家族性食管癌连锁区易感突变筛选与鉴定

广东潮汕地区，尤其是南澳岛是一罕见的食管癌高发现场和相对隔离人群，针对前期鉴定出的易感位点，本项目第一步对该位点两侧基因及其调控区进行检测，未发现新的胚系突变，因此增加26食管癌大家系样本连锁区为研究对象，对其他易感位点进行测序筛选，同时增加了珍贵家系样本的全基因组测序，筛选出了大家系中与表型共分离的突变位点，并对其中一个突变位点进行了初步的功能研究。第二步执行备选方案，在家系样本中进行遗传性甲基化筛选：对一个珍贵大家系的5例样本及10例病人（含不同阶段共34例癌变样本）进行简化的表观亚硫酸氢盐测序 (Reduced Representation Bisulfite Sequencing, RRBS)，得到全基因组甲基化图谱。此外对连锁区一个目标靶基因（谷胱甘肽转移酶家族）的启动子中的一段区域进行了克隆测序，发现该基因的第5个甲基化位点在一个大家系中存在传递现象。共培养研究生4名，博士生1名，发表SCI文章6篇，获得实用新型专利1项。