课题基金 / 基金详情

HIV-1潜伏细胞中特异性微小RNA鉴定及其功能分析

批准号:
31171247
项目类别:
面上项目
资助金额:
65.0 万元
负责人:
朱焕章
依托单位:
学科分类:
基因表达及非编码序列调控
结题年份:
2015
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
韩叶飞、陈春妹、曲喜英、刘绍辉、英昊、周鑫、王鹏飞、丁冬林

项目摘要

结项摘要

项目成果

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中文摘要
人类免疫缺陷病毒(HIV)难以在体内被完全清除的一个重要原因是由HIV潜伏细胞构成的病毒储藏库的长期存在,而HIV潜伏细胞又是如何形成及维持的机制迄今仍未阐明。为此, 本研究拟利用已建立的HIV-1潜伏细胞模型,应用基因芯片技术筛选出HIV-1潜伏细胞中差异表达的miRNA并对其进一步验证;利用生物信息学方法,对筛选出的miRNA靶基因进行预测,尤其是对预测出可能与HIV-1 3′UTR作用的miRNA进行靶点验证。针对验证出的多个miRNA,合成相应miRNA 模拟物和抑制剂并分别导入潜伏细胞等模型上,检测病毒蛋白表达水平,探讨miRNA对HIV-1病毒产生、感染尤其对潜伏的影响。最后,在HIV-1感染者的静止CD4+T细胞中进行miRNA的表达及其对病毒潜伏影响的确认。本申请旨在筛选并鉴定出新的具有参与调控HIV-1潜伏功能的miRNA,以及初步揭示HIV-1潜伏的表观遗传学机制。
英文摘要
人类免疫缺陷病毒(HIV)难以在体内被完全清除的一个重要原因是由HIV潜伏细胞构成的病毒储藏库的长期存在,而HIV潜伏细胞又是如何形成及维持的机制迄今仍未阐明。为此, 本研究在潜伏感染细胞系中利用芯片及 qRT-PCR方法通过比较HIV-1潜伏感染细胞及HIV-1感染细胞和未感染细胞中miRNA的表达差异,筛选出54个在潜伏感染细胞上特异上调或下调的miRNA;利用miRNA 靶点预测网站,又对54个显著性差异的miRNA的作用靶点进行预测,发现有12个miRNA作用于HIV 3’UTR,其中有2个(miR-150)的功能已被报道证实与HIV潜伏有关,从侧面提示了我们数据的可靠。通过miRNA靶点预测软件寻找在HIV-1 LTR可能存在的靶点,最终确定6个可能参与HIV-1表达调控的候选miRNA:hsa-miR-196b,hsa-miR-29b,hsa-miR-1290,hsa-miR-320a,hsa-miR-223,hsa-miR-378*。为了检验这些miRNA能否调控HIV-1的表达,构建包含HIV-1 3’ UTR的荧光素酶报告质粒,与miRNA的模拟物(mimic)或抑制剂(inhibitor)共转HEK-293细胞,结果显示通过miRNA的模拟物上调表达miRNA,能够有效地抑制荧光素酶的表达水平,相反,通过miRNA的抑制剂下调表达miRNA后,荧光素酶表达水平明显升高,其中hsa-miR-196b和hsa-miR-1290对于HIV-1 3’ UTR驱动的荧光素酶表达水平影响较大。进一步在HEK-293T及艾滋病人外周血细胞中证实了hsa-miR-196b和hsa-miR-1290HIV对病毒产生及感染有作用。总之,我们 发现细胞内2个MiRNA(miR-196b and miR-1290)具有调控HIV潜伏的作用,不仅有助于阐明HIV-1潜伏感染的表观遗传学机制,重要的是将为HIV-1潜伏的干预治疗提供新的潜在靶点,为病毒潜伏储藏库清除的原创性治疗方案提供新的思路。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI: 10.1007/s11033-014-3456-3
发表时间: 2014-06
期刊: Molecular Biology Reports
影响因子: 2.8
作者: [Xiying Qu;Pengfei Wang;Donglin Ding;Xiaohui Wang;Gongmin Zhang;Xin Zhou;Lin Liu;Xiaoli Zhu]
通讯作者: Xiying Qu;Pengfei Wang;Donglin Ding;Xiaohui Wang;Gongmin Zhang;Xin Zhou;Lin Liu;Xiaoli Zhu
Selective histonedeacetylase inhibitor M344 intervenes in HIV-1 latency through increasing histone acetylation and activation of NF-kappaB.
选择性组蛋白脱乙酰酶抑制剂 M344 通过增加组蛋白乙酰化和 NF-kappaB 激活来干预 HIV-1 潜伏期
DOI: 10.1371/journal.pone.0048832
发表时间: 2012
期刊: PloS one
影响因子: 3.7
作者: [Ying H, Zhang Y, Zhou X, Qu X, Wang P, Liu S, Lu D, Zhu H]
通讯作者: Zhu H
DOI: 10.2174/1570162x11311010004
发表时间: 2013
期刊: Current HIV research
影响因子: 1
作者: [Xiying Qu;H. Ying;Xiaohui Wang;Chuijin Kong;Xin Zhou;Pengfei Wang;Huanzhang Zhu]
通讯作者: Xiying Qu;H. Ying;Xiaohui Wang;Chuijin Kong;Xin Zhou;Pengfei Wang;Huanzhang Zhu
Effect of CCR5-Δ32 heterozygosity on HIV-1 susceptibility: a meta-analysis.
CCR5-α32 杂合性对 HIV-1 易感性的影响:荟萃分析
DOI: 10.1371/journal.pone.0035020
发表时间: 2012
期刊: PloS one
影响因子: 3.7
作者: [Liu S, Kong C, Wu J, Ying H, Zhu H]
通讯作者: Zhu H
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    新型冠状病毒感染细胞关键靶点及作用机制研究
    • 批准号:
      82041001
    • 项目类别:
      专项基金项目
    • 资助金额:
      150万元
    • 批准年份:
      2020
    • 负责人:
      朱焕章
    • 依托单位:
    利用Cas9大规模基因敲除技术在HIV-1潜伏细胞上筛选及鉴定与HIV潜伏相关的关键宿主基因
    • 批准号:
      31771484
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      60.0万元
    • 批准年份:
      2017
    • 负责人:
      朱焕章
    • 依托单位:
    锌指蛋白核酸内切酶在HIV感染细胞及潜伏细胞上介导整合HIV前病毒DNA有效切除
    • 批准号:
      31271418
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      80.0万元
    • 批准年份:
      2012
    • 负责人:
      朱焕章
    • 依托单位:
    HIV-1潜伏感染的转基因小鼠模型及其表观遗传学研究
    • 批准号:
      30972609
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      8.0万元
    • 批准年份:
      2009
    • 负责人:
      朱焕章
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金