家族性食管癌易感位点精细定位与单倍型TagSNPs标记的筛选

批准号：

30771195

项目类别：

面上项目

资助金额：

30.0 万元

负责人：

苏敏

依托单位：

汕头大学

学科分类：

肿瘤遗传与进化

结题年份：

2010

批准年份：

2007

项目状态：

已结题

项目参与者：

李晓昀、张国红、刘敏、石美森、梁爽、刘淑慧、温博贵、吴贤英、高玉霞

关键词：

精细扫描食管癌家系单倍型

项目摘要

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项目成果

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中文摘要

本项目组在连续8年潮汕食管癌高发区南澳岛流行病学调查、生物样本收集、内陆对照食管癌高发区生物样本收集的基础上，对已取得的食管癌流行病学与家系信息进行分离解析，分别建立了群体与家族性食管癌最适合的遗传（环境）数学模型。选用一个特大家系（五代约207人，32位患者，目前已得到75份血样，含12位患者），另加6个大家系，进行中密度STR标记核全基因组扫描，已经发现数个有意义的连锁染色体区域，其中一个LOD>2.2,NPL>2.5，(P<0.05)。本申请项目拟用密集的STR或SNP单体型标记进行精细扫描，期望将连锁区逐步缩小约1cM。再利用该区内标签SNPs（TagSNPs）标记进行较大样本遗传不相关个体与家系病例-对照关联分析，期望发现与国人家族性食管癌遗传易感单倍型标记。

英文摘要

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专著列表

科研奖励列表

会议论文列表

专利列表

Y-chromosome evidence for common ancestry of three Chinese populations with a high risk of esophageal cancer.

三个中国食管癌高危人群的共同祖先的 Y 染色体证据。

DOI： 10.1371/journal.pone.0011118

发表时间： 2010-06-15

期刊：

PloS one

影响因子： 3.7

作者：

[Huang H, Su M, Li X, Li H, Tian D, Gao Y, Guo Y]

通讯作者：

Guo Y

Association of mitochondrial haplogroup D and risk of esophageal cancer in Taihang Mountain and Chaoshan areas in China

太行山和潮汕地区线粒体单倍群D与食管癌风险的关系

DOI： 10.1016/j.mito.2010.06.005

发表时间： 2011-01-01

期刊：

MITOCHONDRION

影响因子： 4.4

作者：

[Li, Xiao-Yun, Guo, Yu-Bai, Tian, Dong-Ping]

通讯作者：

Tian, Dong-Ping

Heredity, diet and lifestyle as determining risk factors for the esophageal cancer on Nanao Island in Southern China

遗传、饮食和生活方式是中国南方七尾岛食管癌的危险因素

DOI： 10.1007/s10689-009-9300-6

发表时间： 2010-06

期刊：

Familial Cancer

影响因子： 2.2

作者：

[]

通讯作者：

Genetic heterogeneity of oesophageal cancer in high-incidence areas of southern and northern China.

中国南北方食管癌高发区的遗传异质性.

DOI： 10.1371/journal.pone.0009668

发表时间： 2010-03-15

期刊：

PloS one

影响因子： 3.7

作者：

[Guohong Z, Min S, Duenmei W, Songnian H, Min L, Jinsong L, Hongbin L, Feng Z, Dongping T, Heling Y, Zhicai L, Shiyong L, Quansheng G, Xiaoyun L, Yuxia G]

通讯作者：

Yuxia G

Potential role of minichromosome maintenance protein 2 as a screening biomarker in esophageal cancer high-risk population in China

DOI： 10.1016/j.humpath.2010.04.022

发表时间： 2011-06-01

期刊：

HUMAN PATHOLOGY

影响因子： 3.3

作者：

[Huang, Bo, Hu, Bin, Gao, Yuxia]

通讯作者：

Gao, Yuxia