新一代测序对复杂亲缘关系鉴定的探索研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81330073
  • 项目类别:
    重点项目
  • 资助金额:
    290.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2502.法医物证学及法医人类学
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2018-12-31

项目摘要

One of the cutting-edge of science research for forensic genetics is identification of the complex relationships (complex kinship testing). It is important for understanding the nature of crime or civil dispute. Two persons, between them there is blood relationship or no relationship, may share two alleles, or share one allele, or do not share any allele at any observed autosomal locus. Therefore, the theories and methods of conventional parentage testing cannot be used for complex kinship testing. Development of the Next-generation sequencing (NGS) technologies, including the massively parallel sequencing and the single molecular sequencing, highlight the complex relationship identification in forensic medicine. The aims of this project are: 1) To clarify the distribution of kinship parameters dealing with the complicated relationship testing based on the Next-generation sequencing technologies. 2) To explore the contributions of different genetic markers in order to providing new genetic markers for the complex kinship testing based on the Next-generation sequencing technologies. 3) To develop new method for analysis of the complicated relationship based on new genetic markers and to provide a proof of concept and new scientific basis of the potential use for the complex kinship testing.
法医物证学的研究前沿之一是复杂亲缘关系的鉴定。无论刑事案件还是民事纠纷,这对明确案件性质至关重要。科学原理上的困惑在于,无论有亲缘关系个体间还是无亲缘关系个体间,对于任何一个常染色体上的基因座都可能共享有两个等位基因、或共享有一个等位基因、或不享有相同的等位基因。因此,复杂亲缘关系不能用传统的亲子鉴定理论与方法加以解决。新一代测序技术,包括大规模并行测序和单分子实时测序的发展,为法医学复杂亲缘关系鉴定提供了新的前景。本课题的研究目的在于:1)基于新一代测序技术阐明复杂亲缘关系中亲缘关系参数的分布规律。2) 基于新一代测序技术探索不同遗传标记的贡献,为复杂亲缘关系鉴定提供新的遗传标记。3) 建立基于新遗传标记的分析方法,为复杂亲缘关系鉴定提供新的技术手段。完成科学设想的实验验证,以期为法医学复杂亲缘关系鉴定提供新的科学基础。

结项摘要

法医物证学的研究前沿之一是复杂亲缘关系的鉴定。无论刑事案件还是民事纠纷,这对明确案件性质至关重要。复杂亲缘关系不能用传统的亲子鉴定理论与方法加以解决。本课题研究目标为基于新一代测序技术探索不同遗传标记的贡献,为复杂亲缘关系鉴定提供新的遗传标记。建立基于新遗传标记的分析方法,为复杂亲缘关系鉴定提供新的技术手段。本课题应用离子流芯片测序平台和单分子测序平台进行研究,实现了研究目标,包括: 1、通过遗传标记类型、遗传标记频率分析揭示了不同遗传标记对复杂亲缘关系鉴定的贡献与意义。2、建立了基于新一代测序技术的STR和SNP分析体系,为二级亲属等复杂亲缘关系鉴定提供了新方法。3、创建了基于新一代测序法医Y染色体分析体系,提出了新的似然率公式(家系搜索指数), 为法医复杂家系搜索提供了新技术。4、采用新一代测序分析了mtDNA异质性;建立了基于单分子测序的Y染色体DZY1的分析体系,揭示同卵双胞胎存在的差异,为同卵双胞胎鉴别提供了新途径,为法医学复杂亲缘关系鉴定提供了新的科学基础。

项目成果

期刊论文数量(32)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(2)
专利数量(9)
Massively parallel sequencing of 165 ancestry informative SNPs in two Chinese Tibetan-Burmese minority ethnicities.
对两个中国藏缅少数民族的 165 个祖先信息 SNP 进行大规模并行测序。
  • DOI:
    10.1016/j.fsigen.2018.02.009
  • 发表时间:
    2018-05
  • 期刊:
    Forensic Sci Int Genet
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zheng Wang;Guanglin He;Tao Luo;Xueying Zhao;Jing Liu;Mengge Wang;Di Zhou;Xu Chen;Chengtao Li;Yiping Hou
  • 通讯作者:
    Yiping Hou
Genetic variation and forensic characterization of highland Tibetan ethnicity reveled by autosomal STR markers
常染色体 STR 标记揭示的高原藏族遗传变异和法医学特征。
  • DOI:
    10.1007/s00414-017-1765-5
  • 发表时间:
    2018-07-01
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF LEGAL MEDICINE
  • 影响因子:
    2.1
  • 作者:
    He, Guanglin;Wang, Zheng;Hou, Yiping
  • 通讯作者:
    Hou, Yiping
Developmental validation of an X-Insertion/Deletion polymorphism panel and application in HAN population of China.
X-插入/缺失多态性panel的开发验证及其在中国汉族人群中的应用。
  • DOI:
    10.1038/srep18336
  • 发表时间:
    2015-12-14
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Zhang S;Sun K;Bian Y;Zhao Q;Wang Z;Ji C;Li C
  • 通讯作者:
    Li C
Genetic characteristics and phylogenetic analysis of three Chinese ethnic groups using the Huaxia Platinum System.
利用华夏白金系统对中国三个民族的遗传特征和系统发育进行分析。
  • DOI:
    10.1038/s41598-018-20871-7
  • 发表时间:
    2018-02-05
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Wang M;Wang Z;He G;Jia Z;Liu J;Hou Y
  • 通讯作者:
    Hou Y
Detecting a hierarchical genetic population structure via Multi-InDel markers on the X chromosome.
通过 X 染色体上的 Multi-InDel 标记检测分层遗传群体结构。
  • DOI:
    10.1038/srep32178
  • 发表时间:
    2016-08-18
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Fan GY;Ye Y;Hou YP
  • 通讯作者:
    Hou YP

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其他文献

神经肽S激活下丘脑靶神经元的分布
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    范坤
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    兰州大学学报(医学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    侯一平;王灿;谢宇平;解俊樊;惠培林;洪建平;邵玉峰
  • 通讯作者:
    邵玉峰

其他文献

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侯一平的其他基金

高分辨Y染色体遗传标记的法医复杂家系搜索研究
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相似国自然基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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