471-2164-10-86
发表时间： 2009-02-22
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影响因子： 4.4
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通讯作者： Qu LH
Liver-Enriched Transcription Factors Regulate MicroRNA-122 That Targets CUTL1 During Liver Development
富含肝脏的转录因子在肝脏发育过程中调节靶向 CUTL1 的 MicroRNA-122
DOI： 10.1002/hep.23818
发表时间： 2010-10-01
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作者： [Xu, Hui, He, Jie-Hua, Qu, Liang-Hu]
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Genome-wide evolutionary analysis of the noncoding RNA genes and noncoding DNA of Paramecium tetraurelia
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DOI： 10.1261/rna.1306009
发表时间： 2009-04-01
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影响因子： 4.5
作者： [Chen, Chun-Long, Zhou, Hui, Amar, Laurence]
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Non-coding RNAs and the acquisition of genomic imprinting in mammals
非编码 RNA 和哺乳动物基因组印记的获取
DOI： 10.1007/s11427-009-0035-2
发表时间： 2009-03
期刊： 中国科学C辑:生命科学
影响因子： --
作者： [张意军, 屈良鹄]
通讯作者： 屈良鹄
共 28 条
    Wnt/β-catenin通路调控的长非编码RNA-WTL在结肠癌干细胞中的功能与机制研究
    • 批准号：
      31970604
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      59.0万元
    • 批准年份：
      2019
    • 负责人：
      屈良鹄
    • 依托单位：
      中山大学
    人类tRNA 2’-O-核糖甲基化修饰生成的遗传机制及生物学功能研究
    • 批准号：
      31671349
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      65.0万元
    • 批准年份：
      2016
    • 负责人：
      屈良鹄
    • 依托单位：
      中山大学
    组织特异性microRNA介导的CUX1转录后沉默及其在发育时序调控中的作用
    • 批准号：
      31471223
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      95.0万元
    • 批准年份：
      2014
    • 负责人：
      屈良鹄
    • 依托单位：
      中山大学
    Wnt/β-catenin信号通路中microRNA的表达调控及功能研究
    • 批准号：
      31230042
    • 项目类别：
      重点项目
    • 资助金额：
      299.0万元
    • 批准年份：
      2012
    • 负责人：
      屈良鹄
    • 依托单位：
      中山大学
    国内基金
    海外基金