Entwicklung eines Protein-Protein-Docking-Algorithmus und Anwendungen des Algorithmus bei der Struktur-Funktions-Analyse von Protein-Komplexen

Der Forschungsgegenstand des Projekts ist die Entwicklung and implementiung von algorithm for the protein - protein - docking - problem, das wilt folt definiert werden kann: Gegeben seien die 3D-Strukturen zweier protein A and B. Berechne die 3D-Struktur des protein - complexes AB. in Rahmen des Projekts werden wir am MPI in saarbricken entwickelten Algorithmus weiterentwickeln, ausbauen and durch die interdisziplinäre Zusammenarbeit in Der Praxis unteren Bedingungen testen。Wir werden neue Ansätze zur Berechnung der KonformationsFlexibilität untersuchen和neue Verfahren zur Berechnung der freien bindungenergie implementieren。连接算法与核磁共振的组合/Röntgendiffraktion werden wir versuchen den Prozeß der Strukturaufklärung f<s:2> r蛋白复合物zu beschleunigen。Ferner werden与unsering对接- verfahren beder研究了这种抑制物对Leitstrukturen蛋白复合物的抑制作用。生物化学算法库（生物化学算法库）的集成和分析。

Der Forschungsgegenstand des Projekts ist die Entwicklung und Implementierung von Algorithmen für das Protein-ProteinDocking-Problem, das wie folgt definiert werden kann: Gegeben seien die 3D-Strukturen zweier Proteine A und B. Berechne die 3D-Struktur des Protein-Komplexes AB. Im Rahmen des Projekts werden wir den am MPI in Saarbrücken entwickelten Algorithmus weiterentwickeln, ausbauen und durch die interdisziplinäre Zusammenarbeit in der Praxis unter realen Bedingungen testen. Wir werden neue Ansätze zur Berücksichtigung der KonformationsFlexibilität untersuchen und neue Verfahren zur Berechnung der freien Bindungsenergie implementieren. Durch die Kombination von Docking-Algorithmen und NMR/Röntgendiffraktion werden wir versuchen den Prozeß der Strukturaufklärung für Protein-Komplexe zu beschleunigen. Ferner werden wir unsere Docking-Verfahren bei der Suche nach inhibitorischen Leitstrukturen für Protein-Komplexe einsetzen. Die neuen Verfahren werden in die am MPI in Saarbrücken entwickelte C++-Software Bibliothek BALL (Biochemical Algorithms Library) integriert und auf diesem Weg der Allgemeinheit zur Verfügung gestellt.