Design, analysis, development and experimental validation of genome comparison algorithms using the SeqAn library

根据计划，这两个主要的紧急情况都将发生。这是：（1）在现有模型的基础上，对所有基因组学研究的成果进行分析、实施和实验。(2)在生物信息学和算法工程中，集成优化算法组件，以验证核算法和数据结构。基因组韦尔登的正确性方法总是梅尔人惊讶的。这是一个很好的选择。这是一个非常有用的方法，它可以通过对基因组组装和基因组进化的分析来实现。在遗传学研究中，遗传学和实践实施的逻辑理论是通过对遗传学数据的分析而得出的。这篇文章的主要内容是两个主要的序列分析软件项目，以及用于分析大基因组数据的算法，以及用于生物信息学算法的开发、分析和实施的实验平台。

Unser Plan ist, die zwei Hauptziele des ursprünglichen Antrages weiter zu verfolgen. Diese sind: (1) Entwurf, Analyse, Implementierung und experimentelle Auswertung von effizienten und möglichst allgemein anwendbaren Algorithmen zum Genomvergleich, basierend auf geeigneten Modellen. (2) Die Integration aller benötigten algorithmischen Komponenten in die SeqAn Bibliothek zur biologischen Sequenzanalyse zur Verbreitung der Kernalgorithmen und -datenstrukturen in der Bioinformatik und dem Algorithm Engineering. Methoden zum Vergleich von Genomen werden mit immer mehr verfügbaren genomischen Sequenzen wichtiger als jemals zuvor. Es gibt zahlreiche Anwendungen. Diese reichen vom Vergleich verschiedener Genomassemblies und phylogenetischen Studien bis zu Analysen zur Beantwortung grunds¨ atzlicher Fragen zur Funktionsweise von Genomevolution. Im Bereich der Algorithmen zum Genomvergleich ist die Lücke zwischen Theorie der Algorithmik und der praktischen Implementierung durch den beispiellosen Anstieg der Menge der verfügbaren genomischen Daten besonders stark zu erkennen. Um diese Lücke zu schließen, ist das zweite Ziel dieses Projektes die SeqAn Softwarebibliothek zu erweitern, um die algorithmischen Komponenten zur Analyse großer genomischer Datenmengen bereit zu stellen und als experimentelle Plattform für Entwurf, Analyse und Implementierung von Bioinformatikalgorithmen auf dem aktuellen Stand der Forschung zu dienen.