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基于PASS技术的egfr基因突变比例检测方法的建立及其在NSCLC患者靶向治疗预后评估中的应用研究
结题报告
批准号:
81560344
项目类别:
地区科学基金项目
资助金额:
37.0 万元
负责人:
李俊明
依托单位:
学科分类:
H2606.检验医学研究新技术与新方法
结题年份:
2019
批准年份:
2015
项目状态:
已结题
项目参与者:
江梅、王珊珊、游震宇、简正伟、黄自坤、吕小林、张长林、叶建青
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中文摘要
表皮生长因子受体(EGFR)基因突变是非小细胞肺癌(NSCLC)患者对酪氨酸激酶抑制剂(TKI)靶向治疗预后良好的预测因子。然而仍有部分存在EGFR基因突变的NSCLC患者对EGFR-TKI的治疗不敏感。课题组前期研究提示,TKI治疗的效果可能与肿瘤组织中发生EGFR突变的细胞的比例相关,但这一推测尚缺乏研究支持。平行等位基因特异性序列分析(PASS)技术是近年建立的一种突变基因检测和比例分析的新技术,目前尚未见用于肿瘤相关研究的报道。本项目拟在前期研究基础上系统建立并完善基于PASS技术的EGFR基因突变比例检测的技术平台,然后对接受EGFR-TKI治疗的NSCLC患者的肿瘤组织标本进行检测分析,结合对患者的随访探讨EGFR突变比例与靶向治疗效果的关系,同时通过建立携野生型和突变型EGFR的人NSCLC细胞株的混合培养体系,探讨常用化疗药物及EGFR-TKI对EGFR基因突变比例的影响。
英文摘要
Epidermal growth factor receptor (EGFR) mutation is a positive predictive factor indicating favorable prognosis of non-small cell lung cancer to the targeted therapy of tyrosine kinase inhibitor (TKI). However, there are still some NSCLC patients harboring mutant EGFR gene do not sensitive to EGFR-TKI treatment. Our preliminary researches suggested that the efficiency of TKI therapy might related to the proportion of tumor cells harboring mutant EGFR gene. But this hypothesis is still lack of support. Parallel allele-specific sequencing (PASS) is a new technology for mutant gene detection and mutation proportion assaying, which has not been reported in the field of tumor related researches. In this program, the technology platform of PASS is planned to be constructed and perfected on the basis of our previous studies. Then the tumor tissue samples from NSCLC patients receiving EGFR-TKI therapy are planned to be detected by PASS. The relationship between the efficiency of TKI targeted therapy and the proportion of tumor cells harboring EGFR mutation is planned to be analyzed on the basis of PASS detection and the follow-up study on NSCLC patients. The impacts of commonly used chemotherapy drugs and EGFR-TKI on the proportion of EGFR mutation are also planned to be investigated, by establishing the co-culture system of human NSCLC cell lines harboring wild type and mutant EGFR genes.
表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)是治疗NSCLC的靶向药物,但只有EGFR基因外显子发生了突变的患者才能从该靶向治疗中获益,因此EGFR基因突变已成为NSCLC靶向治疗预后良好的预测因子。然而研究显示,定性检测EGFR基因外显子突变仅能预测部分靶向治疗的效果,有20%~40%检测到EGFR突变的NSCLC患者不能从EGFR-TKI的靶向治疗中获益。有研究提示,EGFR-TKI靶向治疗的效果可能与肿瘤组织中发生EGFR基因突变的细胞的比例相关。本研究首先构建了含野生型和突变型EGFR基因序列的重组质粒,以其为模板建立了可检测突变型EGFR基因比例的等位基因特异性序列分析技术(PASS)平台。研究结果显示,PASS技术可同时用于点突变和缺失突变的检测,其最低可检出的DNA分子为1拷贝,并可从野生型EGFR基因中检出0.01%的突变型基因,而且具有良好的准确性和精密度。在此基础上,我们探讨了吉非替尼和临床常用的化疗药物对EGFR基因突变比例的影响,结果显示:吉非替尼可显著抑制EGFR突变细胞的生长,但对EGFR基因野生型的细胞没有杀伤作用,吉西他滨则对野生型NSCLC细胞具有更好的杀伤作用,顺铂对NSCLC细胞的杀伤作用没有选择性。随后我们探讨了PASS技术检测临床石蜡组织标本中EGFR基因突变比例的性能,结果显示,相较于经典的ARMS技术PASS能更敏感地检出肿瘤组织中的突变型EGFR基因。最后,我们评价了含不同比例突变型EGFR基因的患者对对EGFR-TKI治疗效果的差异,结果显示突变型EGFR基因比例大于30%的患者表现出更好的获益,而突变型EGFR基因比例小于10%的患者均不能为EGFR-TKI的治疗中获益。本研究成功构建了可准确检测突变型EGFR基因比例的PASS技术,并首次证实了突变型EGFR基因的比例对EGFR-TKI治疗效果的影响。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Mycobacterium tuberculosis Infection Induces Low-Density Granulocyte Generation by Promoting Neutrophil Extracellular Trap Formation via ROS Pathway
结核分枝杆菌感染通过 ROS 途径促进中性粒细胞胞外陷阱形成,诱导低密度粒细胞生成
DOI:10.3389/fmicb.2019.01468
发表时间:2019-07-11
期刊:FRONTIERS IN MICROBIOLOGY
影响因子:5.2
作者:Su, Rigu;Peng, Yi-ping;Li, Jun-ming
通讯作者:Li, Jun-ming
Multicentre laboratory validation of the nitrate reductase assay using liquid medium for the rapid detection of multidrug-resistant and extensively drug-resistant Mycobacterium tuberculosis
使用液体培养基快速检测多重耐药和广泛耐药结核分枝杆菌的硝酸还原酶测定的多中心实验室验证
DOI:10.1016/j.tube.2018.11.001
发表时间:2018-12-01
期刊:TUBERCULOSIS
影响因子:3.2
作者:Huang,Zikun;Du,Jinghui;Li,Junming
通讯作者:Li,Junming
Microarray Expression Profile of Circular RNAs in Peripheral Blood Mononuclear Cells from Active Tuberculosis Patients
活动性结核病患者外周血单核细胞中环状 RNA 的微阵列表达谱
DOI:10.1159/000487454
发表时间:2018-01-01
期刊:CELLULAR PHYSIOLOGY AND BIOCHEMISTRY
影响因子:--
作者:Huang, Zi-Kun;Yao, Fang-Yi;Li, Jun-Ming
通讯作者:Li, Jun-Ming
Long non-coding RNA expression profiling of macrophage line RAW264.7 infected by Mycobacterium tuberculosis
结核分枝杆菌感染的巨噬细胞系RAW264.7的长非编码RNA表达谱
DOI:10.1080/10520295.2019.1707874
发表时间:2020-02-21
期刊:BIOTECHNIC & HISTOCHEMISTRY
影响因子:1.6
作者:Huang, Zikun;Liu, Jianing;Li, Junming
通讯作者:Li, Junming
Identification of differentially expressed circular RNAs in human monocyte derived macrophages response to Mycobacterium tuberculosis infection.
人单核细胞来源的巨噬细胞对结核分枝杆菌感染反应中差异表达的环状RNA的鉴定
DOI:10.1038/s41598-017-13885-0
发表时间:2017-10-20
期刊:Scientific reports
影响因子:4.6
作者:Huang Z;Su R;Deng Z;Xu J;Peng Y;Luo Q;Li J
通讯作者:Li J
MMP13-sIL-2R轴在系统性红斑狼疮发生发展中的作用及机制研究
  • 批准号:
    82160308
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    35万元
  • 批准年份:
    2021
  • 负责人:
    李俊明
  • 依托单位:
结核分枝杆菌调控PPAR-γ诱导泡沫巨噬细胞形成的机制及其在结核病免疫中的作用
  • 批准号:
    81760002
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    36.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    李俊明
  • 依托单位:
巨噬细胞极化改变在结核性肉芽肿形成和发展中的作用及其调控机制研究
  • 批准号:
    81170006
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2011
  • 负责人:
    李俊明
  • 依托单位:
靶向自噬促进/结核分枝杆菌持留期抗原双相治疗性DNA疫苗研究
  • 批准号:
    81060001
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万元
  • 批准年份:
    2010
  • 负责人:
    李俊明
  • 依托单位:
LRG47/EBP50基因共修饰的耻垢分枝杆菌治疗性靶向载体疫苗的实验研究
  • 批准号:
    30860256
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万元
  • 批准年份:
    2008
  • 负责人:
    李俊明
  • 依托单位:
基因敲除减毒BCG靶向递送MФTACO特异性脱氧核酶表达载体治疗结核病的实验研究
  • 批准号:
    30600528
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万元
  • 批准年份:
    2006
  • 负责人:
    李俊明
  • 依托单位:
国内基金
海外基金