家族性食管癌连锁区易感突变筛选与鉴定

批准号:
31171226
项目类别:
面上项目
资助金额:
60.0 万元
负责人:
苏敏
依托单位:
学科分类:
C0604.表型、行为与疾病的遗传学基础
结题年份:
2015
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
张国红、吴名耀、黄博、张国强、陈征山、李晓昀、黄国韦、王云胜、何海燕
国基评审专家1V1指导 中标率高出同行96.8%
结合最新热点,提供专业选题建议
深度指导申报书撰写,确保创新可行
指导项目中标800+,快速提高中标率
微信扫码咨询
中文摘要
食管癌是严重危害国人生命与健康的最常见恶性肿瘤之一。食管癌发病具有显著地域性高发与家族聚集的特征,然而至今家族性食管癌易感基因尚未被定位与鉴定。课题组前期系统完成潮汕食管癌发病流行病学,家族聚集与遗传模型分析、食管癌大家系全基因组与精细扫描连锁分析、多阶段病例-对照关联研究,首次定位出家族性食管癌连锁区以及筛选出一个关联易感位点。在此基础上,本申请项目继续从家系出发,以易感位点为轴心对其上下游基因及其调控区进行测序,筛选、鉴定出在大家系中传递并与食管癌表型共分离的突变位点。利用核心家系与家族聚集病例-对照验证突变位点,进一步深入研究突变对基因、细胞功能改变的影响,以揭示突变作用的具体分子机制;兼顾甲基化表观遗传学研究,为家族性食管癌易感个体发病风险预测模型的建立提供分子遗传学标记。
英文摘要
广东潮汕地区,尤其是南澳岛是一罕见的食管癌高发现场和相对隔离人群,针对前期鉴定出的易感位点,本项目第一步对该位点两侧基因及其调控区进行检测,未发现新的胚系突变,因此增加26食管癌大家系样本连锁区为研究对象,对其他易感位点进行测序筛选,同时增加了珍贵家系样本的全基因组测序,筛选出了大家系中与表型共分离的突变位点,并对其中一个突变位点进行了初步的功能研究。第二步执行备选方案,在家系样本中进行遗传性甲基化筛选:对一个珍贵大家系的5例样本及10例病人(含不同阶段共34例癌变样本)进行简化的表观亚硫酸氢盐测序 (Reduced Representation Bisulfite Sequencing, RRBS),得到全基因组甲基化图谱。此外对连锁区一个目标靶基因(谷胱甘肽转移酶家族)的启动子中的一段区域进行了克隆测序,发现该基因的第5个甲基化位点在一个大家系中存在传递现象。共培养研究生4名,博士生1名,发表SCI文章6篇,获得实用新型专利1项。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Esophageal intraepithelial invasion of Helicobacter pylori correlates with atypical hyperplasia
幽门螺杆菌食管上皮内侵袭与不典型增生相关
DOI:10.1002/ijc.28588
发表时间:2014-06
期刊:International Journal of Cancer
影响因子:6.4
作者:Ying, S.;Ying, S.;Su, M.;Su, M.
通讯作者:Su, M.
The clinical and biological significance of STAT1 in esophageal squamous cell carcinoma.
STAT1在食管鳞癌中的临床及生物学意义
DOI:10.1186/1471-2407-14-791
发表时间:2014-10-29
期刊:BMC cancer
影响因子:3.8
作者:Zhang Y;Molavi O;Su M;Lai R
通讯作者:Lai R
Phase-contrast X-ray CT imaging of esophagus and esophageal carcinoma.
食管和食管癌的相差 X 射线 CT 成像
DOI:10.1038/srep05332
发表时间:2014-06-18
期刊:Scientific reports
影响因子:4.6
作者:Zhang J;Tian D;Lin R;Zhou G;Peng G;Su M
通讯作者:Su M
Chronic inflammation-related DNA damage response: a driving force of gastric cardia carcinogenesis.
慢性炎症相关的DNA损伤反应:贲门癌发生的驱动力
DOI:10.18632/oncotarget.3091
发表时间:2015-02-20
期刊:Oncotarget
影响因子:--
作者:Lin R;Xiao D;Guo Y;Tian D;Yun H;Chen D;Su M
通讯作者:Su M
Patrilineal background of esophageal cancer and gastric cardia cancer patients in a Chaoshan high-risk area in China.
我国潮汕高发区食管癌、胃癌患者的父系背景
DOI:10.1371/journal.pone.0081670
发表时间:2013
期刊:PloS one
影响因子:3.7
作者:Liu S;Huang B;Huang H;Li X;Chen G;Zhang G;Lin W;Guo D;Wang J;Yu Z;Liu X;Su M
通讯作者:Su M
HIF-3α基因罕见遗传变异对食管癌变的影响及其机制研究
- 批准号:82372720
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:49万元
- 批准年份:2023
- 负责人:苏敏
- 依托单位:
基于多组学分析的食管鳞癌早期分子标记研究
- 批准号:82073290
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:55万元
- 批准年份:2020
- 负责人:苏敏
- 依托单位:
基于比较基因组学探寻潮汕食管鳞癌高危H. pylori基因型及其意义
- 批准号:81772997
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:50.0万元
- 批准年份:2017
- 负责人:苏敏
- 依托单位:
食管癌变过程中微生物宏基因组差异及机制研究
- 批准号:81572684
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:57.0万元
- 批准年份:2015
- 负责人:苏敏
- 依托单位:
家族性食管癌易感位点精细定位与单倍型TagSNPs标记的筛选
- 批准号:30771195
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:30.0万元
- 批准年份:2007
- 负责人:苏敏
- 依托单位:
家族性食管癌易感基因的染色体定位研究
- 批准号:30571028
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:25.0万元
- 批准年份:2005
- 负责人:苏敏
- 依托单位:
硒对脑神经细胞生长发育影响的分子机制研究
- 批准号:30170832
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:18.0万元
- 批准年份:2001
- 负责人:苏敏
- 依托单位:
硒对碘缺乏病区胎儿脑c-fos,c-jun基因及产物表达影响
- 批准号:39670657
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:9.0万元
- 批准年份:1996
- 负责人:苏敏
- 依托单位:
国内基金
海外基金
