活动性肺结核病新分子标志物lncRNA/T-UCRs的筛选、 鉴定及功能研究
批准号:
81772266
项目类别:
面上项目
资助金额:
56.0 万元
负责人:
李继承
依托单位:
学科分类:
H2605.分子生物学检验
结题年份:
2021
批准年份:
2017
项目状态:
已结题
项目参与者:
毛连根、李仲杰、陈钟梁、刘昌铭、屠慧惠、杨粟、陈静
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中文摘要
我国是肺结核病高发的国家,其防治最突出的难点是缺乏疾病特异性的诊断标志物。为此,迫切需要研究肺结核病分子标志物,建立快速、敏感、特异的肺结核病诊断新方法。课题组前期应用Solexa测序技术发现并验证了肺结核病的特异性miRNAs。lncRNA/T-UCRs和miRNA同属非编码RNA,已被证明在生物体内发挥重要作用。为此,本课题将采用lncRNA芯片技术筛选和鉴定肺结核病特异lncRNA/T-UCRs;经RT -PCR验证,建立肺结核病血浆lncRNA/T-UCRs早期诊断模型,检测模型的灵敏度、特异性;并在lncRNA/T-UCRs阳性表达的外周血免疫细胞中,研究与之相互作用的结合蛋白及下游靶基因,揭示lncRNA/T-UCRs功能。本课题对肺结核病早期诊断,控制肺结核病传播,降低肺结核病的发病率具有重要的意义,并为建立一种肺结核病早期临床诊断技术奠定实验依据。
英文摘要
China is a country with high incidence of pulmonary tuberculosis (TB). It is very difficult to prevent and treat TB due to the lack of disease-specific diagnostic markers. So, there is an urgent need to establish a rapid and sensitive new method for the diagnosis of TB. We previously found that serum miRNAs could serve as potential biomarkers for TB by Solexa sequencing. Considering that long non-coding RNAs (lncRNAs) are also a kind of RNAs, we screened and identified TB-specific lncRNA/T-UCRs in the plasma of TB patients using lncRNA chip methods, and established a model for early diagnosis of TB by qRT-RCR. The sensitivity and specificity of the diagnostic model were also evaluated. In order to reveal the function of MDR-TB-specific lncRNA/T-UCRs, we screened the binding proteins and downstream target genes in peripheral blood immune cells expressing lncRNA/T-UCRs. The study may play an important role in early diagnosis, dissemination control, and reducing morbidity of TB. It will also provide experimental basis for the establishment of an extensive and effective technique for early diagnosis of TB.
肺结核病是全球发病率和死亡率最高的疾病之一。然而,临床缺乏有效的肺结核病诊断方法。在本研究中,我们使用微阵列研究了血浆中的长链非编码RNA (lncRNA)以及lncRNA对结核病的潜在诊断价值,发现了163个上调的lncRNA和348个下调的lncRNA。GO、KEGG、CNC分析表明差异表达的 lncRNAs 的功能主要富集在调节α-β T细胞活化和T细胞受体信号通路。使用 RT-qPCR对四种差异表达的lncRNA,NR_038221、NR_003142、ENST00000570366和 ENST00000422183进行验证,发现NR_038221、NR_003142和 ENST00000570366 被上调,而 ENST00000422183 被下调。由四种lncRNA组成的诊断模型的曲线下面积(AUC)值为0.845(灵敏度=79.2%,特异性=75%)。我们进一步预测了可能与这些lncRNA相互作用的mRNA和miRNA,构建ceRNA网络。我们的研究揭示了lncRNA作为肺结核病早期诊断生物标志物的潜在价值,以及这些异常表达的lncRNA在肺结核病发病机制中的作用。此外,还获得了活动性肺结核病治愈患者的潜在血浆标志物:uc.48+和 NR_105053;联合 uc.48+和NR_105053建立疗效评价模型,使用ROC曲线评估其区分活动性肺结核病组和肺结核病治愈组的价值, 其灵敏度为90.00%,特异度为86.36%,曲线下面积(AUC)为0.945。同时,结果提示 uc.48+和 NR_105053可能通过调控相应靶基因,影响了巨噬细胞对抗MTB的能力,从而影响疾病的进程。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Elevated pulmonary tuberculosis biomarker miR-423-5p plays critical role in the occurrence of active TB by inhibiting autophagosome-lysosome fusion
肺结核生物标志物miR-423-5p升高,通过抑制自噬体-溶酶体融合,在活动性结核病的发生中发挥关键作用
DOI:10.1080/22221751.2019.1590129
发表时间:2019-03-22
期刊:EMERGING MICROBES & INFECTIONS
影响因子:13.2
作者:Tu, Huihui;Yang, Su;Li, Jicheng
通讯作者:Li, Jicheng
L-Histidine, arachidonic acid, biliverdin, and L-cysteine-glutathione disulfide as potential biomarkers for cured pulmonary tuberculosis
L-组氨酸、花生四烯酸、胆绿素和 L-半胱氨酸-谷胱甘肽二硫化物作为治愈肺结核的潜在生物标志物
DOI:10.1016/j.biopha.2019.108980
发表时间:2019
期刊:Biomedicine & Pharmacotherapy
影响因子:7.5
作者:Yi Wen Jing;Han Yu Shuai;Wei Li Liang;Shi Li Ying;Huang Huai;Jiang Ting Ting;Li Zhi Bin;Chen Jing;Hu Yu Ting;Tu Hui Hui;Li Ji Cheng
通讯作者:Li Ji Cheng
Identification of potential lipid biomarkers for active pulmonary tuberculosis using ultra-high-performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry
使用超高效液相色谱-串联质谱法鉴定活动性肺结核的潜在脂质生物标志物
DOI:10.1177/1535370220968058
发表时间:2021-02-01
期刊:EXPERIMENTAL BIOLOGY AND MEDICINE
影响因子:3.2
作者:Han, Yu-Shuai;Chen, Jia-Xi;Li, Ji-Cheng
通讯作者:Li, Ji-Cheng
Screening and identification of plasma lncRNAs uc.48+and NR_105053 as potential novel biomarkers for cured pulmonary tuberculosis
筛选和鉴定血浆lncRNA uc.48和NR_105053作为治愈肺结核的潜在新型生物标志物
DOI:10.1016/j.ijid.2020.01.005
发表时间:2020-03-01
期刊:INTERNATIONAL JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES
影响因子:8.4
作者:Li, Zhi-Bin;Han, Yu-Shuai;Li, Ji-Cheng
通讯作者:Li, Ji-Cheng
Screening and identification of potential protein biomarkers for evaluating the efficacy of intensive therapy in pulmonary tuberculosis
筛选和鉴定潜在的蛋白质生物标志物,用于评估肺结核强化治疗的疗效
DOI:10.1016/j.bbrc.2018.06.147
发表时间:2018-09-18
期刊:BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS
影响因子:3.1
作者:Jiang, Ting-Ting;Shi, Li-Ying;Li, Ji-Cheng
通讯作者:Li, Ji-Cheng
耐多药肺结核病中医证候血清蛋白质标志物的筛选、鉴定及功能研究
- 批准号:81573709
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:57.0万元
- 批准年份:2015
- 负责人:李继承
- 依托单位:
基于iTRAQ-2DLC-MS/MS的肺痨证候标志性血清蛋白质筛选与鉴定
- 批准号:81273882
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:70.0万元
- 批准年份:2012
- 负责人:李继承
- 依托单位:
肺结核证候分型血清蛋白质指纹图谱研究
- 批准号:81072724
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:34.0万元
- 批准年份:2010
- 负责人:李继承
- 依托单位:
基因修饰的栝蒌根天花粉蛋白选择性抗肿瘤作用及机制研究
- 批准号:30772854
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:10.0万元
- 批准年份:2007
- 负责人:李继承
- 依托单位:
卵巢淋巴孔发育和调控机理及生殖生理学意义
- 批准号:30470910
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:18.0万元
- 批准年份:2004
- 负责人:李继承
- 依托单位:
中药内源性NO淋巴孔调控和NO-cGMP/cGMP independent 途径研究
- 批准号:30371815
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:21.0万元
- 批准年份:2003
- 负责人:李继承
- 依托单位:
中药的腹膜淋巴孔调控机理和肝硬化腹水治疗的实验研究
- 批准号:39970934
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:14.0万元
- 批准年份:1999
- 负责人:李继承
- 依托单位:
人体腹膜淋巴孔的发育和NO对腹膜淋巴孔调控研究
- 批准号:39970381
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:14.0万元
- 批准年份:1999
- 负责人:李继承
- 依托单位:
脑膜淋巴孔的存在及其病理生理研究
- 批准号:39470704
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:5.0万元
- 批准年份:1994
- 负责人:李继承
- 依托单位:
人体心包淋巴孔和淋巴引流机制的研究
- 批准号:39370350
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:5.0万元
- 批准年份:1993
- 负责人:李继承
- 依托单位:
国内基金
海外基金















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