A novel SARS-CoV-2 related coronavirus in bats from Cambodia.
A novel SARS-CoV-2 related coronavirus in bats from Cambodia.
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DOI：
10.1038/s41467-021-26809-4
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发表时间：
2021-11-09
影响因子：
16.6
通讯作者：
Duong V
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Delaune D;Hul V;Karlsson EA;Hassanin A;Ou TP;Baidaliuk A;Gámbaro F;Prot M;Tu VT;Chea S;Keatts L;Mazet J;Johnson CK;Buchy P;Dussart P;Goldstein T;Simon-Lorière E;Duong V
有关导致持续COVID-19大流行的冠状病毒的起源和宿主的知识仍然不完整。迄今为止，在中国云南省的菊头蝠样本中检测到了与SARS-CoV-2最接近的亲属。在这里，我们描述了2010年在柬埔寨采样的两只沙氏菊头蝠中SARS-CoV-2相关冠状病毒的鉴定。宏基因组测序鉴定出与SARS-CoV-2具有92.6%核苷酸同一性的几乎相同的病毒。大多数基因组区域与SARS-CoV-2密切相关，除了刺突区域，该区域与人类ACE 2介导的进入不相容。在中国没有发现的蝙蝠物种中发现这些病毒表明SARS-CoV-2相关病毒的地理分布比以前报道的要广泛得多，并表明东南亚是未来冠状病毒监测的关键地区。在这项研究中，Delaune等人，从柬埔寨两个蝙蝠样本中分离并鉴定SARS-CoV-2相关冠状病毒。他们的研究结果表明，SARS-CoV-2相关病毒的地理分布比以前报道的更广泛。
Knowledge of the origin and reservoir of the coronavirus responsible for the ongoing COVID-19 pandemic is still fragmentary. To date, the closest relatives to SARS-CoV-2 have been detected in Rhinolophus bats sampled in the Yunnan province, China. Here we describe the identification of SARS-CoV-2 related coronaviruses in two Rhinolophus shameli bats sampled in Cambodia in 2010. Metagenomic sequencing identifies nearly identical viruses sharing 92.6% nucleotide identity with SARS-CoV-2. Most genomic regions are closely related to SARS-CoV-2, with the exception of a region of the spike, which is not compatible with human ACE2-mediated entry. The discovery of these viruses in a bat species not found in China indicates that SARS-CoV-2 related viruses have a much wider geographic distribution than previously reported, and suggests that Southeast Asia represents a key area to consider for future surveillance for coronaviruses. In this study, Delaune et al., isolate and characterise a SARS-CoV-2-related coronavirus from two bats sampled in Cambodia. Their findings suggest that the geographic distribution of SARS-CoV-2-related viruses is wider than previously reported.
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影响因子：
3.7
作者：
Lin XD;Wang W;Hao ZY;Wang ZX;Guo WP;Guan XQ;Wang MR;Wang HW;Zhou RH;Li MH;Tang GP;Wu J;Holmes EC;Zhang YZ
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Zhang YZ
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Hoang DT;Chernomor O;von Haeseler A;Minh BQ;Vinh LS
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作者：
Katoh K;Standley DM
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Standley DM
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Sabeti, Pardis C.
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作者：
Hassanin A;Tu VT;Curaudeau M;Csorba G
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