Wnt/β-catenin通路调控的长非编码RNA-WTL在结肠癌干细胞中的功能与机制研究
结题报告
批准号:
31970604
项目类别:
面上项目
资助金额:
59.0 万元
负责人:
屈良鹄
依托单位:
学科分类:
基因表达及非编码序列调控
结题年份:
2023
批准年份:
2019
项目状态:
已结题
项目参与者:
屈良鹄
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中文摘要
Wnt/β-catenin(Wnt)通路是调控细胞干性的重要信号通路。非编码RNA作为Wnt通路的重要效应因子,参与Wnt驱动的基因表达程序。但Wnt通路能够直接控制多少lncRNA的表达及其在结肠癌干细胞中的作用仍有待阐明。我们前期通过抑制结肠癌干细胞的Wnt通路,发现一批lncRNA的表达发生显著变化,其中WTL的转录调控区存在TCF/LEF1结合位点,并在结肠癌中显著上调,且与OCT4等干细胞核心基因群共表达。本项目以此为突破口,整合结肠癌干细胞中转录组和表观组高通量测序数据,系统地鉴定与研究结肠癌细胞Wnt通路相关的lncRNA及其转录调控,解析WTL及其结合蛋白的功能机制以及对结肠癌细胞干性维持与耐药的影响。这项研究将深入揭示Wnt通路介导的lncRNA信号传导及调控网络,对阐明Wnt在结肠癌干细胞中的作用机制、并提供新的结肠癌治疗策略具有重要意义。
英文摘要
Wnt/β-catenin pathway (Wnt pathway) has pivotal roles in the regulation of cell stemness. Recently, non-coding RNAs have been found to be important Wnt pathway effectors and to participate in WNT-driven gene expression programs. However, the number and functions of Wnt pathway regulated lncRNAs in colon cancer stem cells (CCSCs) remain to be elucidated. In our previous studies, the transcriptome analyses in CCSCs showed that a batch of lncRNAs were significantly altered upon inhibition of Wnt pathway activity. And a lncRNA named WTL has TCF/LEF1 binding sites within its transcription regulatory region. Moreover, WTL is upregulated in Colon Cancer and co-expressed with the core genes of stem cells including OCT4. Based on the above findings, the project will systematically identify the Wnt pathway regulated lncRNAs and analysis their transcriptional regulation based on integration of transcriptome and epitranscriptome high-throughput sequencing datasets. Furthermore, we will demonstrate the molecular mechanisms of WTL and its RNA binding proteins as well as their functions involved in Colon Cancer cells maintenance and treatment resistance. Thus the study will reveal Wnt pathway-mediated lncRNA signal transduction and regulatory network, illustrate the functions of Wnt signaling pathway in CCSCs and provide new targets for treatment of Colon Cancer.
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Single-base resolution mapping of 2'-O-methylation sites by an exoribonuclease-enriched chemical method
通过富含外切核糖核酸酶的化学方法对 2-O-甲基化位点进行单碱基分辨率作图
DOI:10.1007/s11427-022-2210-0
发表时间:--
期刊:Sci China Life Sci.
影响因子:--
作者:Ping Zhang;Junhong Huang;Wujian Zheng;Lifan Chen;Shurong Liu;Anrui Liu;Jiayi Ye;Jie Zhou;Zhirong Chen;Qiaojuan Huang;Shun Liu;Keren Zhou;Lianghu Qu;Bin Li;Jianhua Yang
通讯作者:Jianhua Yang
The functional analysis of transiently upregulated miR-101 suggests a "braking" regulatory mechanism during myogenesis
短暂上调的 miR-101 的功能分析表明,肌生成过程中存在“制动”调节机制
DOI:10.1007/s11427-020-1856-5
发表时间:2021-01-27
期刊:SCIENCE CHINA-LIFE SCIENCES
影响因子:9.1
作者:Liu, Shurong;Xie, Shujuan;Qu, Lianghu
通讯作者:Qu, Lianghu
Genome-wide identification of microRNA targets reveals positive regulation of the Hippo pathway by miR-122 during liver development.
microRNA 靶标的全基因组鉴定揭示了肝脏发育过程中 miR-122 对 Hippo 通路的正向调节
DOI:10.1038/s41419-021-04436-7
发表时间:2021-12-14
期刊:Cell death & disease
影响因子:9
作者:Zhang Y;Tan YY;Chen PP;Xu H;Xie SJ;Xu SJ;Li B;Li JH;Liu S;Yang JH;Zhou H;Qu LH
通讯作者:Qu LH
DOI:10.1007/s11427-022-2108-x
发表时间:2022-06-10
期刊:SCIENCE CHINA-LIFE SCIENCES
影响因子:9.1
作者:Li, Bin;Zheng, Lisi;Qu, Lianghu
通讯作者:Qu, Lianghu
DOI:10.1093/nar/gkad1070
发表时间:2024-01-05
期刊:Nucleic acids research
影响因子:14.9
作者:
通讯作者:
人类tRNA 2’-O-核糖甲基化修饰生成的遗传机制及生物学功能研究
  • 批准号:
    31671349
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万元
  • 批准年份:
    2016
  • 负责人:
    屈良鹄
  • 依托单位:
组织特异性microRNA介导的CUX1转录后沉默及其在发育时序调控中的作用
  • 批准号:
    31471223
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    95.0万元
  • 批准年份:
    2014
  • 负责人:
    屈良鹄
  • 依托单位:
Wnt/β-catenin信号通路中microRNA的表达调控及功能研究
  • 批准号:
    31230042
  • 项目类别:
    重点项目
  • 资助金额:
    299.0万元
  • 批准年份:
    2012
  • 负责人:
    屈良鹄
  • 依托单位:
miR-30对肾小管上皮细胞间质转化和凋亡的调控
  • 批准号:
    81070589
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    40.0万元
  • 批准年份:
    2010
  • 负责人:
    屈良鹄
  • 依托单位:
印记snoRNA基因的起源与进化及其新功能研究
  • 批准号:
    30830066
  • 项目类别:
    重点项目
  • 资助金额:
    175.0万元
  • 批准年份:
    2008
  • 负责人:
    屈良鹄
  • 依托单位:
新疆北鲵保护遗传学及中亚地区系统地理学研究
  • 批准号:
    30771151
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    28.0万元
  • 批准年份:
    2007
  • 负责人:
    屈良鹄
  • 依托单位:
新的microRNA的分离、鉴定及功能研究
  • 批准号:
    30470385
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    23.0万元
  • 批准年份:
    2004
  • 负责人:
    屈良鹄
  • 依托单位:
新疆北鲵及其相关类群的线粒体基因组与进化生物学研究
  • 批准号:
    30370754
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    17.0万元
  • 批准年份:
    2003
  • 负责人:
    屈良鹄
  • 依托单位:
新的RNA基因的功能与调控研究
  • 批准号:
    30230200
  • 项目类别:
    重点项目
  • 资助金额:
    160.0万元
  • 批准年份:
    2002
  • 负责人:
    屈良鹄
  • 依托单位:
新的RNA调控分子的人工合成及表达研究
  • 批准号:
    39970171
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    14.0万元
  • 批准年份:
    1999
  • 负责人:
    屈良鹄
  • 依托单位:
国内基金
海外基金