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Varianzkomponentenbasierte Verfahren zur simultanen Kartierung gekoppelter QTL mit epistatischen Effekten und linienspezifischen Markern

Varianzkomponentenbasierte Verfahren zur simultanen Kartierung gekoppelter QTL mit epistatischen Effekten und linienspezifischen Markern
基于方差成分的方法,用于同时定位具有上位效应和谱系特异性标记的连锁 QTL
批准号:
35530980
负责人:
Privatdozent Dr. Manfred Mayer
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2007
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2006-12-31 至 2010-12-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
多重区间作图法是F2代或Rückkreuzungspopulationen试验中多重QTL定位的参考方法。理论能力和模拟研究表明,研究技术比传统方法更先进,如Z.B.回归区间作图,在回归区间作图中,研究了排斥问题中的多个QTL和多个QTL,并对QTL参数的选择进行了讨论。在人类学中,在第三章中的外交叉人口数据中,方法相对于简单而灵活,并具有一定的灵活性。在这一研究中,我们必须找到一种方法,即在韦尔登进行线性特异性标记的QTL分析时,采用不同的成分基础方法。Dabei soll ein Schwerpunkt auch auf die Berücksichtigung nichtaddiver Geneffekte(Dominanz,vor allem aber auch Epistasie)gelegt韦尔登.通过开发一种用于建立QTL分析韦尔登模型的方法工具,解决了在基因组扩增中不能确定和不能确定QTL-等位基因多重性的问题。Die Eigenschaften des entwickelten Instrumentariums韦尔登ergänzend durch Simulationsuntersuchungen geprüft und verglichen.
英文摘要
Die multiple Intervallkartierung (multiple interval mapping) ist die Referenzmethode bei der Kartierung multipler QTL in experimentellen F2- oder Rückkreuzungspopulationen. Theoretische Ableitungen und Simulationsstudien haben gezeigt, dass rechentechnisch weniger aufwendige Methoden, wie z.B. regression interval mapping, insbesondere bei gekoppelten QTL und bei QTL in Repulsion problematisch in Bezug auf die Trennschärfe und die Genauigkeit der Schätzung von QTL-Parametern sein können. In der Humangenetik sowie bei Daten von Outcrosspopulationen in der Tierzucht sind varianzkomponentenbasierte Methoden relativ weit verbreitet und stellen einen sehr flexiblen und mächtigen methodischen Ansatz dar. In dem vorliegenden Forschungsantrag sollen daher die methodischen Voraussetzungen zur Anwendung varianzkomponentenbasierter Methoden für die QTL-Analyse bei linienspezifischen Markern in den Ausgangspopulationen erarbeitet werden. Dabei soll ein Schwerpunkt auch auf die Berücksichtigung nichtadditiver Geneffekte (Dominanz, vor allem aber auch Epistasie) gelegt werden. Die Problematik des eventuellen Vorhandenseins nichtfixierter und möglicherweise multipler QTL-Allele in den Ausgangspopulationen soll durch die Entwicklung eines methodischen Instrumentariums für Founder-QTL-Modelle angegangen werden. Die Eigenschaften des entwickelten Instrumentariums werden ergänzend durch Simulationsuntersuchungen geprüft und verglichen.
期刊论文(1)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1534/genetics.110.122333
发表时间: 2011-01
期刊: Genetics
影响因子: 3.3
作者: [D. Zimmer;M. Mayer;N. Reinsch]
通讯作者: D. Zimmer;M. Mayer;N. Reinsch
Segregations- und Kopplungsanalysen bei komplexen genetischen Modellen und Familienstrukturen
  • 批准号:
    5177268
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    1999
  • 负责人:
    Privatdozent Dr. Manfred Mayer
  • 依托单位:
海外基金