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HIV-1潜伏细胞中特异性微小RNA鉴定及其功能分析
结题报告
批准号:
31171247
项目类别:
面上项目
资助金额:
65.0 万元
负责人:
朱焕章
依托单位:
学科分类:
C0602.基因表达及非编码序列调控
结题年份:
2015
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
韩叶飞、陈春妹、曲喜英、刘绍辉、英昊、周鑫、王鹏飞、丁冬林
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中文摘要
人类免疫缺陷病毒(HIV)难以在体内被完全清除的一个重要原因是由HIV潜伏细胞构成的病毒储藏库的长期存在,而HIV潜伏细胞又是如何形成及维持的机制迄今仍未阐明。为此, 本研究拟利用已建立的HIV-1潜伏细胞模型,应用基因芯片技术筛选出HIV-1潜伏细胞中差异表达的miRNA并对其进一步验证;利用生物信息学方法,对筛选出的miRNA靶基因进行预测,尤其是对预测出可能与HIV-1 3′UTR作用的miRNA进行靶点验证。针对验证出的多个miRNA,合成相应miRNA 模拟物和抑制剂并分别导入潜伏细胞等模型上,检测病毒蛋白表达水平,探讨miRNA对HIV-1病毒产生、感染尤其对潜伏的影响。最后,在HIV-1感染者的静止CD4+T细胞中进行miRNA的表达及其对病毒潜伏影响的确认。本申请旨在筛选并鉴定出新的具有参与调控HIV-1潜伏功能的miRNA,以及初步揭示HIV-1潜伏的表观遗传学机制。
英文摘要
人类免疫缺陷病毒(HIV)难以在体内被完全清除的一个重要原因是由HIV潜伏细胞构成的病毒储藏库的长期存在,而HIV潜伏细胞又是如何形成及维持的机制迄今仍未阐明。为此, 本研究在潜伏感染细胞系中利用芯片及 qRT-PCR方法通过比较HIV-1潜伏感染细胞及HIV-1感染细胞和未感染细胞中miRNA的表达差异,筛选出54个在潜伏感染细胞上特异上调或下调的miRNA;利用miRNA 靶点预测网站,又对54个显著性差异的miRNA的作用靶点进行预测,发现有12个miRNA作用于HIV 3’UTR,其中有2个(miR-150)的功能已被报道证实与HIV潜伏有关,从侧面提示了我们数据的可靠。通过miRNA靶点预测软件寻找在HIV-1 LTR可能存在的靶点,最终确定6个可能参与HIV-1表达调控的候选miRNA:hsa-miR-196b,hsa-miR-29b,hsa-miR-1290,hsa-miR-320a,hsa-miR-223,hsa-miR-378*。为了检验这些miRNA能否调控HIV-1的表达,构建包含HIV-1 3’ UTR的荧光素酶报告质粒,与miRNA的模拟物(mimic)或抑制剂(inhibitor)共转HEK-293细胞,结果显示通过miRNA的模拟物上调表达miRNA,能够有效地抑制荧光素酶的表达水平,相反,通过miRNA的抑制剂下调表达miRNA后,荧光素酶表达水平明显升高,其中hsa-miR-196b和hsa-miR-1290对于HIV-1 3’ UTR驱动的荧光素酶表达水平影响较大。进一步在HEK-293T及艾滋病人外周血细胞中证实了hsa-miR-196b和hsa-miR-1290HIV对病毒产生及感染有作用。总之,我们 发现细胞内2个MiRNA(miR-196b and miR-1290)具有调控HIV潜伏的作用,不仅有助于阐明HIV-1潜伏感染的表观遗传学机制,重要的是将为HIV-1潜伏的干预治疗提供新的潜在靶点,为病毒潜伏储藏库清除的原创性治疗方案提供新的思路。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:10.1007/s11033-014-3456-3
发表时间:2014-06
期刊:Molecular Biology Reports
影响因子:2.8
作者:Xiying Qu;Pengfei Wang;Donglin Ding;Xiaohui Wang;Gongmin Zhang;Xin Zhou;Lin Liu;Xiaoli Zhu
通讯作者:Xiying Qu;Pengfei Wang;Donglin Ding;Xiaohui Wang;Gongmin Zhang;Xin Zhou;Lin Liu;Xiaoli Zhu
Selective histonedeacetylase inhibitor M344 intervenes in HIV-1 latency through increasing histone acetylation and activation of NF-kappaB.
选择性组蛋白脱乙酰酶抑制剂 M344 通过增加组蛋白乙酰化和 NF-kappaB 激活来干预 HIV-1 潜伏期
DOI:10.1371/journal.pone.0048832
发表时间:2012
期刊:PloS one
影响因子:3.7
作者:Ying H;Zhang Y;Zhou X;Qu X;Wang P;Liu S;Lu D;Zhu H
通讯作者:Zhu H
DOI:10.2174/1570162x11311010004
发表时间:2013
期刊:Current HIV research
影响因子:1
作者:Xiying Qu;H. Ying;Xiaohui Wang;Chuijin Kong;Xin Zhou;Pengfei Wang;Huanzhang Zhu
通讯作者:Xiying Qu;H. Ying;Xiaohui Wang;Chuijin Kong;Xin Zhou;Pengfei Wang;Huanzhang Zhu
Effect of CCR5-Δ32 heterozygosity on HIV-1 susceptibility: a meta-analysis.
CCR5-α32 杂合性对 HIV-1 易感性的影响:荟萃分析
DOI:10.1371/journal.pone.0035020
发表时间:2012
期刊:PloS one
影响因子:3.7
作者:Liu S;Kong C;Wu J;Ying H;Zhu H
通讯作者:Zhu H
DOI:--
发表时间:2012
期刊:Current HIV Research
影响因子:1
作者:Li;L.;C. Qiu (co-first);A. Liu;M. Zhou;Z. Han;X. Zhang;J. Xu;H. Zhu
通讯作者:H. Zhu
新型冠状病毒感染细胞关键靶点及作用机制研究
  • 批准号:
    82041001
  • 项目类别:
    专项基金项目
  • 资助金额:
    150万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    朱焕章
  • 依托单位:
利用Cas9大规模基因敲除技术在HIV-1潜伏细胞上筛选及鉴定与HIV潜伏相关的关键宿主基因
  • 批准号:
    31771484
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    朱焕章
  • 依托单位:
锌指蛋白核酸内切酶在HIV感染细胞及潜伏细胞上介导整合HIV前病毒DNA有效切除
  • 批准号:
    31271418
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万元
  • 批准年份:
    2012
  • 负责人:
    朱焕章
  • 依托单位:
HIV-1潜伏感染的转基因小鼠模型及其表观遗传学研究
  • 批准号:
    30972609
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    8.0万元
  • 批准年份:
    2009
  • 负责人:
    朱焕章
  • 依托单位:
单纯疱疹病毒与ФC31整合酶的杂合性扩增子载体在哺乳细胞上介导位点特异整合的研究
  • 批准号:
    30671190
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    24.0万元
  • 批准年份:
    2006
  • 负责人:
    朱焕章
  • 依托单位:
用于小鼠遗传操作的ФC31 重组酶系统的定向分子进化
  • 批准号:
    30470392
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    20.0万元
  • 批准年份:
    2004
  • 负责人:
    朱焕章
  • 依托单位:
Cre/loxP系统介导的时空表达HBs Ag的转基因小鼠的建立
  • 批准号:
    30170145
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    18.0万元
  • 批准年份:
    2001
  • 负责人:
    朱焕章
  • 依托单位:
国内基金
海外基金