脱腺苷酸化酶CCR4和CAF1同工酶的不同性质、相互作用和功能研究
批准号:
31170757
项目类别:
面上项目
资助金额:
60.0 万元
负责人:
闫永彬
依托单位:
学科分类:
蛋白质、多肽与酶生物化学
结题年份:
2015
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
陈钊、陈哲、何光军、张丽娜、冯立奎、张家全
中文摘要
脱腺苷酸化酶广泛参与了mRNA代谢各个环节的调控,具有重要的生理意义。在各种脱腺苷酸化酶中,CCR4和CAF1参与形成的CCR4-NOT复合体被认为是一个广泛参与细胞稳态和应激的平台。然而,在这个快速发展的领域中,一个一直悬而未决的问题就是:为什么CCR4-NOT复合体中需要两个执行同样催化功能的酶,CCR4和CAF1?以前的研究大部分把这个问题转变为确定在某一生理过程中起主导作用的酶;而且以往研究很少涉及CCR4和CAF1在人体内存在着多个同工酶。本项目拟系统研究CCR4和CAF1的同工酶以及它们形成的复合物的酶学参数、稳定性、细胞定位、参与的CCR4-NOT复合体形成以及结构基础,力争阐明以下两个关键问题:两个酶组成的复合物是否比单独的酶具有优势?不同同工酶形成的复合物是否具有不同的性质?这些问题的阐明可能会为探索CCR4-NOT复合体多样性的生理功能提供新的线索。
英文摘要
脱腺苷酸化酶通过调节mRNA的poly(A)尾巴的长度,在mRNA代谢中起着重要作用,并广泛参与了多种细胞生命活动的调节。在各种生物体内,通常都存在着几种到几十种脱腺苷酸化酶,而在各种脱腺苷酸化酶中,CCR4和CAF1参与形成的CCR4-NOT复合体被认为是一个广泛参与细胞稳态和应激的平台。然而,在这个快速发展的领域中,一个一直悬而未决的问题就是:为什么细胞需要如此众多的特异性降解poly(A)的酶,而且高等生物中通常存在着更多种类的脱腺苷酸化酶。围绕着这个科学问题,本项目主要研究CCR4-NOT复合体中的两个脱腺苷酸化酶CCR4和CAF1各种同工酶的酶学特征、稳定性、细胞定位、参与的复合体形成、结构基础以及细胞功能,取得了以下成果:1)建立了脱腺苷酸化酶的一种新的SEC测活方法。我们的研究表明,SEC测活法可以用于寡聚和多聚腺苷酸的测活,可以进行酶促反应动力学分析,而且可以用于脱腺苷酸酶的催化反应方式分析。通过设定合适的对照,SEC测活法可以用于各种脱腺苷酸化酶的测活,可以用于复杂反应体系如蛋白质混合物和全细胞裂解液的测活;2)到目前为止,对脱腺苷酸化酶的结构和功能研究主要是在动物细胞和酵母中进行的,对植物中脱腺苷酸酶的性质研究的非常少。我们克隆了莱茵衣藻的crcaf1基因和杜氏盐藻的dscaf1基因。初步功能研究显示dscaf1基因可能通过转录调控快速响应胁迫,从而在mRNA代谢水平上有利于盐藻适应高盐、高温、低温、高光和紫外等极端环境中的生存;3)利用shRNA技术在胃癌细胞系MKN28中筛选了hCaf1a/hCaf1b和hCCR4a/hCCR4b四种同工酶的稳定敲低细胞系,发现四种脱腺苷酸化酶敲低以后对细胞周期具有迥异的影响,暗示hCaf1a/hCaf1b和hCCR4a/hCCR4b这四种主要的脱腺苷酸化酶可能大部分都参与了细胞周期调控,但具有不同的分子机制;4) 发现hCaf1a/hCaf1b和hCCR4a/hCCR4b的同工酶具有不同的结构特征、酶活力、金属离子依赖性和细胞内定位,研究结果显示不同的脱腺苷酸化酶同工酶并非采用同一个机制被招募到细胞内小体中。这些研究结果为探索脱腺苷酸化酶多样性的生理功能提供新的线索。
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DsCaf1 is involved in environmental stress response of Dunaliella salina
DsCaf1 参与杜氏盐藻的环境应激反应
DOI:
10.1016/j.ijbiomac.2015.10.015
发表时间:
2016-01-01
期刊:
INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES
影响因子:
8.2
作者:
[Chen, Xiang-Jun, Zhang, Xin-Hang, Yan, Yong-Bin]
通讯作者:
Yan, Yong-Bin
Biochemical and biophysical characterization of the deadenylase CrCaf1 from Chlamydomonas reinhardtii.
莱茵衣藻脱腺苷酶 CrCaf1 的生化和生物物理表征
DOI:
10.1371/journal.pone.0069582
发表时间:
2013
期刊:
PloS one
影响因子:
3.7
作者:
[Zhang JQ, He GJ, Yan YB]
通讯作者:
Yan YB
The N-terminus modulates human Caf1 activity, structural stability and aggregation
N 末端调节人 Caf1 活性、结构稳定性和聚集
DOI:
10.1016/j.ijbiomac.2012.05.032
发表时间:
2012-11-01
期刊:
INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES
影响因子:
8.2
作者:
[Feng, Li-Kui, Yan, Yong-Bin]
通讯作者:
Yan, Yong-Bin
A deadenylase assay by size-exclusion chromatography.
尺寸排阻色谱法测定脱腺苷酶
DOI:
10.1371/journal.pone.0033700
发表时间:
2012
期刊:
PloS one
影响因子:
3.7
作者:
[He GJ, Yan YB]
通讯作者:
Yan YB
Deadenylation: enzymes, regulation, and functional implications.
脱腺苷化:酶、调节和功能影响。
DOI:
10.1002/wrna.1221
发表时间:
2014
期刊:
Wiley Interdiscip Rev RNA
影响因子:
--
作者:
[Yan Yong-Bin]
通讯作者:
Yan Yong-Bin
脱腺苷酸酶参与细胞应激调控的机制研究
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批准号:32371308
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项目类别:面上项目
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资助金额:50万元
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批准年份:2023
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负责人:闫永彬
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依托单位:
脱腺苷酸酶的内质网定位及其对内质网上mRNA的翻译调控研究
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批准号:31870783
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项目类别:面上项目
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资助金额:59.0万元
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批准年份:2018
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负责人:闫永彬
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依托单位:
脑型肌酸激酶通过定位于纺锤体和中心体参与细胞有丝分裂调控的研究
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批准号:31670799
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项目类别:面上项目
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资助金额:65.0万元
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批准年份:2016
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负责人:闫永彬
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依托单位:
磷酸化对聚腺苷酸专一性核糖核酸酶结构和功能的调控
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批准号:31370797
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项目类别:面上项目
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资助金额:80.0万元
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批准年份:2013
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负责人:闫永彬
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依托单位:
蛋白质聚集的动力学机制及其转换
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批准号:30970559
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项目类别:面上项目
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资助金额:30.0万元
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批准年份:2009
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负责人:闫永彬
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依托单位:
多聚腺苷酸专一性核糖核酸酶的结构与功能
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批准号:30770477
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项目类别:面上项目
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资助金额:30.0万元
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批准年份:2007
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负责人:闫永彬
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依托单位:
蛋白质的稳定性与聚集
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批准号:30500084
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30.0万元
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批准年份:2005
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负责人:闫永彬
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依托单位:
国内基金
海外基金