使用量子点作为标记物制备探针对不同浓缩程度的玉米染色质制片进行原位杂交分析，研究量子点探针对不同浓缩程度的染色质穿透性和杂交条件的影响，并研究和探索实验中遇到的相关问题，建立最佳化量子点标记物的荧光原位杂交体系，发展单色和双色等多色原位杂交方法。比较分析量子点标记的DNA探针荧光原位杂交和常规的有机染料如FITC和Cy3等的荧光原位杂交的检测结果包括荧光强度和荧光淬灭性。分析各种寡核苷酸如(TAG)8等序列在玉米基因组上的位置和分布规律。进一步探索在玉米染色体上定位低单拷贝DNA序列如我们以前分离的玉米抗病基因类似物序列，确定他们在玉米染色体上相互之间的位置关系以及染色体分布情况，进而揭示和分析它们的染色体结构和功能的关系以及遗传进化。这套技术除了应用于玉米基因组定位分析外，也将能适用于其他植物基因组研究分析。